More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4187 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_4187  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 		 335 aa  653    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5082  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50.45 
 
 		 333 aa  282  6.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.206655  normal  0.31977 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3701  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  46.39 
 
 		 321 aa  252  7e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.535864  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0239  alcohol dehydrogenase  36.44 
 
 		 351 aa  218  7.999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0233  alcohol dehydrogenase  36.44 
 
 		 351 aa  218  7.999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3324  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.82 
 
 		 344 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000796968  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40 
 
 		 329 aa  202  9e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2272  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.89 
 
 		 349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0338  alcohol dehydrogenase  40.34 
 
 		 352 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.12 
 
 		 335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0175  L-threonine 3-dehydrogenase  32.76 
 
 		 341 aa  173  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348381  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0072  L-threonine 3-dehydrogenase  31.9 
 
 		 341 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4144  L-threonine 3-dehydrogenase  31.9 
 
 		 341 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.498759  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3944  L-threonine 3-dehydrogenase  33.33 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  34.57 
 
 		 327 aa  170  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001213  L-threonine 3-dehydrogenase  30.72 
 
 		 343 aa  170  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4086  L-threonine 3-dehydrogenase  31.9 
 
 		 343 aa  169  6e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0066  L-threonine 3-dehydrogenase  31.61 
 
 		 341 aa  169  6e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.46 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  32.83 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05001  L-threonine 3-dehydrogenase  30.43 
 
 		 360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.18 
 
 		 344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.13 
 
 		 323 aa  166  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  30.46 
 
 		 341 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  30.46 
 
 		 341 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  30.75 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3953  L-threonine 3-dehydrogenase  30.46 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0503034  normal  0.824331 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0089  L-threonine 3-dehydrogenase  30.75 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3875  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.24 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.177678  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4823  L-threonine 3-dehydrogenase  31.03 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204753 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3793  L-threonine 3-dehydrogenase  30.43 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3746  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.6 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427157  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3710  L-threonine 3-dehydrogenase  29.89 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187743  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03474  L-threonine 3-dehydrogenase  30.46 
 
 		 341 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0601715  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3828  L-threonine 3-dehydrogenase  30.46 
 
 		 341 aa  164  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4044  L-threonine 3-dehydrogenase  30.46 
 
 		 341 aa  164  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03425  hypothetical protein  30.46 
 
 		 341 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0619  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.64 
 
 		 339 aa  164  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0092  L-threonine 3-dehydrogenase  30.46 
 
 		 341 aa  164  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.212636  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0353  L-threonine 3-dehydrogenase  29.86 
 
 		 343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0106  L-threonine 3-dehydrogenase  29.89 
 
 		 341 aa  162  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588963  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3907  L-threonine 3-dehydrogenase  30.75 
 
 		 341 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4094  L-threonine 3-dehydrogenase  30.75 
 
 		 341 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1783  L-threonine 3-dehydrogenase  33.04 
 
 		 345 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1862  L-threonine 3-dehydrogenase  33.33 
 
 		 345 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3939  L-threonine 3-dehydrogenase  30.17 
 
 		 341 aa  162  7e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27746  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3926  L-threonine 3-dehydrogenase  30.75 
 
 		 341 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4033  L-threonine 3-dehydrogenase  30.75 
 
 		 341 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3988  L-threonine 3-dehydrogenase  30.75 
 
 		 341 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0121  L-threonine 3-dehydrogenase  29.86 
 
 		 341 aa  162  8.000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  29.6 
 
 		 341 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0100  L-threonine 3-dehydrogenase  29.6 
 
 		 341 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.173553 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0119  L-threonine 3-dehydrogenase  30.75 
 
 		 341 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2095  L-threonine 3-dehydrogenase  33.62 
 
 		 345 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  29.6 
 
 		 341 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2686  L-threonine 3-dehydrogenase  31.01 
 
 		 345 aa  161  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00603723  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.58 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  31.4 
 
 		 345 aa  160  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4120  L-threonine 3-dehydrogenase  30.17 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.357417  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3901  L-threonine 3-dehydrogenase  29.89 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00409651  normal  0.55097 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4105  L-threonine 3-dehydrogenase  29.89 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287848  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  34.03 
 
 		 344 aa  160  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4989  L-threonine 3-dehydrogenase  30.17 
 
 		 341 aa  160  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.91 
 
 		 342 aa  159  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.15 
 
 		 336 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  29.6 
 
 		 341 aa  159  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8852  L-threonine 3-dehydrogenase  34.48 
 
 		 342 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.81 
 
 		 356 aa  159  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0837  L-threonine 3-dehydrogenase  29.28 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178921  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0739  L-threonine 3-dehydrogenase  30.84 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0530  L-threonine 3-dehydrogenase  30.43 
 
 		 345 aa  158  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1589  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.9 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4286  L-threonine 3-dehydrogenase  29.31 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000588728 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  29.31 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  29.31 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0757  L-threonine 3-dehydrogenase  30.84 
 
 		 340 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2224  L-threonine 3-dehydrogenase  31.88 
 
 		 344 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3920  L-threonine 3-dehydrogenase  30.4 
 
 		 350 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344166  normal  0.087716 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4341  L-threonine 3-dehydrogenase  29.02 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0449  L-threonine 3-dehydrogenase  33.04 
 
 		 361 aa  157  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.08 
 
 		 341 aa  156  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1995  L-threonine 3-dehydrogenase  30.14 
 
 		 348 aa  155  7e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.271324  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0201  L-threonine 3-dehydrogenase  30.14 
 
 		 342 aa  155  7e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4479  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.54 
 
 		 347 aa  155  8e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.522798  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3728  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.39 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854934  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0609  alcohol dehydrogenase  37.69 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0295083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2268  alcohol dehydrogenase  32.37 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.396502  hitchhiker  0.0088894 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.46 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  37.69 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  35.96 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0642  alcohol dehydrogenase  37.39 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0159  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.39 
 
 		 347 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.306594  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10170  L-threonine 3-dehydrogenase  35.8 
 
 		 348 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0537  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.8 
 
 		 325 aa  152  7e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00294504  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2661  L-threonine 3-dehydrogenase  30.86 
 
 		 346 aa  152  8e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3221  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.58 
 
 		 358 aa  152  8e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000142115  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 		 344 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.120973 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00067  L-threonine 3-dehydrogenase  29.28 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0807  alcohol dehydrogenase  36.76 
 
 		 346 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0463124 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2958  L-threonine 3-dehydrogenase  30.14 
 
 		 345 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108215  normal  0.634974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>