More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0108 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0108  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 338 aa  655    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.476377  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3271  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.86 
 
 		 336 aa  365  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0405628 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3054  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.27 
 
 		 347 aa  224  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.680504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1659  alcohol dehydrogenase  40.65 
 
 		 339 aa  205  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.741659  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.16 
 
 		 346 aa  188  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2864  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.37 
 
 		 359 aa  187  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28190  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  38.44 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.01 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5063  alcohol dehydrogenase  38.67 
 
 		 347 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.724577  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2813  alcohol dehydrogenase  38.05 
 
 		 341 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0594163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.69 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  35.02 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2786  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.42 
 
 		 341 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2830  alcohol dehydrogenase  37.42 
 
 		 341 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.782331  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  33.54 
 
 		 348 aa  175  9e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1714  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.78 
 
 		 352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  38.3 
 
 		 342 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2013  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.16 
 
 		 344 aa  166  5e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.238084  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0948  putative L-idonate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  36.87 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4341  L-threonine 3-dehydrogenase  31.4 
 
 		 341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  31.4 
 
 		 341 aa  160  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  31.1 
 
 		 341 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4086  L-threonine 3-dehydrogenase  33.03 
 
 		 343 aa  161  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  31.4 
 
 		 341 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4286  L-threonine 3-dehydrogenase  31.1 
 
 		 341 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000588728 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1455  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.14 
 
 		 351 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  31.9 
 
 		 343 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  31.1 
 
 		 341 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3901  L-threonine 3-dehydrogenase  31.4 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00409651  normal  0.55097 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4105  L-threonine 3-dehydrogenase  31.4 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287848  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0100  L-threonine 3-dehydrogenase  32.17 
 
 		 341 aa  160  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.173553 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  30.79 
 
 		 341 aa  160  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5333  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.05 
 
 		 345 aa  160  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0397204  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6416  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.53 
 
 		 343 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124082  normal  0.304265 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.38 
 
 		 333 aa  159  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  33.75 
 
 		 583 aa  159  8e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4033  L-threonine 3-dehydrogenase  33.23 
 
 		 341 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4094  L-threonine 3-dehydrogenase  33.23 
 
 		 341 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3926  L-threonine 3-dehydrogenase  33.23 
 
 		 341 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4771  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.97 
 
 		 344 aa  159  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107599 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3988  L-threonine 3-dehydrogenase  33.23 
 
 		 341 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3907  L-threonine 3-dehydrogenase  33.23 
 
 		 341 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3616  L-threonine 3-dehydrogenase  31.4 
 
 		 342 aa  159  9e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00121447  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20290  xylitol dehydrogeanse  35.61 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.92253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0089  L-threonine 3-dehydrogenase  32.93 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3953  L-threonine 3-dehydrogenase  32.62 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0503034  normal  0.824331 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1783  L-threonine 3-dehydrogenase  35.31 
 
 		 345 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2095  L-threonine 3-dehydrogenase  35.94 
 
 		 345 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1862  L-threonine 3-dehydrogenase  35.31 
 
 		 345 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4989  L-threonine 3-dehydrogenase  31.58 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.014  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03474  L-threonine 3-dehydrogenase  32.62 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0601715  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0092  L-threonine 3-dehydrogenase  32.62 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.212636  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03425  hypothetical protein  32.62 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  31.53 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3828  L-threonine 3-dehydrogenase  32.62 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4044  L-threonine 3-dehydrogenase  32.62 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0175  L-threonine 3-dehydrogenase  33.02 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348381  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  32.8 
 
 		 341 aa  156  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1548  alcohol dehydrogenase  30.03 
 
 		 350 aa  156  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0106468  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2124  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  35.17 
 
 		 343 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15800  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  34.25 
 
 		 343 aa  156  6e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.109123  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3565  alcohol dehydrogenase  32.74 
 
 		 345 aa  156  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16590  xylitol dehydrogenase, zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  34.63 
 
 		 346 aa  155  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4094  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 		 358 aa  155  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.958788  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4120  L-threonine 3-dehydrogenase  32.62 
 
 		 341 aa  155  8e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.357417  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3710  L-threonine 3-dehydrogenase  31.53 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3939  L-threonine 3-dehydrogenase  31.85 
 
 		 341 aa  154  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27746  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.69 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.477759 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01743  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  31.86 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.86 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00067  L-threonine 3-dehydrogenase  32.8 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001213  L-threonine 3-dehydrogenase  31.45 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01731  hypothetical protein  31.86 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0121  L-threonine 3-dehydrogenase  32.11 
 
 		 341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4144  L-threonine 3-dehydrogenase  30.7 
 
 		 341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.498759  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1417  sorbitol dehydrogenase  31.86 
 
 		 347 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1858  alcohol dehydrogenase  31.86 
 
 		 347 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.368595  hitchhiker  0.0000214432 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0072  L-threonine 3-dehydrogenase  30.7 
 
 		 341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2498  sorbitol dehydrogenase  31.56 
 
 		 347 aa  153  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05001  L-threonine 3-dehydrogenase  31.45 
 
 		 360 aa  153  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0066  L-threonine 3-dehydrogenase  30.7 
 
 		 341 aa  153  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2286  alcohol dehydrogenase  30.06 
 
 		 344 aa  153  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0106  L-threonine 3-dehydrogenase  31.21 
 
 		 341 aa  152  7e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1998  sorbitol dehydrogenase  31.56 
 
 		 347 aa  152  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.329256  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6746  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.29 
 
 		 347 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3793  L-threonine 3-dehydrogenase  30.21 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.49 
 
 		 348 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4509  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.01 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4823  L-threonine 3-dehydrogenase  31.1 
 
 		 341 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204753 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5833  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.65 
 
 		 347 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.119386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3219  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.31 
 
 		 347 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4160  L-threonine 3-dehydrogenase  30.81 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1590  alcohol dehydrogenase  36.68 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00466455  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0119  L-threonine 3-dehydrogenase  31.71 
 
 		 341 aa  149  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  36.04 
 
 		 350 aa  149  5e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.53 
 
 		 354 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0353  L-threonine 3-dehydrogenase  30.56 
 
 		 343 aa  149  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0530  L-threonine 3-dehydrogenase  31.09 
 
 		 345 aa  149  6e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3920  L-threonine 3-dehydrogenase  30.15 
 
 		 350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344166  normal  0.087716 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7003  L-threonine 3-dehydrogenase  30.52 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>