More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6089 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6089  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  100 
 
 		 337 aa  682    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0771  alcohol dehydrogenase  56.29 
 
 		 333 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1400  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  42.9 
 
 		 328 aa  232  7.000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00260495 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2036  zinc-containing alcohol dehydrogenase  45.59 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.194095  normal  0.0749622 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4454  alcohol dehydrogenase  37.39 
 
 		 345 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  35.47 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0807  alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 		 346 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0463124 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0619  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.78 
 
 		 339 aa  192  8e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.63 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0607  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  38.1 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420026  normal  0.0271059 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0359  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.45 
 
 		 329 aa  163  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.30751  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  32.57 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3328  hypothetical protein  32.35 
 
 		 338 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.463233 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2958  L-threonine 3-dehydrogenase  30.57 
 
 		 345 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108215  normal  0.634974 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0444  L-threonine 3-dehydrogenase  31.12 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0537  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.81 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00294504  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1794  alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0373035  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3303  zinc-binding dehydrogenase family protein  30.81 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0731443 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2224  L-threonine 3-dehydrogenase  29.48 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  32.39 
 
 		 344 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.25 
 
 		 340 aa  146  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  30.74 
 
 		 343 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4086  L-threonine 3-dehydrogenase  30.65 
 
 		 343 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.97 
 
 		 344 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0603  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  32.99 
 
 		 338 aa  145  8.000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000710686  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.74 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3320  hypothetical protein  32.68 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.915678 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2700  L-threonine 3-dehydrogenase  31.21 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0449  L-threonine 3-dehydrogenase  31.07 
 
 		 361 aa  145  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1589  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.43 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3244  hypothetical protein  32.68 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4823  L-threonine 3-dehydrogenase  29.68 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204753 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0089  L-threonine 3-dehydrogenase  29.39 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0066  L-threonine 3-dehydrogenase  29.39 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3953  L-threonine 3-dehydrogenase  29.11 
 
 		 341 aa  143  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0503034  normal  0.824331 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03474  L-threonine 3-dehydrogenase  29.11 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0601715  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3907  L-threonine 3-dehydrogenase  30.54 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4094  L-threonine 3-dehydrogenase  30.54 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4044  L-threonine 3-dehydrogenase  29.11 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4144  L-threonine 3-dehydrogenase  29.11 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.498759  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03425  hypothetical protein  29.11 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3828  L-threonine 3-dehydrogenase  29.11 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3988  L-threonine 3-dehydrogenase  30.54 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4989  L-threonine 3-dehydrogenase  29.11 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3926  L-threonine 3-dehydrogenase  30.54 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4033  L-threonine 3-dehydrogenase  30.54 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0092  L-threonine 3-dehydrogenase  29.11 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.212636  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1780  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  28.94 
 
 		 337 aa  143  4e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0072  L-threonine 3-dehydrogenase  29.11 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  31.51 
 
 		 337 aa  143  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0062  L-threonine 3-dehydrogenase  28.57 
 
 		 340 aa  142  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3425  hypothetical protein  32.35 
 
 		 338 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.955308  hitchhiker  0.00600667 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1860  alcohol dehydrogenase  30.33 
 
 		 336 aa  142  7e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.710452  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3875  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.74 
 
 		 344 aa  142  7e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.177678  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5628  L-threonine 3-dehydrogenase  33.01 
 
 		 341 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0490  alcohol dehydrogenase  33.01 
 
 		 341 aa  142  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1707  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  32.28 
 
 		 336 aa  141  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.508276  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4120  L-threonine 3-dehydrogenase  29.11 
 
 		 341 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.357417  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0565  alcohol dehydrogenase  32.68 
 
 		 341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1644  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.68 
 
 		 341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.94 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108984  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2235  alcohol dehydrogenase  32.68 
 
 		 341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1670  alcohol dehydrogenase  32.68 
 
 		 341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0660  alcohol dehydrogenase  32.68 
 
 		 341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1619  alcohol dehydrogenase  32.68 
 
 		 341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  30.57 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.45 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001213  L-threonine 3-dehydrogenase  29.68 
 
 		 343 aa  140  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  28.74 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0353  L-threonine 3-dehydrogenase  29.68 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02513  L-threonine 3-dehydrogenase  30.92 
 
 		 344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3939  L-threonine 3-dehydrogenase  28.74 
 
 		 341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27746  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0119  L-threonine 3-dehydrogenase  30.12 
 
 		 341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0788  alcohol dehydrogenase  29.31 
 
 		 349 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0233  L-threonine 3-dehydrogenase  31.11 
 
 		 345 aa  140  4.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.43371 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00067  L-threonine 3-dehydrogenase  28.94 
 
 		 341 aa  139  8.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05001  L-threonine 3-dehydrogenase  29.68 
 
 		 360 aa  138  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0175  L-threonine 3-dehydrogenase  29.63 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348381  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0100  L-threonine 3-dehydrogenase  30.1 
 
 		 341 aa  138  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.173553 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4706  alcohol dehydrogenase  32.72 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  28.24 
 
 		 341 aa  138  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3901  L-threonine 3-dehydrogenase  27.95 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00409651  normal  0.55097 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  27.95 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1933  putative dehydrogenase  31.97 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4105  L-threonine 3-dehydrogenase  27.95 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287848  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3710  L-threonine 3-dehydrogenase  28.24 
 
 		 341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0837  L-threonine 3-dehydrogenase  28.29 
 
 		 343 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178921  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  27.95 
 
 		 341 aa  137  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1862  L-threonine 3-dehydrogenase  31.03 
 
 		 345 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.55 
 
 		 348 aa  136  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0757  L-threonine 3-dehydrogenase  29.11 
 
 		 340 aa  136  5e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3944  L-threonine 3-dehydrogenase  28.29 
 
 		 342 aa  136  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  29.03 
 
 		 341 aa  136  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4341  L-threonine 3-dehydrogenase  28.24 
 
 		 341 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0556  alcohol dehydrogenase  30.72 
 
 		 343 aa  135  9e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1668  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.72 
 
 		 343 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0638  alcohol dehydrogenase  30.72 
 
 		 343 aa  135  9e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  29.39 
 
 		 341 aa  135  9e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1692  alcohol dehydrogenase  30.72 
 
 		 343 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  29.39 
 
 		 341 aa  135  9e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>