More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4289 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4289  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
360 aa  701    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.77 
 
 
342 aa  300  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  47.51 
 
 
342 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.67 
 
 
356 aa  273  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28190  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  43.68 
 
 
345 aa  271  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1714  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.97 
 
 
352 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.72 
 
 
333 aa  250  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2813  alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 
341 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0594163  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2786  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  42.86 
 
 
341 aa  242  7e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2830  alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 
341 aa  242  7e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.782331  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.92 
 
 
352 aa  226  5.0000000000000005e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1455  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.41 
 
 
351 aa  218  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.7 
 
 
346 aa  218  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2436  alcohol dehydrogenase  38.42 
 
 
345 aa  216  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2864  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  39.94 
 
 
359 aa  213  3.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01050  sorbitol dehydrogenase, putative  36.02 
 
 
379 aa  205  1e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917438  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  34.36 
 
 
348 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0609  alcohol dehydrogenase  40.12 
 
 
352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0295083  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0849  alcohol dehydrogenase  38.23 
 
 
344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0438742 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6416  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.13 
 
 
343 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124082  normal  0.304265 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02880  L-iditol 2-dehydrogenase, putative  36.8 
 
 
400 aa  199  5e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3728  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.82 
 
 
352 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854934  normal  0.447633 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02666  sorbitol/xylitol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02000)  39.94 
 
 
373 aa  199  6e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00100  L-arabinitol 4-dehydrogenase, putative  38.58 
 
 
392 aa  199  6e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.603371  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2124  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  37.35 
 
 
343 aa  199  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.58 
 
 
356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2163  alcohol dehydrogenase  39.2 
 
 
345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  36.17 
 
 
359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0159  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  39.53 
 
 
347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.306594  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0642  alcohol dehydrogenase  39.53 
 
 
352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02960  L-arabinitol 4-dehydrogenase, putative  37.39 
 
 
392 aa  197  3e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1590  alcohol dehydrogenase  40.88 
 
 
342 aa  197  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00466455  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4094  alcohol dehydrogenase  38.4 
 
 
358 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.958788  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2609  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.84 
 
 
348 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2013  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.81 
 
 
344 aa  194  2e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.238084  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1003  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40 
 
 
342 aa  193  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.124693 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2341  alcohol dehydrogenase  37.2 
 
 
348 aa  193  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.231034 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4509  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.26 
 
 
343 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0551  D-xylulose reductase  39.82 
 
 
347 aa  193  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6746  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.65 
 
 
347 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270529  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.09 
 
 
345 aa  192  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268542  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01090  xylitol dehydrogenase, putative  35.73 
 
 
375 aa  192  6e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5833  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.58 
 
 
347 aa  192  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.119386  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1915  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.64 
 
 
349 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.482777  normal  0.264492 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86924  D-xylulose reductase (Xylitol dehydrogenase) (XDH)  35.78 
 
 
363 aa  189  5.999999999999999e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.52 
 
 
348 aa  189  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3565  alcohol dehydrogenase  35.86 
 
 
345 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5030  zinc-binding dehydrogenase  36.58 
 
 
343 aa  188  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.959168  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0948  putative L-idonate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  37.83 
 
 
344 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3219  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.82 
 
 
347 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2445  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.82 
 
 
347 aa  187  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.682207  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3545  alcohol dehydrogenase  39.88 
 
 
345 aa  186  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.715464  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20290  xylitol dehydrogeanse  37.5 
 
 
347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.92253  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16590  xylitol dehydrogenase, zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  36.95 
 
 
346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3230  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.17 
 
 
346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.282549  normal  0.671349 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1538  L-idonate 5-dehydrogenase  34.98 
 
 
347 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4771  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.44 
 
 
344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.107599 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0252  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.72 
 
 
347 aa  182  6e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01743  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  34.91 
 
 
347 aa  182  7e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.91 
 
 
347 aa  182  7e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02580  sorbitol dehydrogenase, putative  31.91 
 
 
416 aa  182  7e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01731  hypothetical protein  34.91 
 
 
347 aa  182  7e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5333  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.28 
 
 
345 aa  182  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0397204  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1659  alcohol dehydrogenase  35.88 
 
 
339 aa  182  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.741659  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2498  sorbitol dehydrogenase  34.62 
 
 
347 aa  181  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503095  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5671  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.95 
 
 
343 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3685  alcohol dehydrogenase  37.24 
 
 
347 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.112233 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  35.44 
 
 
327 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3580  hypothetical protein  35.14 
 
 
350 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.885973 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1858  alcohol dehydrogenase  34.62 
 
 
347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.368595  hitchhiker  0.0000214432 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1998  sorbitol dehydrogenase  34.62 
 
 
347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.329256  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.26 
 
 
373 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  36.26 
 
 
373 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  36.26 
 
 
373 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1417  sorbitol dehydrogenase  34.71 
 
 
347 aa  180  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3054  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.2 
 
 
347 aa  180  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.680504  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00942  hypothetical protein similar to L-arabitol dehydrogenase (Eurofung)  35.31 
 
 
386 aa  179  4.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.01 
 
 
368 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.14 
 
 
350 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.14 
 
 
350 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  33.14 
 
 
350 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  33.14 
 
 
350 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
350 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.14 
 
 
350 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0953  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.87 
 
 
336 aa  178  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00776384  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2286  alcohol dehydrogenase  34.02 
 
 
344 aa  178  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.14 
 
 
350 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.57 
 
 
350 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.57 
 
 
350 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  32.86 
 
 
350 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40172  Sorbitol dehydrogenase (L-iditol 2-dehydrogenase)  32.62 
 
 
381 aa  177  2e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.859827  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  35.98 
 
 
373 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15800  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  36.23 
 
 
343 aa  177  3e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.109123  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3277  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.61 
 
 
345 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08552  alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01490)  36.14 
 
 
363 aa  176  5e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.580046 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0944  L-idonate 5-dehydrogenase  34.7 
 
 
350 aa  176  5e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.272351  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3621  alcohol dehydrogenase  38.95 
 
 
347 aa  175  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.04 
 
 
335 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.71 
 
 
344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.477759 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.84 
 
 
373 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>