More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2272 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2272  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
349 aa  701    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0239  alcohol dehydrogenase  37.39 
 
 
351 aa  227  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0233  alcohol dehydrogenase  37.39 
 
 
351 aa  227  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3324  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.32 
 
 
344 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000796968  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.05 
 
 
347 aa  200  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3221  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.18 
 
 
358 aa  194  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000142115  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2061  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.21 
 
 
358 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764117 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01745  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  31.16 
 
 
358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.741595  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4187  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.89 
 
 
335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01733  hypothetical protein  31.16 
 
 
358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1866  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.16 
 
 
358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004473  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1861  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.16 
 
 
358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000288752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2095  L-threonine 3-dehydrogenase  35.55 
 
 
345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3875  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.3 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.177678  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2500  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.16 
 
 
358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0119751  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2000  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.16 
 
 
358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0176077  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1415  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.16 
 
 
358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.297309  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1856  alcohol dehydrogenase  31.16 
 
 
358 aa  183  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000020196 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1783  L-threonine 3-dehydrogenase  35.63 
 
 
345 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1862  L-threonine 3-dehydrogenase  35.34 
 
 
345 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1589  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.78 
 
 
341 aa  180  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4479  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.55 
 
 
347 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.522798  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 
345 aa  175  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  31.7 
 
 
341 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  31.21 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  31.21 
 
 
341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5082  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.63 
 
 
333 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.206655  normal  0.31977 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4823  L-threonine 3-dehydrogenase  31.79 
 
 
341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204753 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0806  L-threonine 3-dehydrogenase  31.81 
 
 
345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.384791  normal  0.0311544 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3901  L-threonine 3-dehydrogenase  31.21 
 
 
341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00409651  normal  0.55097 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4105  L-threonine 3-dehydrogenase  31.21 
 
 
341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287848  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02513  L-threonine 3-dehydrogenase  31.52 
 
 
344 aa  173  5e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  30.64 
 
 
341 aa  173  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3710  L-threonine 3-dehydrogenase  31.7 
 
 
341 aa  172  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187743  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00067  L-threonine 3-dehydrogenase  31.21 
 
 
341 aa  172  7.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3944  L-threonine 3-dehydrogenase  32.37 
 
 
342 aa  172  9e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0089  L-threonine 3-dehydrogenase  31.5 
 
 
341 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0119  L-threonine 3-dehydrogenase  31.5 
 
 
341 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3953  L-threonine 3-dehydrogenase  31.21 
 
 
341 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0503034  normal  0.824331 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0739  L-threonine 3-dehydrogenase  32.08 
 
 
340 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4144  L-threonine 3-dehydrogenase  31.21 
 
 
341 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.498759  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  31.41 
 
 
341 aa  171  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0072  L-threonine 3-dehydrogenase  31.21 
 
 
341 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4341  L-threonine 3-dehydrogenase  31.12 
 
 
341 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03474  L-threonine 3-dehydrogenase  31.21 
 
 
341 aa  170  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0601715  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3828  L-threonine 3-dehydrogenase  31.21 
 
 
341 aa  170  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03425  hypothetical protein  31.21 
 
 
341 aa  170  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0757  L-threonine 3-dehydrogenase  32.08 
 
 
340 aa  171  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0092  L-threonine 3-dehydrogenase  31.21 
 
 
341 aa  170  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.212636  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0106  L-threonine 3-dehydrogenase  31.7 
 
 
341 aa  170  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588963  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2700  L-threonine 3-dehydrogenase  32.56 
 
 
345 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.84 
 
 
342 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4044  L-threonine 3-dehydrogenase  31.21 
 
 
341 aa  170  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4989  L-threonine 3-dehydrogenase  31.21 
 
 
341 aa  170  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.014  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3939  L-threonine 3-dehydrogenase  31.99 
 
 
341 aa  171  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27746  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2931  L-threonine 3-dehydrogenase  33.24 
 
 
343 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.217588  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0175  L-threonine 3-dehydrogenase  32.37 
 
 
341 aa  169  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348381  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3988  L-threonine 3-dehydrogenase  31.5 
 
 
341 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4033  L-threonine 3-dehydrogenase  31.5 
 
 
341 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0066  L-threonine 3-dehydrogenase  30.92 
 
 
341 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4094  L-threonine 3-dehydrogenase  31.5 
 
 
341 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  30.35 
 
 
341 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2958  L-threonine 3-dehydrogenase  31.99 
 
 
345 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108215  normal  0.634974 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  30.35 
 
 
341 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4286  L-threonine 3-dehydrogenase  30.35 
 
 
341 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588728 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3907  L-threonine 3-dehydrogenase  31.5 
 
 
341 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3926  L-threonine 3-dehydrogenase  31.5 
 
 
341 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4120  L-threonine 3-dehydrogenase  30.92 
 
 
341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.357417  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  31.61 
 
 
343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0100  L-threonine 3-dehydrogenase  31.7 
 
 
341 aa  166  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.173553 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.41 
 
 
341 aa  166  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4086  L-threonine 3-dehydrogenase  31.41 
 
 
343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0062  L-threonine 3-dehydrogenase  30.84 
 
 
340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001213  L-threonine 3-dehydrogenase  30.68 
 
 
343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0233  L-threonine 3-dehydrogenase  31.01 
 
 
345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.43371 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3616  L-threonine 3-dehydrogenase  31.41 
 
 
342 aa  164  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00121447  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3793  L-threonine 3-dehydrogenase  29.8 
 
 
341 aa  164  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  32 
 
 
341 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05001  L-threonine 3-dehydrogenase  30.68 
 
 
360 aa  164  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  32 
 
 
341 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  31.69 
 
 
341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0121  L-threonine 3-dehydrogenase  30.84 
 
 
341 aa  162  6e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1995  L-threonine 3-dehydrogenase  31.7 
 
 
348 aa  162  7e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.271324  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0201  L-threonine 3-dehydrogenase  31.7 
 
 
342 aa  162  7e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0125  alcohol dehydrogenase  34.08 
 
 
350 aa  162  9e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0844378  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  31.79 
 
 
341 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2224  L-threonine 3-dehydrogenase  32.76 
 
 
344 aa  160  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03240  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  31.84 
 
 
358 aa  159  8e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129511  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0359  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.09 
 
 
366 aa  158  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0444  L-threonine 3-dehydrogenase  31.99 
 
 
344 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0745  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  32.62 
 
 
360 aa  159  1e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0353  L-threonine 3-dehydrogenase  29.5 
 
 
343 aa  159  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0788  alcohol dehydrogenase  33.8 
 
 
349 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0837  L-threonine 3-dehydrogenase  30.59 
 
 
343 aa  157  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178921  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2076  L-threonine 3-dehydrogenase  31.72 
 
 
342 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0654334  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  35.36 
 
 
373 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2661  L-threonine 3-dehydrogenase  32.57 
 
 
346 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0952  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.87 
 
 
359 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000662515  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4973  L-threonine 3-dehydrogenase  30.64 
 
 
342 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.554494  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2686  L-threonine 3-dehydrogenase  30.95 
 
 
345 aa  156  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00603723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>