More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4479 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013745  Htur_4479  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
347 aa  694    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.522798  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  77.23 
 
 
347 aa  555  1e-157  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3875  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.8 
 
 
344 aa  351  8.999999999999999e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.177678  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1589  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.03 
 
 
341 aa  216  4e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  36.36 
 
 
338 aa  206  5e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0233  alcohol dehydrogenase  35.17 
 
 
351 aa  199  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0239  alcohol dehydrogenase  35.17 
 
 
351 aa  199  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2551  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.67 
 
 
341 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163607  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2272  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.31 
 
 
349 aa  183  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5082  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.73 
 
 
333 aa  179  8e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.206655  normal  0.31977 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 
345 aa  174  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3592  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.17 
 
 
347 aa  172  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167683  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  35.12 
 
 
337 aa  170  4e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0530  L-threonine 3-dehydrogenase  29.43 
 
 
345 aa  168  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2095  L-threonine 3-dehydrogenase  32.29 
 
 
345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4973  L-threonine 3-dehydrogenase  29.02 
 
 
342 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.554494  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1783  L-threonine 3-dehydrogenase  31.73 
 
 
345 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0100  L-threonine 3-dehydrogenase  30.06 
 
 
341 aa  166  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.173553 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5320  L-threonine 3-dehydrogenase  28.74 
 
 
342 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1862  L-threonine 3-dehydrogenase  31.73 
 
 
345 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4187  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.54 
 
 
335 aa  166  6.9999999999999995e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3116  L-threonine 3-dehydrogenase  28.74 
 
 
342 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.717555 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  32.5 
 
 
327 aa  166  8e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3178  L-threonine 3-dehydrogenase  28.53 
 
 
342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4160  L-threonine 3-dehydrogenase  28.16 
 
 
342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  29.19 
 
 
341 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5157  L-threonine 3-dehydrogenase  28.53 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4535  L-threonine 3-dehydrogenase  28.53 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5702  L-threonine 3-dehydrogenase  28.53 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7003  L-threonine 3-dehydrogenase  28.45 
 
 
343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.33 
 
 
340 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  29.28 
 
 
341 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3939  L-threonine 3-dehydrogenase  29.77 
 
 
341 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27746  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0006  L-threonine 3-dehydrogenase  27.95 
 
 
343 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1512  L-threonine 3-dehydrogenase  27.95 
 
 
343 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1152  L-threonine 3-dehydrogenase  27.95 
 
 
343 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1432  L-threonine 3-dehydrogenase  27.95 
 
 
343 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0006  L-threonine 3-dehydrogenase  27.95 
 
 
343 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936478  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0006  L-threonine 3-dehydrogenase  27.95 
 
 
343 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0007  L-threonine 3-dehydrogenase  27.95 
 
 
343 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.237262  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  29.28 
 
 
341 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3901  L-threonine 3-dehydrogenase  29.28 
 
 
341 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00409651  normal  0.55097 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4105  L-threonine 3-dehydrogenase  29.28 
 
 
341 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287848  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2686  L-threonine 3-dehydrogenase  29.89 
 
 
345 aa  162  9e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00603723  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.15 
 
 
350 aa  162  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  33.94 
 
 
350 aa  162  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  33.94 
 
 
350 aa  162  9e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0106  L-threonine 3-dehydrogenase  29.48 
 
 
341 aa  162  9e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588963  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3020  L-threonine 3-dehydrogenase  28.16 
 
 
343 aa  162  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.94 
 
 
350 aa  162  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0948  putative L-idonate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  35.44 
 
 
344 aa  161  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05001  L-threonine 3-dehydrogenase  29.19 
 
 
360 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0006  L-threonine 3-dehydrogenase  27.95 
 
 
343 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.64 
 
 
350 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0619  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.31 
 
 
339 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.64 
 
 
350 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4341  L-threonine 3-dehydrogenase  28.7 
 
 
341 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  28.7 
 
 
341 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0449  L-threonine 3-dehydrogenase  30.35 
 
 
361 aa  161  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  33.94 
 
 
350 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001213  L-threonine 3-dehydrogenase  29.19 
 
 
343 aa  161  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8852  L-threonine 3-dehydrogenase  32.95 
 
 
342 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  28.7 
 
 
341 aa  160  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07150  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  38.65 
 
 
340 aa  160  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439183  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0062  L-threonine 3-dehydrogenase  28.9 
 
 
340 aa  160  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3303  zinc-binding dehydrogenase family protein  31.45 
 
 
338 aa  160  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0731443 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.06 
 
 
344 aa  160  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.64 
 
 
350 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.64 
 
 
350 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  33.64 
 
 
350 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1737  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.68 
 
 
347 aa  159  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3710  L-threonine 3-dehydrogenase  28.99 
 
 
341 aa  159  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187743  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  33.02 
 
 
348 aa  159  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  28.7 
 
 
341 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4286  L-threonine 3-dehydrogenase  28.7 
 
 
341 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588728 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  28.7 
 
 
341 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2059  sorbitol dehydrogenase  32.84 
 
 
347 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  hitchhiker  0.0031409 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0089  L-threonine 3-dehydrogenase  29.48 
 
 
341 aa  159  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3324  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.04 
 
 
344 aa  159  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000796968  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.72 
 
 
341 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.13 
 
 
346 aa  159  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4989  L-threonine 3-dehydrogenase  29.19 
 
 
341 aa  159  8e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.014  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0201  L-threonine 3-dehydrogenase  29.77 
 
 
342 aa  159  8e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1995  L-threonine 3-dehydrogenase  29.77 
 
 
348 aa  159  8e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.271324  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0353  L-threonine 3-dehydrogenase  29.19 
 
 
343 aa  159  9e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03474  L-threonine 3-dehydrogenase  29.19 
 
 
341 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0601715  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3828  L-threonine 3-dehydrogenase  29.19 
 
 
341 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03425  hypothetical protein  29.19 
 
 
341 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3953  L-threonine 3-dehydrogenase  29.19 
 
 
341 aa  158  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0503034  normal  0.824331 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0092  L-threonine 3-dehydrogenase  29.19 
 
 
341 aa  158  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.212636  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4044  L-threonine 3-dehydrogenase  29.19 
 
 
341 aa  158  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  33.76 
 
 
356 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4094  L-threonine 3-dehydrogenase  29.39 
 
 
341 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3907  L-threonine 3-dehydrogenase  29.39 
 
 
341 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3221  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.77 
 
 
358 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000142115  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4033  L-threonine 3-dehydrogenase  29.39 
 
 
341 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2931  L-threonine 3-dehydrogenase  30.06 
 
 
343 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.217588  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3926  L-threonine 3-dehydrogenase  29.39 
 
 
341 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3988  L-threonine 3-dehydrogenase  29.39 
 
 
341 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.72 
 
 
341 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>