More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3010 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  100 
 
 
341 aa  652    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0807  alcohol dehydrogenase  42.98 
 
 
346 aa  239  5.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0463124 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  40.71 
 
 
337 aa  239  6.999999999999999e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4454  alcohol dehydrogenase  42.4 
 
 
345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0619  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.43 
 
 
339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  38.95 
 
 
363 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  37.57 
 
 
363 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  36.49 
 
 
345 aa  193  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.22 
 
 
346 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4509  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.71 
 
 
343 aa  189  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0125  alcohol dehydrogenase  38.26 
 
 
350 aa  189  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0844378  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  34.46 
 
 
336 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0788  alcohol dehydrogenase  36.86 
 
 
349 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6089  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.63 
 
 
337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.13 
 
 
354 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  36.13 
 
 
365 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  35.57 
 
 
354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  35.85 
 
 
354 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
364 aa  182  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  36.97 
 
 
355 aa  182  8.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  36.59 
 
 
327 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  35.01 
 
 
354 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  36.19 
 
 
360 aa  180  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.29 
 
 
354 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  35.57 
 
 
362 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  35.57 
 
 
362 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 
362 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1589  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.65 
 
 
341 aa  175  8e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.24 
 
 
373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  40.14 
 
 
373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  40.14 
 
 
373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1043  alcohol dehydrogenase  34.65 
 
 
353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.5 
 
 
337 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  39.78 
 
 
373 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  34.04 
 
 
338 aa  171  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  38.82 
 
 
373 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0771  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
333 aa  170  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0359  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.4 
 
 
329 aa  169  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.30751  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  37.66 
 
 
373 aa  169  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1860  alcohol dehydrogenase  34.28 
 
 
336 aa  168  1e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.710452  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  33.56 
 
 
350 aa  167  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1400  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.73 
 
 
328 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00260495 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1736  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.1 
 
 
349 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.86 
 
 
336 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  36.72 
 
 
352 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.45 
 
 
350 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  34.45 
 
 
350 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  34.45 
 
 
350 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0351  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.89 
 
 
357 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1696  threonine dehydrogenase  32.59 
 
 
334 aa  160  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000265476  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.45 
 
 
350 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  34.45 
 
 
350 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.11 
 
 
350 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0698  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.76 
 
 
349 aa  159  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  34.11 
 
 
350 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.11 
 
 
350 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2811  alcohol dehydrogenase  38.32 
 
 
347 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133999  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.78 
 
 
350 aa  159  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.78 
 
 
350 aa  159  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2828  alcohol dehydrogenase  38.32 
 
 
343 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155527  normal  0.0877096 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2784  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  39.47 
 
 
342 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.551512  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.94 
 
 
335 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1714  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.43 
 
 
352 aa  158  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.44 
 
 
323 aa  158  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.18 
 
 
338 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0329198 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  34.5 
 
 
348 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0603  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  30.53 
 
 
338 aa  157  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000710686  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0780  L-threonine 3-dehydrogenase  31.79 
 
 
348 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  34.48 
 
 
339 aa  157  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2551  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.06 
 
 
341 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163607  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 
347 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.21 
 
 
342 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4187  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.08 
 
 
335 aa  156  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.4 
 
 
344 aa  156  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120973 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1707  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  31.31 
 
 
336 aa  156  6e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.508276  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.87 
 
 
350 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1092  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.71 
 
 
351 aa  156  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0607  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  39.18 
 
 
324 aa  155  7e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420026  normal  0.0271059 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.2 
 
 
336 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1933  putative dehydrogenase  32.24 
 
 
339 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121666  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3142  alcohol dehydrogenase  37.97 
 
 
373 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.48 
 
 
344 aa  155  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1044  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.43 
 
 
335 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2059  sorbitol dehydrogenase  32.66 
 
 
347 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  hitchhiker  0.0031409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0154  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.5 
 
 
339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186872  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.43 
 
 
340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5447  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.86 
 
 
350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187392  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  34.01 
 
 
346 aa  153  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.21 
 
 
351 aa  153  5e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3875  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.74 
 
 
344 aa  152  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.177678  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.42 
 
 
346 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01743  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  32.84 
 
 
347 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.84 
 
 
347 aa  152  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0685  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.13 
 
 
338 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01731  hypothetical protein  32.84 
 
 
347 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1780  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  29.51 
 
 
337 aa  152  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.08 
 
 
338 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1218  alcohol dehydrogenase  31.01 
 
 
361 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852101  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  34.08 
 
 
344 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>