More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0885 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0885  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
333 aa  673    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.87 
 
 
333 aa  225  9e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.94 
 
 
329 aa  193  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.24 
 
 
335 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  32 
 
 
336 aa  185  8e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.83 
 
 
344 aa  176  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.31 
 
 
323 aa  168  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00443  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04620)  29.28 
 
 
348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  34.94 
 
 
352 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0953  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.93 
 
 
336 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00776384  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3849  alcohol dehydrogenase  32.43 
 
 
336 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3685  alcohol dehydrogenase  35.19 
 
 
347 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.112233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.92 
 
 
336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.51 
 
 
336 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  32.55 
 
 
344 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0685  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.18 
 
 
338 aa  150  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4106  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.56 
 
 
336 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.82135  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4137  alcohol dehydrogenase  31.25 
 
 
336 aa  149  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.31521  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06260  zinc-binding dehydrogenase, putative  28.12 
 
 
349 aa  149  7e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.040279  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4771  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.15 
 
 
344 aa  149  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.107599 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  33.64 
 
 
350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1044  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.25 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.69 
 
 
344 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.477759 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02158  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_2G15930)  33.44 
 
 
353 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.953823  normal  0.515496 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  33.13 
 
 
322 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.860675 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4352  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.63 
 
 
336 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4094  L-threonine 3-dehydrogenase  28.7 
 
 
341 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3988  L-threonine 3-dehydrogenase  28.7 
 
 
341 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3907  L-threonine 3-dehydrogenase  28.7 
 
 
341 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3926  L-threonine 3-dehydrogenase  28.7 
 
 
341 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4033  L-threonine 3-dehydrogenase  28.7 
 
 
341 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0537  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.2 
 
 
325 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00294504  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4823  L-threonine 3-dehydrogenase  28.11 
 
 
341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204753 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4144  L-threonine 3-dehydrogenase  28.11 
 
 
341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.498759  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.43 
 
 
338 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1780  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  29.73 
 
 
337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0072  L-threonine 3-dehydrogenase  28.11 
 
 
341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2124  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  35.33 
 
 
343 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0066  L-threonine 3-dehydrogenase  28.11 
 
 
341 aa  140  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1644  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.55 
 
 
341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2235  alcohol dehydrogenase  33.55 
 
 
341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0660  alcohol dehydrogenase  33.55 
 
 
341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1670  alcohol dehydrogenase  33.55 
 
 
341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0565  alcohol dehydrogenase  33.55 
 
 
341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678248  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1619  alcohol dehydrogenase  33.55 
 
 
341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0089  L-threonine 3-dehydrogenase  28.4 
 
 
341 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  27.73 
 
 
341 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5628  L-threonine 3-dehydrogenase  33.55 
 
 
341 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0490  alcohol dehydrogenase  33.55 
 
 
341 aa  139  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283915  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03474  L-threonine 3-dehydrogenase  28.11 
 
 
341 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0601715  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1000  putative alcohol dehydrogenase  32.42 
 
 
352 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3828  L-threonine 3-dehydrogenase  28.11 
 
 
341 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03425  hypothetical protein  28.11 
 
 
341 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3901  L-threonine 3-dehydrogenase  27.73 
 
 
341 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00409651  normal  0.55097 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  27.73 
 
 
341 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0092  L-threonine 3-dehydrogenase  28.11 
 
 
341 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.212636  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4044  L-threonine 3-dehydrogenase  28.11 
 
 
341 aa  139  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4105  L-threonine 3-dehydrogenase  27.73 
 
 
341 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287848  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0175  L-threonine 3-dehydrogenase  28.78 
 
 
341 aa  139  7.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348381  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4989  L-threonine 3-dehydrogenase  28.11 
 
 
341 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.014  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3953  L-threonine 3-dehydrogenase  28.11 
 
 
341 aa  139  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0503034  normal  0.824331 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0119  L-threonine 3-dehydrogenase  28.11 
 
 
341 aa  138  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  30.68 
 
 
339 aa  138  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  27.45 
 
 
341 aa  137  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6309  alcohol dehydrogenase  31.9 
 
 
337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33332  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0944  L-idonate 5-dehydrogenase  32.51 
 
 
350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.272351  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0233  alcohol dehydrogenase  32.06 
 
 
351 aa  137  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0239  alcohol dehydrogenase  32.06 
 
 
351 aa  137  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1489  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.02 
 
 
373 aa  136  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.434256  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  28.41 
 
 
341 aa  136  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3944  L-threonine 3-dehydrogenase  28.7 
 
 
342 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  30.4 
 
 
339 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4120  L-threonine 3-dehydrogenase  27.81 
 
 
341 aa  135  8e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.357417  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  30.09 
 
 
339 aa  135  8e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 
373 aa  135  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  30.4 
 
 
339 aa  135  9e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00067  L-threonine 3-dehydrogenase  27.56 
 
 
341 aa  135  9e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  30.4 
 
 
339 aa  135  9e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.4 
 
 
339 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4341  L-threonine 3-dehydrogenase  27.17 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  27.17 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3710  L-threonine 3-dehydrogenase  27.83 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187743  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4286  L-threonine 3-dehydrogenase  27.17 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588728 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  27.17 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1538  L-idonate 5-dehydrogenase  33.03 
 
 
347 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5333  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.12 
 
 
345 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0397204  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.07 
 
 
337 aa  134  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  29.79 
 
 
339 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3939  L-threonine 3-dehydrogenase  28.41 
 
 
341 aa  133  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27746  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4086  L-threonine 3-dehydrogenase  26.33 
 
 
343 aa  133  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  27.54 
 
 
341 aa  132  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1696  threonine dehydrogenase  30.99 
 
 
334 aa  132  6.999999999999999e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000265476  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1707  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  29.83 
 
 
336 aa  132  6.999999999999999e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.508276  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4094  alcohol dehydrogenase  32.56 
 
 
358 aa  132  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.958788  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6089  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.56 
 
 
337 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0530  L-threonine 3-dehydrogenase  26.95 
 
 
345 aa  132  9e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3616  L-threonine 3-dehydrogenase  27.45 
 
 
342 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00121447  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.3 
 
 
340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4840  alcohol dehydrogenase  31.72 
 
 
330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0106  L-threonine 3-dehydrogenase  27.54 
 
 
341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>