More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3875 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_3875  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
344 aa  699    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.177678  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.61 
 
 
347 aa  359  4e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4479  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.8 
 
 
347 aa  337  2.9999999999999997e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.522798  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1589  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.66 
 
 
341 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0239  alcohol dehydrogenase  35.92 
 
 
351 aa  206  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0233  alcohol dehydrogenase  35.92 
 
 
351 aa  206  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  35.87 
 
 
338 aa  199  5e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3746  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.89 
 
 
349 aa  186  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427157  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2272  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.3 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5082  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.14 
 
 
333 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.206655  normal  0.31977 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0338  alcohol dehydrogenase  37.38 
 
 
352 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.76 
 
 
337 aa  177  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0619  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.83 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 
373 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0797  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.04 
 
 
338 aa  170  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121673  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  33.63 
 
 
364 aa  170  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.91 
 
 
373 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 
373 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0788  alcohol dehydrogenase  33.82 
 
 
349 aa  169  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2551  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.21 
 
 
341 aa  168  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163607  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.86 
 
 
354 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 
354 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.05 
 
 
354 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3116  L-threonine 3-dehydrogenase  30.26 
 
 
342 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.717555 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3324  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.23 
 
 
344 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000796968  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
365 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0006  L-threonine 3-dehydrogenase  29.71 
 
 
343 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1512  L-threonine 3-dehydrogenase  29.71 
 
 
343 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0780  L-threonine 3-dehydrogenase  32.95 
 
 
348 aa  165  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4973  L-threonine 3-dehydrogenase  29.97 
 
 
342 aa  166  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.554494  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1152  L-threonine 3-dehydrogenase  29.71 
 
 
343 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1432  L-threonine 3-dehydrogenase  29.71 
 
 
343 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0006  L-threonine 3-dehydrogenase  29.71 
 
 
343 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936478  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0006  L-threonine 3-dehydrogenase  29.71 
 
 
343 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0007  L-threonine 3-dehydrogenase  29.71 
 
 
343 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.237262  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  32.66 
 
 
354 aa  165  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.76 
 
 
373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1614  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.54 
 
 
338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000216473  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4187  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.24 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  29.63 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  32.76 
 
 
354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3939  L-threonine 3-dehydrogenase  29.06 
 
 
341 aa  163  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27746  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1789  alcohol dehydrogenase  34.97 
 
 
343 aa  163  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.490533  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  29.65 
 
 
345 aa  162  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0006  L-threonine 3-dehydrogenase  29.6 
 
 
343 aa  162  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 
337 aa  162  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3953  L-threonine 3-dehydrogenase  30.03 
 
 
341 aa  162  9e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0503034  normal  0.824331 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4989  L-threonine 3-dehydrogenase  30.03 
 
 
341 aa  162  9e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.014  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03474  L-threonine 3-dehydrogenase  30.03 
 
 
341 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0601715  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0092  L-threonine 3-dehydrogenase  30.03 
 
 
341 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.212636  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3828  L-threonine 3-dehydrogenase  30.03 
 
 
341 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03425  hypothetical protein  30.03 
 
 
341 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4044  L-threonine 3-dehydrogenase  30.03 
 
 
341 aa  162  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0089  L-threonine 3-dehydrogenase  29.72 
 
 
341 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.41 
 
 
336 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3178  L-threonine 3-dehydrogenase  29.39 
 
 
342 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.22 
 
 
341 aa  160  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  31.85 
 
 
356 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4120  L-threonine 3-dehydrogenase  30.03 
 
 
341 aa  160  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.357417  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4094  L-threonine 3-dehydrogenase  29.78 
 
 
341 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4535  L-threonine 3-dehydrogenase  29.39 
 
 
342 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3907  L-threonine 3-dehydrogenase  29.78 
 
 
341 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3926  L-threonine 3-dehydrogenase  29.78 
 
 
341 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5157  L-threonine 3-dehydrogenase  29.39 
 
 
342 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4033  L-threonine 3-dehydrogenase  29.78 
 
 
341 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  32.47 
 
 
373 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0106  L-threonine 3-dehydrogenase  29.06 
 
 
341 aa  160  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588963  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5702  L-threonine 3-dehydrogenase  29.39 
 
 
342 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495023 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3988  L-threonine 3-dehydrogenase  29.78 
 
 
341 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2268  alcohol dehydrogenase  32.95 
 
 
358 aa  160  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.396502  hitchhiker  0.0088894 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0062  L-threonine 3-dehydrogenase  28.45 
 
 
340 aa  160  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00067  L-threonine 3-dehydrogenase  29.8 
 
 
341 aa  160  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  28.77 
 
 
341 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4286  L-threonine 3-dehydrogenase  28.77 
 
 
341 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588728 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  28.77 
 
 
341 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5320  L-threonine 3-dehydrogenase  29.28 
 
 
342 aa  159  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3710  L-threonine 3-dehydrogenase  28.77 
 
 
341 aa  159  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187743  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0125  alcohol dehydrogenase  32.94 
 
 
350 aa  159  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0844378  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0119  L-threonine 3-dehydrogenase  29.41 
 
 
341 aa  159  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  30.64 
 
 
339 aa  159  8e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.64 
 
 
346 aa  159  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3020  L-threonine 3-dehydrogenase  28.97 
 
 
343 aa  159  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  30.64 
 
 
339 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.64 
 
 
339 aa  159  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4160  L-threonine 3-dehydrogenase  28.53 
 
 
342 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7003  L-threonine 3-dehydrogenase  28.97 
 
 
343 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  30.64 
 
 
339 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4341  L-threonine 3-dehydrogenase  28.49 
 
 
341 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0146  alcohol dehydrogenase  30.7 
 
 
345 aa  158  2e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  30.92 
 
 
339 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0100  L-threonine 3-dehydrogenase  28.77 
 
 
341 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.173553 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  30.97 
 
 
373 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1617  putative dehydrogenase  29.28 
 
 
339 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1666  putative dehydrogenase  28.99 
 
 
339 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.747821  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  28.83 
 
 
341 aa  157  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4898  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.6 
 
 
340 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1608  putative dehydrogenase  28.99 
 
 
339 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  28.53 
 
 
341 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  28.53 
 
 
341 aa  156  6e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1676  putative dehydrogenase  28.99 
 
 
339 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>