More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2286 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2286  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
344 aa  702    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16590  xylitol dehydrogenase, zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  58.65 
 
 
346 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3810  alcohol dehydrogenase  54.36 
 
 
348 aa  404  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0863215  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0252  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  54.39 
 
 
347 aa  394  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1176  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  56.4 
 
 
344 aa  394  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136787  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6746  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.65 
 
 
347 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270529  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20290  xylitol dehydrogeanse  57.02 
 
 
347 aa  391  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.92253  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6662  alcohol dehydrogenase  55.81 
 
 
344 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.838814  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0234  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  55.23 
 
 
344 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0551  D-xylulose reductase  59.06 
 
 
347 aa  386  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2609  zinc-binding alcohol dehydrogenase  55.23 
 
 
348 aa  385  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1653  putative D-xylulose reductase  55.23 
 
 
344 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5833  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.78 
 
 
347 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.119386  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0351  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  55.23 
 
 
344 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.773676  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0849  alcohol dehydrogenase  53.51 
 
 
344 aa  381  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0438742 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1742  D-xylulose reductase  55.23 
 
 
344 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.247806  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1076  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  55.23 
 
 
344 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444364  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3068  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  54.36 
 
 
344 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2341  alcohol dehydrogenase  53.64 
 
 
348 aa  383  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.231034 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1235  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  55.23 
 
 
344 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2163  alcohol dehydrogenase  55.69 
 
 
345 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0068  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  55.23 
 
 
344 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.493904  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5063  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  53.49 
 
 
344 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.392538  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5797  alcohol dehydrogenase  53.49 
 
 
344 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202299  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4382  alcohol dehydrogenase  53.49 
 
 
344 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3230  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.43 
 
 
346 aa  377  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.282549  normal  0.671349 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15800  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  49.85 
 
 
343 aa  358  7e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.109123  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3580  hypothetical protein  50.86 
 
 
350 aa  353  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.885973 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1700  threonine dehydrogenase  47.51 
 
 
346 aa  325  7e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.333284  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.79 
 
 
346 aa  252  6e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2864  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  39.94 
 
 
359 aa  235  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.06 
 
 
333 aa  231  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  37.69 
 
 
359 aa  230  3e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  37.86 
 
 
348 aa  230  3e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.42 
 
 
342 aa  228  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.46 
 
 
356 aa  222  8e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  36.96 
 
 
583 aa  218  1e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2013  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.19 
 
 
344 aa  218  1e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.238084  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1714  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.89 
 
 
352 aa  218  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  37.5 
 
 
342 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86924  D-xylulose reductase (Xylitol dehydrogenase) (XDH)  37.54 
 
 
363 aa  214  9.999999999999999e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01743  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  36.94 
 
 
347 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.94 
 
 
347 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01731  hypothetical protein  36.94 
 
 
347 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2059  sorbitol dehydrogenase  36.84 
 
 
347 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  hitchhiker  0.0031409 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3219  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.96 
 
 
347 aa  213  5.999999999999999e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2498  sorbitol dehydrogenase  36.64 
 
 
347 aa  211  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503095  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2445  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.25 
 
 
347 aa  211  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.682207  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1998  sorbitol dehydrogenase  36.64 
 
 
347 aa  211  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.329256  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1858  alcohol dehydrogenase  36.64 
 
 
347 aa  211  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.368595  hitchhiker  0.0000214432 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.26 
 
 
352 aa  210  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1417  sorbitol dehydrogenase  36.53 
 
 
347 aa  209  5e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28190  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  34.6 
 
 
345 aa  199  7e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2813  alcohol dehydrogenase  34.88 
 
 
341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0594163  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2786  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.59 
 
 
341 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2830  alcohol dehydrogenase  34.59 
 
 
341 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.782331  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02880  L-iditol 2-dehydrogenase, putative  32.51 
 
 
400 aa  193  3e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1455  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.53 
 
 
351 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.124496 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00942  hypothetical protein similar to L-arabitol dehydrogenase (Eurofung)  33.14 
 
 
386 aa  190  2.9999999999999997e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00100  L-arabinitol 4-dehydrogenase, putative  33.23 
 
 
392 aa  186  6e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.603371  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02960  L-arabinitol 4-dehydrogenase, putative  32.52 
 
 
392 aa  183  3e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01050  sorbitol dehydrogenase, putative  34.86 
 
 
379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917438  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02666  sorbitol/xylitol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02000)  34.74 
 
 
373 aa  177  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01090  xylitol dehydrogenase, putative  32.86 
 
 
375 aa  177  2e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  31.73 
 
 
373 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.73 
 
 
373 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4509  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.92 
 
 
343 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  31.73 
 
 
373 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04336  L-arabinitol 4-dehydrogenase (AFU_orthologue; AFUA_1G11020)  33.23 
 
 
427 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.31 
 
 
373 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08552  alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01490)  34.34 
 
 
363 aa  162  6e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.580046 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3621  alcohol dehydrogenase  32.43 
 
 
347 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  31.69 
 
 
340 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.29 
 
 
350 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  32.29 
 
 
350 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.29 
 
 
350 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  32.29 
 
 
350 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  32.29 
 
 
350 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3661  alcohol dehydrogenase  30.43 
 
 
340 aa  158  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.29 
 
 
350 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  30.4 
 
 
373 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.29 
 
 
350 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00774  zinc-dependent alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14390)  31.83 
 
 
400 aa  157  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  29.75 
 
 
373 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3248  sorbitol dehydrogenase  29.86 
 
 
340 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0582225  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1010  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.5 
 
 
340 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32 
 
 
350 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  32 
 
 
350 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32 
 
 
350 aa  156  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3565  alcohol dehydrogenase  32.94 
 
 
345 aa  155  8e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0739  zinc-containing alcohol dehydrogenase; sorbitol dehydrogenase (L-iditol 2-dehydrogenase)  30.92 
 
 
340 aa  155  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.725171  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5333  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.31 
 
 
345 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0397204  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2124  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  33.04 
 
 
343 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  30.57 
 
 
350 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0108  alcohol dehydrogenase  30.06 
 
 
338 aa  153  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.476377  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0049  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.41 
 
 
350 aa  153  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4289  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.72 
 
 
360 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2032  sorbitol dehydrogenase, putative  29.94 
 
 
350 aa  151  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000906358  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6416  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.5 
 
 
343 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124082  normal  0.304265 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.23 
 
 
350 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>