More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1092 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1092  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
351 aa  702    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0880  alcohol dehydrogenase  56.25 
 
 
351 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.173388  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0784  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.85 
 
 
353 aa  342  4e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2959  alcohol dehydrogenase  48.44 
 
 
373 aa  327  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  49.72 
 
 
350 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  49.72 
 
 
350 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  49.72 
 
 
350 aa  325  9e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  49.15 
 
 
350 aa  323  3e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  49.15 
 
 
350 aa  323  3e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  49.15 
 
 
350 aa  323  3e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  49.15 
 
 
350 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  47.01 
 
 
350 aa  322  5e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  48.86 
 
 
350 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  48.86 
 
 
350 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  48.86 
 
 
350 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07590  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  48.44 
 
 
357 aa  311  2e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2380  alcohol dehydrogenase  48.73 
 
 
354 aa  306  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.209062 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  46.18 
 
 
354 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  45.89 
 
 
365 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  45.89 
 
 
354 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.89 
 
 
354 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  45.61 
 
 
354 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  45.85 
 
 
364 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  45.04 
 
 
354 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2069  alcohol dehydrogenase  47.88 
 
 
352 aa  300  3e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0049  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.31 
 
 
350 aa  297  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  43.34 
 
 
363 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  43.63 
 
 
363 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3625  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.02 
 
 
358 aa  290  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00723934  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.88 
 
 
350 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02158  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_2G15930)  43.18 
 
 
353 aa  289  6e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.953823  normal  0.515496 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  43.34 
 
 
362 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0125  alcohol dehydrogenase  45.04 
 
 
350 aa  287  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0844378  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  43.34 
 
 
362 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  43.06 
 
 
360 aa  286  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  43.06 
 
 
362 aa  285  7e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0788  alcohol dehydrogenase  44.48 
 
 
349 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3324  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.73 
 
 
350 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0421123  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1043  alcohol dehydrogenase  45.07 
 
 
353 aa  277  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  43.5 
 
 
355 aa  275  6e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00599  conserved hypothetical protein  42.78 
 
 
369 aa  271  1e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.932146  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  39.94 
 
 
373 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  40.17 
 
 
373 aa  256  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  39.66 
 
 
373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  39.72 
 
 
352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  39.66 
 
 
373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.11 
 
 
373 aa  249  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  39.06 
 
 
373 aa  249  7e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09288  conserved hypothetical protein  36.49 
 
 
382 aa  248  8e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74116  Sorbitol dehydrogenase  39.52 
 
 
378 aa  243  5e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.145167 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.67 
 
 
356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.189858  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89701  polyol dehydrogenase  37.57 
 
 
385 aa  239  4e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3142  alcohol dehydrogenase  39.61 
 
 
373 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1000  putative alcohol dehydrogenase  38.59 
 
 
352 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2032  sorbitol dehydrogenase, putative  39.27 
 
 
350 aa  229  7e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000906358  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0357  zinc-dependent dehydrogenase  39.32 
 
 
349 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3248  sorbitol dehydrogenase  37.29 
 
 
340 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0582225  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3661  alcohol dehydrogenase  37.71 
 
 
340 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0745  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  35.93 
 
 
360 aa  211  1e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1010  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.85 
 
 
340 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4040  alcohol dehydrogenase  37.46 
 
 
356 aa  210  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0364126 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0739  zinc-containing alcohol dehydrogenase; sorbitol dehydrogenase (L-iditol 2-dehydrogenase)  37.57 
 
 
340 aa  209  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.725171  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0638  alcohol dehydrogenase  37.85 
 
 
343 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1668  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.85 
 
 
343 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1641  alcohol dehydrogenase  37.85 
 
 
343 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0556  alcohol dehydrogenase  37.85 
 
 
343 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46957  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0912  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  36.65 
 
 
349 aa  204  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00151014  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1692  alcohol dehydrogenase  37.85 
 
 
343 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0527  alcohol dehydrogenase  37.85 
 
 
343 aa  203  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361888  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5456  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.57 
 
 
343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.077084  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5853  alcohol dehydrogenase  37.57 
 
 
343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00833857  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1619  alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 
341 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1644  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 
341 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2235  alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 
341 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0660  alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 
341 aa  195  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0565  alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 
341 aa  195  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678248  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1670  alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 
341 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5628  L-threonine 3-dehydrogenase  32.77 
 
 
341 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0490  alcohol dehydrogenase  32.77 
 
 
341 aa  194  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283915  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4980  alcohol dehydrogenase  35.77 
 
 
357 aa  192  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.155342 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7649  zinc-binding dehydrogenase  33.98 
 
 
357 aa  190  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.298467  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  34.18 
 
 
348 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3841  alcohol dehydrogenase  39.74 
 
 
350 aa  179  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.506956 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2217  alcohol dehydrogenase  34.73 
 
 
357 aa  178  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2976  alcohol dehydrogenase  34.73 
 
 
358 aa  177  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4034  alcohol dehydrogenase  35.75 
 
 
357 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5447  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.81 
 
 
350 aa  177  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187392  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2551  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.08 
 
 
341 aa  176  7e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163607  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  34.83 
 
 
338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.84 
 
 
344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.81 
 
 
341 aa  172  6.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
345 aa  172  9e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.81 
 
 
342 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1489  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.21 
 
 
373 aa  170  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.434256  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  34.33 
 
 
344 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  33.33 
 
 
342 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.23 
 
 
336 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2445  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.58 
 
 
347 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.682207  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.17 
 
 
341 aa  166  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2059  sorbitol dehydrogenase  34.21 
 
 
347 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  hitchhiker  0.0031409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>