More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3271 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3271  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
336 aa  659    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0405628 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0108  alcohol dehydrogenase  58.86 
 
 
338 aa  365  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.476377  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3054  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.15 
 
 
347 aa  243  5e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.680504  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1659  alcohol dehydrogenase  40.31 
 
 
339 aa  224  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.741659  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.56 
 
 
346 aa  188  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  33.43 
 
 
348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2864  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.42 
 
 
359 aa  182  8.000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  31.87 
 
 
359 aa  173  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2813  alcohol dehydrogenase  34.41 
 
 
341 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0594163  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5333  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.43 
 
 
345 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0397204  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2786  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.12 
 
 
341 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2830  alcohol dehydrogenase  34.12 
 
 
341 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.782331  normal  0.335133 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  34.47 
 
 
583 aa  167  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.26 
 
 
352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  30 
 
 
336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5063  alcohol dehydrogenase  34.44 
 
 
347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.724577  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  35.52 
 
 
342 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28190  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  33.04 
 
 
345 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1455  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.45 
 
 
351 aa  161  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2124  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  32.84 
 
 
343 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0944  L-idonate 5-dehydrogenase  30.88 
 
 
350 aa  159  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.272351  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.31 
 
 
342 aa  159  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1714  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.56 
 
 
352 aa  158  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.93 
 
 
344 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.477759 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3219  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.03 
 
 
347 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  35.44 
 
 
373 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01050  sorbitol dehydrogenase, putative  32.27 
 
 
379 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917438  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.14 
 
 
373 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 
373 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3565  alcohol dehydrogenase  31.3 
 
 
345 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.34 
 
 
350 aa  153  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.34 
 
 
350 aa  153  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.77 
 
 
350 aa  153  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  31.34 
 
 
350 aa  153  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  31.34 
 
 
350 aa  153  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.34 
 
 
350 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.37 
 
 
350 aa  153  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.37 
 
 
350 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.03 
 
 
373 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  30.37 
 
 
350 aa  153  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 
350 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  34.94 
 
 
373 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0948  putative L-idonate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  32.84 
 
 
344 aa  152  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4094  alcohol dehydrogenase  32.01 
 
 
358 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.958788  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.71 
 
 
348 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2059  sorbitol dehydrogenase  29.34 
 
 
347 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  hitchhiker  0.0031409 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4289  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.02 
 
 
360 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2445  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.06 
 
 
347 aa  151  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.682207  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1417  sorbitol dehydrogenase  29.55 
 
 
347 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01743  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  29.25 
 
 
347 aa  149  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.25 
 
 
347 aa  149  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2013  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.79 
 
 
344 aa  149  5e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.238084  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01731  hypothetical protein  29.25 
 
 
347 aa  149  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4771  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.63 
 
 
344 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.107599 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4509  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32 
 
 
343 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1998  sorbitol dehydrogenase  29.25 
 
 
347 aa  149  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.329256  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1858  alcohol dehydrogenase  29.25 
 
 
347 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.368595  hitchhiker  0.0000214432 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.09 
 
 
336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2436  alcohol dehydrogenase  31.29 
 
 
345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5030  zinc-binding dehydrogenase  31.47 
 
 
343 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.959168  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.43 
 
 
354 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  32.86 
 
 
354 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02666  sorbitol/xylitol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02000)  31.75 
 
 
373 aa  146  4.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  32.86 
 
 
354 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
365 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.53 
 
 
323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2286  alcohol dehydrogenase  30.46 
 
 
344 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1538  L-idonate 5-dehydrogenase  30.59 
 
 
347 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6416  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.43 
 
 
343 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124082  normal  0.304265 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.57 
 
 
354 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2498  sorbitol dehydrogenase  28.66 
 
 
347 aa  144  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503095  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  31.23 
 
 
350 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.57 
 
 
336 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0527  alcohol dehydrogenase  31.68 
 
 
343 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361888  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6746  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.92 
 
 
347 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270529  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1641  alcohol dehydrogenase  31.68 
 
 
343 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0638  alcohol dehydrogenase  31.68 
 
 
343 aa  143  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1668  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.68 
 
 
343 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
373 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0556  alcohol dehydrogenase  31.68 
 
 
343 aa  143  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46957  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1692  alcohol dehydrogenase  31.68 
 
 
343 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  32 
 
 
363 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.56 
 
 
356 aa  142  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5456  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.68 
 
 
343 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.077084  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5853  alcohol dehydrogenase  31.68 
 
 
343 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00833857  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  32.95 
 
 
344 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5833  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.99 
 
 
347 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.119386  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0537  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.35 
 
 
325 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00294504  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3545  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
345 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.715464  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  31.62 
 
 
363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3685  alcohol dehydrogenase  30.86 
 
 
347 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.112233 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  31.62 
 
 
360 aa  140  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1590  alcohol dehydrogenase  31.69 
 
 
342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00466455  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0159  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.94 
 
 
347 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.306594  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0642  alcohol dehydrogenase  32.94 
 
 
352 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.79 
 
 
344 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  31.83 
 
 
362 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0685  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.61 
 
 
338 aa  139  7.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  32.66 
 
 
364 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>