More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1589 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1589  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  100 
 
 
341 aa  662    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.1 
 
 
347 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3875  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.66 
 
 
344 aa  211  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.177678  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4479  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.03 
 
 
347 aa  202  6e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.522798  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3746  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.65 
 
 
349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427157  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1789  alcohol dehydrogenase  40.52 
 
 
343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.490533  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0338  alcohol dehydrogenase  42.72 
 
 
352 aa  189  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2272  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.78 
 
 
349 aa  180  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  36.8 
 
 
344 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.65 
 
 
341 aa  175  8e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0233  alcohol dehydrogenase  31.32 
 
 
351 aa  166  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0239  alcohol dehydrogenase  31.32 
 
 
351 aa  166  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0449  L-threonine 3-dehydrogenase  32.38 
 
 
361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  38.07 
 
 
352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8852  L-threonine 3-dehydrogenase  33.43 
 
 
342 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2268  alcohol dehydrogenase  33.72 
 
 
358 aa  160  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.396502  hitchhiker  0.0088894 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3324  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.55 
 
 
344 aa  160  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000796968  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  37.15 
 
 
373 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0619  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.12 
 
 
339 aa  159  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2700  L-threonine 3-dehydrogenase  31.92 
 
 
345 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
356 aa  159  9e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.24 
 
 
329 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4187  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.9 
 
 
335 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0121  L-threonine 3-dehydrogenase  30.26 
 
 
341 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0175  L-threonine 3-dehydrogenase  32.17 
 
 
341 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348381  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05001  L-threonine 3-dehydrogenase  30.12 
 
 
360 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0072  L-threonine 3-dehydrogenase  31.61 
 
 
341 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4144  L-threonine 3-dehydrogenase  31.61 
 
 
341 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.498759  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
327 aa  157  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.59 
 
 
373 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.59 
 
 
373 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  36.59 
 
 
373 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  36.59 
 
 
373 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3944  L-threonine 3-dehydrogenase  32.46 
 
 
342 aa  156  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1530  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.57 
 
 
367 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540116  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0066  L-threonine 3-dehydrogenase  31.41 
 
 
341 aa  156  6e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  36.13 
 
 
373 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2145  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  37.36 
 
 
346 aa  155  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552645  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2224  L-threonine 3-dehydrogenase  32.57 
 
 
344 aa  155  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2958  L-threonine 3-dehydrogenase  31.23 
 
 
345 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108215  normal  0.634974 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0089  L-threonine 3-dehydrogenase  30.75 
 
 
341 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0537  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.82 
 
 
325 aa  155  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00294504  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2661  L-threonine 3-dehydrogenase  32.46 
 
 
346 aa  155  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3953  L-threonine 3-dehydrogenase  30.46 
 
 
341 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0503034  normal  0.824331 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4989  L-threonine 3-dehydrogenase  30.46 
 
 
341 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.014  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0106  L-threonine 3-dehydrogenase  30.37 
 
 
341 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588963  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  30.66 
 
 
341 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03474  L-threonine 3-dehydrogenase  30.46 
 
 
341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0601715  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3828  L-threonine 3-dehydrogenase  30.46 
 
 
341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4286  L-threonine 3-dehydrogenase  29.8 
 
 
341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588728 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03425  hypothetical protein  30.46 
 
 
341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4044  L-threonine 3-dehydrogenase  30.46 
 
 
341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  30.09 
 
 
341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  29.8 
 
 
341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.57 
 
 
336 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0092  L-threonine 3-dehydrogenase  30.46 
 
 
341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.212636  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  29.8 
 
 
341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.71 
 
 
337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0806  L-threonine 3-dehydrogenase  30.72 
 
 
345 aa  153  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.384791  normal  0.0311544 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1862  L-threonine 3-dehydrogenase  32.86 
 
 
345 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4341  L-threonine 3-dehydrogenase  29.51 
 
 
341 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1783  L-threonine 3-dehydrogenase  32.58 
 
 
345 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001213  L-threonine 3-dehydrogenase  29.52 
 
 
343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  29.51 
 
 
341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2931  L-threonine 3-dehydrogenase  32.66 
 
 
343 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.217588  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0119  L-threonine 3-dehydrogenase  29.97 
 
 
341 aa  152  8.999999999999999e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.06 
 
 
336 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3710  L-threonine 3-dehydrogenase  30.37 
 
 
341 aa  152  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187743  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3901  L-threonine 3-dehydrogenase  29.23 
 
 
341 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00409651  normal  0.55097 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0100  L-threonine 3-dehydrogenase  30.37 
 
 
341 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.173553 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4105  L-threonine 3-dehydrogenase  29.23 
 
 
341 aa  152  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287848  normal  0.406165 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00443  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04620)  30.66 
 
 
348 aa  150  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  35.47 
 
 
346 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0797  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.18 
 
 
338 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121673  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  28.94 
 
 
341 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4120  L-threonine 3-dehydrogenase  30.17 
 
 
341 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.357417  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4823  L-threonine 3-dehydrogenase  30.17 
 
 
341 aa  151  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204753 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0788  alcohol dehydrogenase  31.91 
 
 
349 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  28.94 
 
 
341 aa  150  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3926  L-threonine 3-dehydrogenase  29.89 
 
 
341 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3907  L-threonine 3-dehydrogenase  29.89 
 
 
341 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2095  L-threonine 3-dehydrogenase  32.29 
 
 
345 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4094  L-threonine 3-dehydrogenase  29.89 
 
 
341 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3988  L-threonine 3-dehydrogenase  29.89 
 
 
341 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2797  L-threonine 3-dehydrogenase  32.1 
 
 
343 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.242425  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4033  L-threonine 3-dehydrogenase  29.89 
 
 
341 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2061  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.58 
 
 
358 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764117 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02513  L-threonine 3-dehydrogenase  31.01 
 
 
344 aa  149  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0201  L-threonine 3-dehydrogenase  30.95 
 
 
342 aa  149  5e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0127  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.08 
 
 
345 aa  149  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1995  L-threonine 3-dehydrogenase  30.95 
 
 
348 aa  149  7e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.271324  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  30.52 
 
 
336 aa  149  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3221  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.73 
 
 
358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000142115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1866  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.3 
 
 
358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004473  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37 
 
 
323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  34.77 
 
 
339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2551  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.08 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163607  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4706  alcohol dehydrogenase  34.11 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7003  L-threonine 3-dehydrogenase  29.83 
 
 
343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1861  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.3 
 
 
358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000288752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>