More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4119 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
356 aa  732    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5642  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  62.8 
 
 
337 aa  461  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3317  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  60.65 
 
 
338 aa  442  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  hitchhiker  0.0000240679 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2739  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  59.35 
 
 
337 aa  435  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.112956  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1260  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.27 
 
 
339 aa  415  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.785941  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0797  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  50.3 
 
 
338 aa  359  4e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121673  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1736  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  48.24 
 
 
349 aa  352  5e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6469  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  46.47 
 
 
345 aa  348  9e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6704  alcohol dehydrogenase  46.47 
 
 
345 aa  348  9e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710863  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5476  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.51 
 
 
335 aa  345  8e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1223  alcohol dehydrogenase  47.62 
 
 
335 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135954  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6310  alcohol dehydrogenase  45.59 
 
 
345 aa  341  9e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1249  alcohol dehydrogenase  47.62 
 
 
335 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257646  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6341  alcohol dehydrogenase  46.13 
 
 
336 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00479428  normal  0.719872 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2070  alcohol dehydrogenase  44.81 
 
 
336 aa  333  4e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1421  alcohol dehydrogenase  44.87 
 
 
343 aa  327  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0059  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.93 
 
 
340 aa  317  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4903  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  47.63 
 
 
340 aa  315  8e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363717  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  47.63 
 
 
340 aa  315  8e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0102074  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3697  alcohol dehydrogenase  47.63 
 
 
340 aa  315  9e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587402 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04235  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  47.63 
 
 
340 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.767219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3639  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.63 
 
 
340 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5871  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  47.63 
 
 
340 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04201  hypothetical protein  47.63 
 
 
340 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.774265  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4590  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  47.63 
 
 
340 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00423136  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4898  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  47.34 
 
 
340 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5128  zinc-binding dehydrogenase  44.51 
 
 
337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0178  alcohol dehydrogenase  43.95 
 
 
336 aa  310  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0065  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.75 
 
 
340 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1540  alcohol dehydrogenase  43.11 
 
 
336 aa  304  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.931266 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  43.92 
 
 
337 aa  298  8e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1608  putative Zn-dependent dehydrogenase  42.77 
 
 
330 aa  293  4e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.587808  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4706  alcohol dehydrogenase  45.13 
 
 
341 aa  292  7e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0262  alcohol dehydrogenase  42.73 
 
 
327 aa  292  7e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3230  alcohol dehydrogenase  43.07 
 
 
338 aa  290  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0286  alcohol dehydrogenase  42.18 
 
 
330 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0577  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.64 
 
 
342 aa  283  3.0000000000000004e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.105265  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.01 
 
 
338 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0329198 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0154  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.42 
 
 
339 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186872  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3303  zinc-binding dehydrogenase family protein  43.03 
 
 
338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0731443 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3328  hypothetical protein  42.31 
 
 
338 aa  272  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.463233 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3320  hypothetical protein  42.9 
 
 
338 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.915678 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3244  hypothetical protein  42.6 
 
 
338 aa  262  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3425  hypothetical protein  42.6 
 
 
338 aa  262  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.955308  hitchhiker  0.00600667 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.16 
 
 
337 aa  218  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0021  Zn-binding dehydrogenase  38.26 
 
 
352 aa  213  5.999999999999999e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0554419  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.14 
 
 
342 aa  200  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07150  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  36.3 
 
 
340 aa  196  6e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439183  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3903  alcohol dehydrogenase  35.76 
 
 
338 aa  196  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4931  alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 
337 aa  195  8.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  35.2 
 
 
341 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  35.2 
 
 
341 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  35.2 
 
 
341 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  35.2 
 
 
341 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  35.2 
 
 
341 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2119  dehydrogenase starvation-sensing protein  33.13 
 
 
340 aa  180  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.13 
 
 
344 aa  176  8e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  35.51 
 
 
339 aa  175  9e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  35.51 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
340 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  35.2 
 
 
339 aa  173  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.2 
 
 
339 aa  173  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  33.96 
 
 
345 aa  172  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  35.2 
 
 
339 aa  173  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  33.33 
 
 
340 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32 
 
 
340 aa  170  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  34.89 
 
 
339 aa  169  8e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3564  alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
347 aa  169  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0765  putative dehydrogenase  30.77 
 
 
343 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0512  putative dehydrogenase  30.77 
 
 
343 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4598  putative dehydrogenase  30.77 
 
 
343 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1649  putative dehydrogenase  30.77 
 
 
343 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2002  putative dehydrogenase  30.77 
 
 
343 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0584  putative dehydrogenase  30.77 
 
 
343 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.24761  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0695  putative dehydrogenase  30.77 
 
 
343 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  32.92 
 
 
343 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2097  putative dehydrogenase  30.77 
 
 
343 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02158  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_2G15930)  30.68 
 
 
353 aa  167  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.953823  normal  0.515496 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.88 
 
 
340 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0537  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.09 
 
 
325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00294504  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1933  putative dehydrogenase  32.12 
 
 
339 aa  166  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121666  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.21 
 
 
340 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108984  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2551  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.61 
 
 
341 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163607  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1614  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.55 
 
 
338 aa  166  8e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000216473  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.5 
 
 
351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5131  putative dehydrogenase  30.37 
 
 
343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.869856  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.33 
 
 
341 aa  164  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.12 
 
 
346 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  31.12 
 
 
346 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  31.03 
 
 
338 aa  162  9e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.54 
 
 
344 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120973 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3875  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.85 
 
 
344 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.177678  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  31.67 
 
 
336 aa  161  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1617  putative dehydrogenase  32.33 
 
 
339 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1676  putative dehydrogenase  32.33 
 
 
339 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.46 
 
 
347 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1608  putative dehydrogenase  32.33 
 
 
339 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1804  alcohol dehydrogenase  32.32 
 
 
349 aa  160  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1666  putative dehydrogenase  32.02 
 
 
339 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.747821  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3769  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.4 
 
 
341 aa  159  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.109016  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>