More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1286 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  100 
 
 
346 aa  704    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  54.81 
 
 
345 aa  397  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1804  alcohol dehydrogenase  38.66 
 
 
349 aa  253  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.05 
 
 
344 aa  249  4e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1530  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.06 
 
 
367 aa  248  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540116  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4221  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.9 
 
 
346 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.41128  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5268  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.93 
 
 
346 aa  228  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.26 
 
 
346 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7070  alcohol dehydrogenase  37.46 
 
 
346 aa  223  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2145  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  37.36 
 
 
346 aa  222  7e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552645  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  36.99 
 
 
346 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1030  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.31 
 
 
346 aa  218  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0743662  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  37.32 
 
 
337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5590  alcohol dehydrogenase  35.9 
 
 
354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1218  alcohol dehydrogenase  35.04 
 
 
361 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852101  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0041  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.16 
 
 
341 aa  211  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000412094  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3405  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.24 
 
 
348 aa  211  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0198026  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3165  alcohol dehydrogenase  35.61 
 
 
352 aa  209  8e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3256  alcohol dehydrogenase  34.76 
 
 
345 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1079  alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 
342 aa  207  3e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  36.56 
 
 
336 aa  204  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0196  alcohol dehydrogenase  34.59 
 
 
338 aa  202  5e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.583804  normal  0.0665338 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0970  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.52 
 
 
345 aa  197  3e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4579  alcohol dehydrogenase  34.72 
 
 
373 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.66 
 
 
335 aa  192  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.04 
 
 
342 aa  192  6e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.22 
 
 
341 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5466  alcohol dehydrogenase  33.71 
 
 
362 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.0829425 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3550  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.71 
 
 
362 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4817  alcohol dehydrogenase  33.71 
 
 
362 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.562057  normal  0.226619 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4721  alcohol dehydrogenase  33.71 
 
 
362 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.36355 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0246  alcohol dehydrogenase  35.35 
 
 
343 aa  189  8e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000123303  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4198  alcohol dehydrogenase  33.71 
 
 
362 aa  188  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.78 
 
 
336 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0887  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.15 
 
 
362 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3786  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
369 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0107971 
 
 
-
 
NC_002936  DET0125  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.2 
 
 
341 aa  186  3e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000121162  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0503  alcohol dehydrogenase  32.58 
 
 
362 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472686 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1195  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.97 
 
 
353 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184304  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0860  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.97 
 
 
363 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183529  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1639  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.97 
 
 
363 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.514454  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1911  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.97 
 
 
363 aa  185  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.197112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1924  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.97 
 
 
363 aa  185  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0301  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.97 
 
 
430 aa  185  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0487501  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2432  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  33.82 
 
 
363 aa  185  9e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319398  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3233  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.82 
 
 
365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2072  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.97 
 
 
422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.055624  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.31 
 
 
343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00243149  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1610  alcohol dehydrogenase  32.58 
 
 
408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1506  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  32.58 
 
 
408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000397792  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1762  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  32.58 
 
 
355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0108342  hitchhiker  0.000113364 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0239  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
351 aa  184  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1744  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
345 aa  184  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.681848  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0233  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
351 aa  184  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2347  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.62 
 
 
341 aa  182  8.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.174722  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.56 
 
 
336 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2220  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.64 
 
 
343 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.135715 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.78 
 
 
342 aa  179  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.15 
 
 
340 aa  178  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
344 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  32.76 
 
 
341 aa  176  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3901  L-threonine 3-dehydrogenase  32.47 
 
 
341 aa  176  8e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00409651  normal  0.55097 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4105  L-threonine 3-dehydrogenase  32.47 
 
 
341 aa  176  8e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287848  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.59 
 
 
354 aa  175  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  34.48 
 
 
339 aa  175  9e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0626  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.94 
 
 
348 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.122576  normal  0.0367599 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  34.01 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  32.18 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22030  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  30.42 
 
 
375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255526  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  33.97 
 
 
340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  32.47 
 
 
341 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  32.47 
 
 
341 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4286  L-threonine 3-dehydrogenase  32.47 
 
 
341 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588728 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  33.72 
 
 
365 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.72 
 
 
354 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  31.9 
 
 
341 aa  171  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4341  L-threonine 3-dehydrogenase  32.18 
 
 
341 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  33.33 
 
 
338 aa  171  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1007  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  32.29 
 
 
351 aa  171  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  33.93 
 
 
354 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0075  sorbitol dehydrogenase, putative  30 
 
 
348 aa  170  4e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  33.93 
 
 
354 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0359  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.36 
 
 
366 aa  169  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00067  L-threonine 3-dehydrogenase  31.9 
 
 
341 aa  169  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0780  L-threonine 3-dehydrogenase  31.91 
 
 
348 aa  169  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0154  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.49 
 
 
356 aa  168  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  33.82 
 
 
364 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0341  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.01 
 
 
379 aa  169  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.384488  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  32.49 
 
 
373 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0953  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.06 
 
 
336 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00776384  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  34.44 
 
 
363 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  33.01 
 
 
337 aa  167  2e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.58 
 
 
347 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1170  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.02 
 
 
349 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0065  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.72 
 
 
340 aa  166  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2463  alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 
338 aa  166  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2958  L-threonine 3-dehydrogenase  30.75 
 
 
345 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108215  normal  0.634974 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0062  L-threonine 3-dehydrogenase  29.97 
 
 
340 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  34.44 
 
 
363 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0059  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.41 
 
 
340 aa  165  8e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>