More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0953 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0953  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
336 aa  679    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00776384  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.68 
 
 
335 aa  256  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  38.98 
 
 
339 aa  252  7e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.05 
 
 
338 aa  228  8e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.152307 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00443  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04620)  37.46 
 
 
348 aa  221  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.26 
 
 
329 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  38.51 
 
 
336 aa  218  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  34.5 
 
 
344 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3849  alcohol dehydrogenase  34.12 
 
 
336 aa  215  9e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3405  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.68 
 
 
348 aa  215  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0198026  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.42 
 
 
333 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.78 
 
 
336 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.76 
 
 
336 aa  208  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1823  alcohol dehydrogenase  35.85 
 
 
350 aa  202  7e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00496203  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4840  alcohol dehydrogenase  34.07 
 
 
330 aa  199  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06260  zinc-binding dehydrogenase, putative  34.4 
 
 
349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.040279  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1780  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  34.38 
 
 
337 aa  189  5e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  32.95 
 
 
345 aa  188  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0537  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.03 
 
 
325 aa  181  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00294504  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1707  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  34.36 
 
 
336 aa  181  1e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.508276  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2070  alcohol dehydrogenase  36.31 
 
 
336 aa  179  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0603  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  32.02 
 
 
338 aa  178  1e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000710686  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1696  threonine dehydrogenase  31.31 
 
 
334 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000265476  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2220  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.79 
 
 
343 aa  173  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.135715 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.72 
 
 
342 aa  172  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2145  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  33.91 
 
 
346 aa  172  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552645  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  32.6 
 
 
327 aa  172  9e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.97 
 
 
342 aa  172  9e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0444  L-threonine 3-dehydrogenase  31.27 
 
 
344 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2958  L-threonine 3-dehydrogenase  30.68 
 
 
345 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108215  normal  0.634974 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2700  L-threonine 3-dehydrogenase  30.38 
 
 
345 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 
346 aa  169  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7070  alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 
346 aa  169  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1933  putative dehydrogenase  33.13 
 
 
339 aa  168  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121666  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28190  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  33.99 
 
 
345 aa  167  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1714  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.26 
 
 
352 aa  168  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.06 
 
 
346 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.91 
 
 
346 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0178  alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 
336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0685  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.62 
 
 
338 aa  166  4e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3564  alcohol dehydrogenase  32.57 
 
 
347 aa  166  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  31.13 
 
 
340 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0698  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.59 
 
 
349 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4898  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.93 
 
 
340 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.29 
 
 
340 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5131  putative dehydrogenase  32.82 
 
 
343 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.869856  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0614  alcohol dehydrogenase  31.65 
 
 
318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0116847  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1617  putative dehydrogenase  33.94 
 
 
339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0065  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.53 
 
 
340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.97 
 
 
340 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1676  putative dehydrogenase  33.94 
 
 
339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0530  L-threonine 3-dehydrogenase  30.77 
 
 
345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04235  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  31.93 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.767219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3639  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.93 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04201  hypothetical protein  31.93 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.774265  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1666  putative dehydrogenase  33.64 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.747821  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4590  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.93 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00423136  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1744  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.86 
 
 
345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.681848  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1608  putative dehydrogenase  33.94 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.54 
 
 
348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4903  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.93 
 
 
340 aa  164  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363717  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1860  alcohol dehydrogenase  30.57 
 
 
336 aa  163  3e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.710452  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5871  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.93 
 
 
340 aa  163  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5128  zinc-binding dehydrogenase  33.03 
 
 
337 aa  163  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.93 
 
 
340 aa  164  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0102074  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0059  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.23 
 
 
340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.14 
 
 
344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120973 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.65 
 
 
337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5268  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.09 
 
 
346 aa  162  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4598  putative dehydrogenase  32.21 
 
 
343 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0353  L-threonine 3-dehydrogenase  30.77 
 
 
343 aa  162  8.000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0885  alcohol dehydrogenase  33.93 
 
 
333 aa  162  8.000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3697  alcohol dehydrogenase  31.33 
 
 
340 aa  162  9e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587402 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5447  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.55 
 
 
350 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187392  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.71 
 
 
333 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0765  putative dehydrogenase  30.98 
 
 
343 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0512  putative dehydrogenase  30.98 
 
 
343 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0695  putative dehydrogenase  30.98 
 
 
343 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2097  putative dehydrogenase  30.98 
 
 
343 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2002  putative dehydrogenase  30.98 
 
 
343 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1649  putative dehydrogenase  30.98 
 
 
343 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.52 
 
 
340 aa  160  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108984  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0633  alcohol dehydrogenase  30.7 
 
 
317 aa  159  4e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  29.94 
 
 
337 aa  160  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1540  alcohol dehydrogenase  31.78 
 
 
336 aa  159  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.931266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4221  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 
346 aa  159  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.41128  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0449  L-threonine 3-dehydrogenase  28.65 
 
 
361 aa  159  7e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0062  L-threonine 3-dehydrogenase  29.29 
 
 
340 aa  159  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0584  putative dehydrogenase  30.67 
 
 
343 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.24761  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03474  L-threonine 3-dehydrogenase  30.68 
 
 
341 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0601715  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0092  L-threonine 3-dehydrogenase  30.68 
 
 
341 aa  158  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.212636  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03425  hypothetical protein  30.68 
 
 
341 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  27.78 
 
 
337 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05001  L-threonine 3-dehydrogenase  31.07 
 
 
360 aa  158  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4044  L-threonine 3-dehydrogenase  30.68 
 
 
341 aa  158  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3939  L-threonine 3-dehydrogenase  30.18 
 
 
341 aa  158  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27746  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1223  alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 
335 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135954  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4989  L-threonine 3-dehydrogenase  30.68 
 
 
341 aa  158  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.014  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1249  alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 
335 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257646  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3828  L-threonine 3-dehydrogenase  30.68 
 
 
341 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>