More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2551 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_2551  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  100 
 
 
341 aa  698    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163607  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  71.3 
 
 
338 aa  513  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3592  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.49 
 
 
347 aa  293  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167683  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4950  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.13 
 
 
347 aa  285  7e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1794  alcohol dehydrogenase  39.5 
 
 
343 aa  219  7e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0373035  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0788  alcohol dehydrogenase  34.19 
 
 
349 aa  199  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0125  alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 
350 aa  196  7e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0844378  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.59 
 
 
340 aa  188  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0239  alcohol dehydrogenase  32.04 
 
 
351 aa  185  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0233  alcohol dehydrogenase  32.04 
 
 
351 aa  185  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02158  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_2G15930)  34.57 
 
 
353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.953823  normal  0.515496 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2013  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.47 
 
 
344 aa  180  4e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.238084  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
340 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  36.36 
 
 
364 aa  179  8e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.55 
 
 
344 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.45 
 
 
354 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.04 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  36.04 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  36.04 
 
 
365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4479  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.44 
 
 
347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.522798  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  32.19 
 
 
352 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  36.04 
 
 
354 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0880  alcohol dehydrogenase  36.23 
 
 
351 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.173388  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3903  alcohol dehydrogenase  34.6 
 
 
338 aa  172  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.72 
 
 
356 aa  172  7.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.189858  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
345 aa  172  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.29 
 
 
347 aa  171  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 
354 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  33.99 
 
 
350 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  30.95 
 
 
327 aa  170  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1619  alcohol dehydrogenase  35.57 
 
 
341 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0660  alcohol dehydrogenase  35.57 
 
 
341 aa  169  7e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.55 
 
 
337 aa  169  7e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0565  alcohol dehydrogenase  35.57 
 
 
341 aa  169  7e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678248  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1644  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.57 
 
 
341 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2235  alcohol dehydrogenase  35.57 
 
 
341 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1670  alcohol dehydrogenase  35.57 
 
 
341 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  33.76 
 
 
341 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3875  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.21 
 
 
344 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.177678  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
341 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
341 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0490  alcohol dehydrogenase  35.23 
 
 
341 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283915  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
341 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5628  L-threonine 3-dehydrogenase  35.23 
 
 
341 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  33.12 
 
 
341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4706  alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 
341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1736  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.43 
 
 
349 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.75 
 
 
350 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  36.75 
 
 
350 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  36.75 
 
 
350 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  30.61 
 
 
356 aa  166  5.9999999999999996e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0021  Zn-binding dehydrogenase  32.15 
 
 
352 aa  166  6.9999999999999995e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0554419  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3545  alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
345 aa  165  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.715464  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  32.09 
 
 
359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  36.75 
 
 
350 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.75 
 
 
350 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  36.75 
 
 
350 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  36.75 
 
 
350 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  36.75 
 
 
350 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  34.33 
 
 
362 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  36.75 
 
 
350 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  36.75 
 
 
350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1092  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.08 
 
 
351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2959  alcohol dehydrogenase  34.04 
 
 
373 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0049  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.29 
 
 
350 aa  164  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0784  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.16 
 
 
353 aa  164  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0154  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.68 
 
 
339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186872  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2445  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.18 
 
 
347 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.682207  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  32.4 
 
 
336 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  33.23 
 
 
363 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  34 
 
 
362 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.29 
 
 
350 aa  162  9e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  33.77 
 
 
363 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  33.67 
 
 
362 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  34.07 
 
 
322 aa  161  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.860675 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.92 
 
 
373 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.34 
 
 
338 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0329198 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.23 
 
 
323 aa  159  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  32.71 
 
 
360 aa  159  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1223  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
335 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135954  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0745  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  31.01 
 
 
360 aa  158  1e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.82 
 
 
373 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1614  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.99 
 
 
338 aa  157  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000216473  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  31.82 
 
 
373 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  31.82 
 
 
373 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5476  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.75 
 
 
335 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1249  alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
335 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257646  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.06 
 
 
341 aa  157  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3324  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.76 
 
 
344 aa  157  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000796968  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3944  L-threonine 3-dehydrogenase  31.63 
 
 
342 aa  157  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.97 
 
 
341 aa  156  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.51 
 
 
336 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.48 
 
 
346 aa  155  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6469  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.59 
 
 
345 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6704  alcohol dehydrogenase  32.59 
 
 
345 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710863  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1915  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.48 
 
 
349 aa  155  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.482777  normal  0.264492 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3746  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.87 
 
 
349 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427157  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  31.73 
 
 
373 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2784  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.6 
 
 
342 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.551512  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2828  alcohol dehydrogenase  32.6 
 
 
343 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155527  normal  0.0877096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>