More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3221 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2000  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  84.64 
 
 
358 aa  649    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0176077  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01745  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  84.36 
 
 
358 aa  646    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.741595  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1866  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  84.64 
 
 
358 aa  649    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004473  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01733  hypothetical protein  84.36 
 
 
358 aa  646    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3221  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
358 aa  733    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000142115  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1861  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  84.64 
 
 
358 aa  649    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000288752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1856  alcohol dehydrogenase  84.36 
 
 
358 aa  647    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000020196 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2500  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  84.64 
 
 
358 aa  649    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0119751  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1415  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  84.64 
 
 
358 aa  649    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.297309  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2061  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  85.47 
 
 
358 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764117 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2272  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.18 
 
 
349 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3793  L-threonine 3-dehydrogenase  32.61 
 
 
341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0698  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.87 
 
 
349 aa  184  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4086  L-threonine 3-dehydrogenase  32.87 
 
 
343 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  32.6 
 
 
343 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0006  L-threonine 3-dehydrogenase  32.7 
 
 
343 aa  176  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4144  L-threonine 3-dehydrogenase  32.34 
 
 
341 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.498759  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0072  L-threonine 3-dehydrogenase  32.34 
 
 
341 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0066  L-threonine 3-dehydrogenase  32.34 
 
 
341 aa  176  7e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0119  L-threonine 3-dehydrogenase  31.97 
 
 
341 aa  176  7e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0006  L-threonine 3-dehydrogenase  32.43 
 
 
343 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1512  L-threonine 3-dehydrogenase  32.43 
 
 
343 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0006  L-threonine 3-dehydrogenase  32.43 
 
 
343 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0007  L-threonine 3-dehydrogenase  32.43 
 
 
343 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.237262  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0175  L-threonine 3-dehydrogenase  31.77 
 
 
341 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348381  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0006  L-threonine 3-dehydrogenase  32.43 
 
 
343 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936478  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1152  L-threonine 3-dehydrogenase  32.43 
 
 
343 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1432  L-threonine 3-dehydrogenase  32.43 
 
 
343 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0089  L-threonine 3-dehydrogenase  31.69 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03474  L-threonine 3-dehydrogenase  31.42 
 
 
341 aa  173  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0601715  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4044  L-threonine 3-dehydrogenase  31.42 
 
 
341 aa  173  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  31.49 
 
 
341 aa  173  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0092  L-threonine 3-dehydrogenase  31.42 
 
 
341 aa  173  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.212636  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4989  L-threonine 3-dehydrogenase  31.42 
 
 
341 aa  173  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.014  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3828  L-threonine 3-dehydrogenase  31.42 
 
 
341 aa  173  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03425  hypothetical protein  31.42 
 
 
341 aa  173  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3953  L-threonine 3-dehydrogenase  31.42 
 
 
341 aa  173  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0503034  normal  0.824331 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4823  L-threonine 3-dehydrogenase  31.25 
 
 
341 aa  172  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204753 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3178  L-threonine 3-dehydrogenase  31.61 
 
 
342 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3988  L-threonine 3-dehydrogenase  31.15 
 
 
341 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4033  L-threonine 3-dehydrogenase  31.15 
 
 
341 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2095  L-threonine 3-dehydrogenase  30.47 
 
 
345 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5320  L-threonine 3-dehydrogenase  31.61 
 
 
342 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4094  L-threonine 3-dehydrogenase  31.15 
 
 
341 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3926  L-threonine 3-dehydrogenase  31.15 
 
 
341 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3944  L-threonine 3-dehydrogenase  31.22 
 
 
342 aa  171  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3907  L-threonine 3-dehydrogenase  31.15 
 
 
341 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1862  L-threonine 3-dehydrogenase  30.47 
 
 
345 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1783  L-threonine 3-dehydrogenase  30.47 
 
 
345 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  30.94 
 
 
341 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0530  L-threonine 3-dehydrogenase  31.52 
 
 
345 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4535  L-threonine 3-dehydrogenase  31.34 
 
 
342 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5157  L-threonine 3-dehydrogenase  31.34 
 
 
342 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3116  L-threonine 3-dehydrogenase  31.61 
 
 
342 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.717555 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3901  L-threonine 3-dehydrogenase  30.94 
 
 
341 aa  170  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00409651  normal  0.55097 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5702  L-threonine 3-dehydrogenase  31.34 
 
 
342 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495023 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4105  L-threonine 3-dehydrogenase  30.94 
 
 
341 aa  170  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287848  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  30.66 
 
 
341 aa  170  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4973  L-threonine 3-dehydrogenase  31.34 
 
 
342 aa  170  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.554494  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4341  L-threonine 3-dehydrogenase  31.15 
 
 
341 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0233  alcohol dehydrogenase  29.89 
 
 
351 aa  169  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0239  alcohol dehydrogenase  29.89 
 
 
351 aa  169  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4160  L-threonine 3-dehydrogenase  31.06 
 
 
342 aa  169  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4120  L-threonine 3-dehydrogenase  30.87 
 
 
341 aa  169  9e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.357417  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  30.94 
 
 
341 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  30.94 
 
 
341 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4286  L-threonine 3-dehydrogenase  30.94 
 
 
341 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588728 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  30.39 
 
 
341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2931  L-threonine 3-dehydrogenase  31.34 
 
 
343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.217588  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0449  L-threonine 3-dehydrogenase  30.58 
 
 
361 aa  167  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  30.11 
 
 
341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3710  L-threonine 3-dehydrogenase  30.11 
 
 
341 aa  166  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187743  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7003  L-threonine 3-dehydrogenase  30.52 
 
 
343 aa  166  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0444  L-threonine 3-dehydrogenase  30.96 
 
 
344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  29.86 
 
 
355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3939  L-threonine 3-dehydrogenase  29.56 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27746  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0106  L-threonine 3-dehydrogenase  29.83 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588963  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2958  L-threonine 3-dehydrogenase  30.96 
 
 
345 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108215  normal  0.634974 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00067  L-threonine 3-dehydrogenase  30.52 
 
 
341 aa  164  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3020  L-threonine 3-dehydrogenase  30.52 
 
 
343 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1804  alcohol dehydrogenase  29.26 
 
 
349 aa  164  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2700  L-threonine 3-dehydrogenase  30.96 
 
 
345 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0757  L-threonine 3-dehydrogenase  30.52 
 
 
340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0739  L-threonine 3-dehydrogenase  30.52 
 
 
340 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1995  L-threonine 3-dehydrogenase  30.39 
 
 
348 aa  160  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.271324  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0201  L-threonine 3-dehydrogenase  30.39 
 
 
342 aa  160  3e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1028  L-threonine 3-dehydrogenase  30.3 
 
 
347 aa  160  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1594  L-threonine 3-dehydrogenase  32.24 
 
 
342 aa  160  4e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.073313  normal  0.583452 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0100  L-threonine 3-dehydrogenase  28.73 
 
 
341 aa  159  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.173553 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1347  alcohol dehydrogenase  31.05 
 
 
343 aa  159  8e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.71457  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2076  L-threonine 3-dehydrogenase  30.57 
 
 
342 aa  158  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0654334  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1218  alcohol dehydrogenase  31.04 
 
 
361 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852101  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0062  L-threonine 3-dehydrogenase  30.19 
 
 
340 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2224  L-threonine 3-dehydrogenase  30.41 
 
 
344 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.86 
 
 
350 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  29.86 
 
 
350 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.86 
 
 
350 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  30.14 
 
 
350 aa  157  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3616  L-threonine 3-dehydrogenase  28.73 
 
 
342 aa  157  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00121447  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.86 
 
 
350 aa  157  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>