More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4706 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4706  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 341 aa  695    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  45.13 
 
 		 356 aa  292  7e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3697  alcohol dehydrogenase  46.18 
 
 		 340 aa  291  9e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587402 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4903  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  45.88 
 
 		 340 aa  291  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  45.88 
 
 		 340 aa  291  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0102074  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0059  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.59 
 
 		 340 aa  290  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04235  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  45.59 
 
 		 340 aa  289  4e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.767219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3639  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.59 
 
 		 340 aa  289  4e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04201  hypothetical protein  45.59 
 
 		 340 aa  289  4e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.774265  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4590  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  45.59 
 
 		 340 aa  289  4e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00423136  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5871  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  45.88 
 
 		 340 aa  289  6e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0065  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.71 
 
 		 340 aa  285  9e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4898  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  45 
 
 		 340 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  44.38 
 
 		 337 aa  279  4e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5642  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.82 
 
 		 337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0797  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  41.54 
 
 		 338 aa  264  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121673  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3303  zinc-binding dehydrogenase family protein  43.07 
 
 		 338 aa  262  8e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0731443 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1736  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  41.35 
 
 		 349 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3328  hypothetical protein  42.18 
 
 		 338 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.463233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2739  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.87 
 
 		 337 aa  250  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.112956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1421  alcohol dehydrogenase  39.71 
 
 		 343 aa  246  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3317  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.98 
 
 		 338 aa  245  9e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  hitchhiker  0.0000240679 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3320  hypothetical protein  42.77 
 
 		 338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.915678 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1223  alcohol dehydrogenase  40.24 
 
 		 335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135954  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3425  hypothetical protein  42.48 
 
 		 338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.955308  hitchhiker  0.00600667 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3244  hypothetical protein  42.48 
 
 		 338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1249  alcohol dehydrogenase  39.94 
 
 		 335 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5476  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.53 
 
 		 335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3230  alcohol dehydrogenase  41.42 
 
 		 338 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1260  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.58 
 
 		 339 aa  229  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.785941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6469  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  39.5 
 
 		 345 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6704  alcohol dehydrogenase  39.5 
 
 		 345 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710863  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6310  alcohol dehydrogenase  39.18 
 
 		 345 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0154  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.12 
 
 		 339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.89 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0329198 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0178  alcohol dehydrogenase  39.35 
 
 		 336 aa  223  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6341  alcohol dehydrogenase  37.46 
 
 		 336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00479428  normal  0.719872 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2070  alcohol dehydrogenase  37.39 
 
 		 336 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0286  alcohol dehydrogenase  38.36 
 
 		 330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5128  zinc-binding dehydrogenase  35.4 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1608  putative Zn-dependent dehydrogenase  36.76 
 
 		 330 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.587808  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1540  alcohol dehydrogenase  36.99 
 
 		 336 aa  206  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.931266 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0262  alcohol dehydrogenase  36.16 
 
 		 327 aa  205  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4931  alcohol dehydrogenase  32.81 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0021  Zn-binding dehydrogenase  30.88 
 
 		 352 aa  185  8e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0554419  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.42 
 
 		 337 aa  185  9e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0577  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.75 
 
 		 342 aa  183  5.0000000000000004e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.105265  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3592  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.59 
 
 		 347 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07150  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  35.5 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439183  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  34 
 
 		 340 aa  176  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  33.12 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  32.91 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  33.12 
 
 		 341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  33.12 
 
 		 341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  33.12 
 
 		 341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  33.12 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1614  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.49 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000216473  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.36 
 
 		 344 aa  169  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3903  alcohol dehydrogenase  31.74 
 
 		 338 aa  169  8e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2551  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.86 
 
 		 341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163607  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.58 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4598  putative dehydrogenase  32.36 
 
 		 343 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  29.28 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4950  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.1 
 
 		 347 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5131  putative dehydrogenase  31.78 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.869856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2002  putative dehydrogenase  30.5 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  32.19 
 
 		 339 aa  157  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  32.5 
 
 		 339 aa  157  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0765  putative dehydrogenase  30.21 
 
 		 343 aa  156  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0512  putative dehydrogenase  30.21 
 
 		 343 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  32.19 
 
 		 339 aa  156  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0695  putative dehydrogenase  30.21 
 
 		 343 aa  156  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2097  putative dehydrogenase  30.21 
 
 		 343 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1649  putative dehydrogenase  30.21 
 
 		 343 aa  156  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0584  putative dehydrogenase  30.21 
 
 		 343 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.24761  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  32.19 
 
 		 339 aa  155  8e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.19 
 
 		 339 aa  155  8e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  32.19 
 
 		 339 aa  155  8e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  30.31 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2119  dehydrogenase starvation-sensing protein  33.33 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3564  alcohol dehydrogenase  30.18 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1933  putative dehydrogenase  31.85 
 
 		 339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  33.43 
 
 		 363 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0953  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.5 
 
 		 336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00776384  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  30.79 
 
 		 355 aa  153  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  33.23 
 
 		 363 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  30.75 
 
 		 340 aa  153  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2235  alcohol dehydrogenase  32.83 
 
 		 340 aa  151  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000256926  hitchhiker  0.0000000000711864 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.43 
 
 		 340 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  31.27 
 
 		 337 aa  150  4e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.46 
 
 		 340 aa  149  9e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108984  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02158  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_2G15930)  31.21 
 
 		 353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.953823  normal  0.515496 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  30.61 
 
 		 345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0698  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.48 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1589  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.11 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.99 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4479  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.02 
 
 		 347 aa  146  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.522798  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  30.7 
 
 		 365 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  31.64 
 
 		 360 aa  145  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  29.33 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>