More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1258 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
344 aa  674    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.39 
 
 
336 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.92 
 
 
336 aa  358  8e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  41.72 
 
 
336 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0537  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.01 
 
 
325 aa  238  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00294504  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0685  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.73 
 
 
338 aa  225  9e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  36.07 
 
 
337 aa  222  7e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0953  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.5 
 
 
336 aa  216  7e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00776384  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1780  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  34.37 
 
 
337 aa  210  3e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.1 
 
 
329 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  35.34 
 
 
345 aa  203  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  35.12 
 
 
350 aa  200  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.96 
 
 
335 aa  197  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1707  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  33.02 
 
 
336 aa  192  6e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.508276  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.67 
 
 
333 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1823  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
350 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00496203  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1804  alcohol dehydrogenase  34.67 
 
 
349 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.58 
 
 
351 aa  190  4e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  33.33 
 
 
339 aa  189  5e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0614  alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 
318 aa  188  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0116847  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.61 
 
 
346 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0603  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  32.61 
 
 
338 aa  187  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000710686  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0633  alcohol dehydrogenase  32.53 
 
 
317 aa  186  4e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1860  alcohol dehydrogenase  32.4 
 
 
336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.710452  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06260  zinc-binding dehydrogenase, putative  30.52 
 
 
349 aa  182  8.000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.040279  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  31.16 
 
 
327 aa  182  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5447  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.01 
 
 
350 aa  179  7e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187392  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.94 
 
 
338 aa  178  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1589  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.8 
 
 
341 aa  178  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2145  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  36.21 
 
 
346 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552645  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00443  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04620)  30.52 
 
 
348 aa  177  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.14 
 
 
346 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2220  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.06 
 
 
343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.135715 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4221  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.05 
 
 
346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.41128  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1696  threonine dehydrogenase  32.3 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000265476  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  31.58 
 
 
373 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
354 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
354 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2013  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.04 
 
 
344 aa  172  5e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.238084  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.58 
 
 
373 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  31.58 
 
 
373 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.07 
 
 
354 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0293  L-threonine 3-dehydrogenase  34.36 
 
 
347 aa  172  9e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  31.58 
 
 
373 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  34.42 
 
 
354 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.91 
 
 
356 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.189858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  34.42 
 
 
365 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.42 
 
 
354 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.93 
 
 
344 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120973 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0619  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.46 
 
 
339 aa  170  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.13 
 
 
373 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0449  L-threonine 3-dehydrogenase  32.52 
 
 
361 aa  169  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1530  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.68 
 
 
367 aa  169  8e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540116  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  32.14 
 
 
373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00067  L-threonine 3-dehydrogenase  32.32 
 
 
341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 
348 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  32.59 
 
 
352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.34 
 
 
350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.34 
 
 
350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0049  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.71 
 
 
350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4509  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.6 
 
 
343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  32.94 
 
 
362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.29 
 
 
352 aa  164  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3405  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.12 
 
 
348 aa  164  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0198026  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.84 
 
 
350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.34 
 
 
350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.84 
 
 
350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  34.34 
 
 
350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  34.34 
 
 
350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2811  alcohol dehydrogenase  36.81 
 
 
347 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133999  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  33.84 
 
 
350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  34.34 
 
 
350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  32.64 
 
 
362 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  32.05 
 
 
360 aa  163  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.34 
 
 
350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0201  L-threonine 3-dehydrogenase  30.45 
 
 
342 aa  163  5.0000000000000005e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3256  alcohol dehydrogenase  32.47 
 
 
345 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  34.36 
 
 
364 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  32.48 
 
 
341 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1995  L-threonine 3-dehydrogenase  30.45 
 
 
348 aa  163  5.0000000000000005e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.271324  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4840  alcohol dehydrogenase  32.74 
 
 
330 aa  163  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3450  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  32.85 
 
 
347 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  30.3 
 
 
348 aa  162  7e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4341  L-threonine 3-dehydrogenase  31.5 
 
 
341 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1614  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.62 
 
 
338 aa  162  9e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000216473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0241  alcohol dehydrogenase  36.08 
 
 
347 aa  161  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2700  L-threonine 3-dehydrogenase  31.65 
 
 
345 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0235  alcohol dehydrogenase  36.08 
 
 
347 aa  161  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  32.83 
 
 
363 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2784  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.28 
 
 
342 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.551512  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0062  L-threonine 3-dehydrogenase  30.52 
 
 
340 aa  161  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4286  L-threonine 3-dehydrogenase  31.5 
 
 
341 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588728 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  32.95 
 
 
346 aa  162  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2828  alcohol dehydrogenase  36.28 
 
 
343 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155527  normal  0.0877096 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  31.5 
 
 
341 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  31.5 
 
 
341 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  31.5 
 
 
341 aa  161  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0444  L-threonine 3-dehydrogenase  32.31 
 
 
344 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2958  L-threonine 3-dehydrogenase  31.71 
 
 
345 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108215  normal  0.634974 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2463  alcohol dehydrogenase  32.66 
 
 
338 aa  161  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>