More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4950 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4950  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
347 aa  689    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3592  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  85.01 
 
 
347 aa  577  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167683  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  48.96 
 
 
338 aa  339  5e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2551  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  46.13 
 
 
341 aa  315  7e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163607  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0788  alcohol dehydrogenase  36.52 
 
 
349 aa  200  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.690483 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02158  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_2G15930)  37.61 
 
 
353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.953823  normal  0.515496 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1794  alcohol dehydrogenase  38.56 
 
 
343 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0373035  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0125  alcohol dehydrogenase  37.35 
 
 
350 aa  194  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0844378  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4706  alcohol dehydrogenase  36.76 
 
 
341 aa  185  8e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0049  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.05 
 
 
350 aa  178  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  35.63 
 
 
352 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.74 
 
 
350 aa  175  9e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  33.74 
 
 
350 aa  175  9e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.74 
 
 
350 aa  175  9e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.74 
 
 
350 aa  175  9e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.74 
 
 
350 aa  175  9e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.74 
 
 
350 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  34.05 
 
 
350 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  33.74 
 
 
350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  33.74 
 
 
350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.74 
 
 
350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  34.65 
 
 
362 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.72 
 
 
350 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  34.32 
 
 
362 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  35.33 
 
 
354 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 
350 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.22 
 
 
338 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0329198 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  35.33 
 
 
354 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4980  alcohol dehydrogenase  34.66 
 
 
357 aa  170  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.155342 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3903  alcohol dehydrogenase  33.89 
 
 
338 aa  170  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.67 
 
 
323 aa  169  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00599  conserved hypothetical protein  31.4 
 
 
369 aa  168  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.932146  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  33.66 
 
 
362 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1249  alcohol dehydrogenase  34.16 
 
 
335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257646  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.33 
 
 
354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  35.33 
 
 
365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  35.03 
 
 
354 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  35.15 
 
 
373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5268  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.47 
 
 
346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0154  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.55 
 
 
339 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186872  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.74 
 
 
346 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1223  alcohol dehydrogenase  33.85 
 
 
335 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135954  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  33.66 
 
 
360 aa  162  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  35.26 
 
 
364 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.63 
 
 
373 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5476  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.29 
 
 
335 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.94 
 
 
354 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  32.21 
 
 
345 aa  161  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  33.23 
 
 
363 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.43 
 
 
337 aa  159  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0880  alcohol dehydrogenase  37.27 
 
 
351 aa  159  7e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.173388  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4479  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.31 
 
 
347 aa  158  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.522798  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  31.37 
 
 
356 aa  158  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3324  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.38 
 
 
350 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0421123  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3317  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.66 
 
 
338 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  hitchhiker  0.0000240679 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4931  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
337 aa  158  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  32.13 
 
 
355 aa  157  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  32.24 
 
 
363 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1000  putative alcohol dehydrogenase  35.34 
 
 
352 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  30.72 
 
 
336 aa  156  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  31.13 
 
 
327 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  32.93 
 
 
359 aa  154  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  34.14 
 
 
373 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  33.56 
 
 
337 aa  153  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
373 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.53 
 
 
373 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  35.62 
 
 
322 aa  153  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.860675 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 
373 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7649  zinc-binding dehydrogenase  32.95 
 
 
357 aa  153  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.298467  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5642  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.7 
 
 
337 aa  153  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0239  alcohol dehydrogenase  29.87 
 
 
351 aa  152  8.999999999999999e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0233  alcohol dehydrogenase  29.87 
 
 
351 aa  152  8.999999999999999e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1736  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.35 
 
 
349 aa  151  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  34.14 
 
 
346 aa  152  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1043  alcohol dehydrogenase  32.83 
 
 
353 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.63 
 
 
344 aa  152  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.44 
 
 
342 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2661  L-threonine 3-dehydrogenase  29.77 
 
 
346 aa  151  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2811  alcohol dehydrogenase  34.78 
 
 
347 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133999  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1421  alcohol dehydrogenase  33.98 
 
 
343 aa  151  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07150  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  35.6 
 
 
340 aa  150  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439183  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2828  alcohol dehydrogenase  34.78 
 
 
343 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155527  normal  0.0877096 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2700  L-threonine 3-dehydrogenase  29.94 
 
 
345 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1530  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.75 
 
 
367 aa  149  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540116  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2028  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.34 
 
 
349 aa  149  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37466  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4040  alcohol dehydrogenase  34.04 
 
 
356 aa  149  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0364126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2784  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.78 
 
 
342 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.551512  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0797  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.04 
 
 
338 aa  149  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121673  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5131  putative dehydrogenase  32.1 
 
 
343 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.869856  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86924  D-xylulose reductase (Xylitol dehydrogenase) (XDH)  31.76 
 
 
363 aa  149  7e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3230  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
338 aa  149  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0745  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  29.94 
 
 
360 aa  149  8e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.1 
 
 
341 aa  149  8e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.3 
 
 
341 aa  149  9e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.87 
 
 
347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2958  L-threonine 3-dehydrogenase  29.63 
 
 
345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108215  normal  0.634974 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  31.4 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  31.4 
 
 
341 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2739  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.33 
 
 
337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.112956  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  31.06 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>