More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3564 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3564  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 347 aa  717    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1617  putative dehydrogenase  69.14 
 
 		 339 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1676  putative dehydrogenase  69.14 
 
 		 339 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1608  putative dehydrogenase  69.14 
 
 		 339 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1666  putative dehydrogenase  68.84 
 
 		 339 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.747821  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1933  putative dehydrogenase  68.55 
 
 		 339 aa  500  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  68.64 
 
 		 340 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  68.84 
 
 		 340 aa  489  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108984  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  68.34 
 
 		 343 aa  488  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  64.39 
 
 		 339 aa  478  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  64.39 
 
 		 339 aa  477  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  64.39 
 
 		 339 aa  476  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  68.64 
 
 		 340 aa  475  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  64.09 
 
 		 339 aa  475  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  64.39 
 
 		 339 aa  477  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  64.09 
 
 		 339 aa  473  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2119  dehydrogenase starvation-sensing protein  61.18 
 
 		 340 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1653  starvation sensing protein RspB  64.91 
 
 		 288 aa  408  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00258422  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5131  putative dehydrogenase  55.43 
 
 		 343 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.869856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4598  putative dehydrogenase  55.43 
 
 		 343 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0584  putative dehydrogenase  53.96 
 
 		 343 aa  384  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.24761  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0765  putative dehydrogenase  53.96 
 
 		 343 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0512  putative dehydrogenase  53.96 
 
 		 343 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0695  putative dehydrogenase  53.96 
 
 		 343 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2097  putative dehydrogenase  53.96 
 
 		 343 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2002  putative dehydrogenase  53.96 
 
 		 343 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1649  putative dehydrogenase  53.96 
 
 		 343 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.76 
 
 		 342 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  45 
 
 		 340 aa  296  5e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  43.66 
 
 		 340 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1614  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.54 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000216473  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.99 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.35 
 
 		 341 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.35 
 
 		 341 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.35 
 
 		 341 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.35 
 
 		 341 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.35 
 
 		 341 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  33.43 
 
 		 339 aa  189  7e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.64 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 		 337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.33 
 
 		 344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0797  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.33 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121673  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1707  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  32.59 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.508276  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.92 
 
 		 335 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  30.27 
 
 		 327 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.02 
 
 		 329 aa  172  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 		 345 aa  172  7.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3303  zinc-binding dehydrogenase family protein  33.88 
 
 		 338 aa  172  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0731443 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0178  alcohol dehydrogenase  32.05 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1736  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.61 
 
 		 349 aa  170  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0065  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.76 
 
 		 340 aa  169  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0603  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  33.76 
 
 		 338 aa  169  7e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000710686  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.44 
 
 		 333 aa  169  7e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 		 356 aa  169  9e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4898  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.43 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0953  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.57 
 
 		 336 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00776384  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04235  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  31.43 
 
 		 340 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.767219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3639  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.43 
 
 		 340 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  33.02 
 
 		 336 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04201  hypothetical protein  31.43 
 
 		 340 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.774265  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4590  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.43 
 
 		 340 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00423136  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4903  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.43 
 
 		 340 aa  165  8e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.43 
 
 		 340 aa  165  8e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0102074  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3697  alcohol dehydrogenase  31.14 
 
 		 340 aa  165  9e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587402 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5871  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.43 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.82 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0059  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.12 
 
 		 340 aa  163  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0021  Zn-binding dehydrogenase  29.45 
 
 		 352 aa  162  6e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0554419  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  30.03 
 
 		 342 aa  162  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5128  zinc-binding dehydrogenase  31.18 
 
 		 337 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1714  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.9 
 
 		 352 aa  159  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3328  hypothetical protein  30.97 
 
 		 338 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.463233 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0154  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.75 
 
 		 339 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5642  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.37 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1860  alcohol dehydrogenase  32.09 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.710452  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6469  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.3 
 
 		 345 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6704  alcohol dehydrogenase  31.3 
 
 		 345 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710863  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.14 
 
 		 356 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  29.57 
 
 		 344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1421  alcohol dehydrogenase  32.92 
 
 		 343 aa  155  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6310  alcohol dehydrogenase  30.43 
 
 		 345 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5447  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.44 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3320  hypothetical protein  31.29 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.915678 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2931  L-threonine 3-dehydrogenase  29.46 
 
 		 343 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.217588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4706  alcohol dehydrogenase  30.18 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0329198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3425  hypothetical protein  30.97 
 
 		 338 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.955308  hitchhiker  0.00600667 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0807  alcohol dehydrogenase  31.37 
 
 		 346 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0463124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3244  hypothetical protein  30.97 
 
 		 338 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  29.09 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2813  alcohol dehydrogenase  32.08 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0594163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0100  L-threonine 3-dehydrogenase  29.18 
 
 		 341 aa  151  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.173553 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1696  threonine dehydrogenase  32.31 
 
 		 334 aa  151  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000265476  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2739  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.112956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02513  L-threonine 3-dehydrogenase  29.85 
 
 		 344 aa  150  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  28.57 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.56 
 
 		 333 aa  150  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.36 
 
 		 350 aa  149  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07150  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  30.59 
 
 		 340 aa  149  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.36 
 
 		 350 aa  149  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>