More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01745 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01745  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  100 
 
 		 358 aa  736    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.741595  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1866  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  99.72 
 
 		 358 aa  732    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004473  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1856  alcohol dehydrogenase  99.16 
 
 		 358 aa  728    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000020196 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2000  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  99.44 
 
 		 358 aa  730    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0176077  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3221  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  84.36 
 
 		 358 aa  646    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000142115  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2061  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  95.53 
 
 		 358 aa  707    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764117 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01733  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  736    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1415  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  99.44 
 
 		 358 aa  730    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.297309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2500  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  99.44 
 
 		 358 aa  730    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0119751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1861  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  99.44 
 
 		 358 aa  730    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000288752  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2272  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.16 
 
 		 349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0698  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.78 
 
 		 349 aa  173  5e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3793  L-threonine 3-dehydrogenase  31.62 
 
 		 341 aa  169  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4144  L-threonine 3-dehydrogenase  31.25 
 
 		 341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.498759  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0072  L-threonine 3-dehydrogenase  31.25 
 
 		 341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4823  L-threonine 3-dehydrogenase  31.25 
 
 		 341 aa  167  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204753 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0066  L-threonine 3-dehydrogenase  31.25 
 
 		 341 aa  166  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0119  L-threonine 3-dehydrogenase  31.15 
 
 		 341 aa  166  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  29.83 
 
 		 343 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4086  L-threonine 3-dehydrogenase  29.83 
 
 		 343 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1783  L-threonine 3-dehydrogenase  30.47 
 
 		 345 aa  165  9e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2931  L-threonine 3-dehydrogenase  31.86 
 
 		 343 aa  165  9e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.217588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2095  L-threonine 3-dehydrogenase  30.19 
 
 		 345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1862  L-threonine 3-dehydrogenase  30.47 
 
 		 345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0089  L-threonine 3-dehydrogenase  30.87 
 
 		 341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  32.45 
 
 		 355 aa  162  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3953  L-threonine 3-dehydrogenase  30.6 
 
 		 341 aa  162  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0503034  normal  0.824331 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0092  L-threonine 3-dehydrogenase  30.6 
 
 		 341 aa  162  7e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.212636  normal  0.425053 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03474  L-threonine 3-dehydrogenase  30.6 
 
 		 341 aa  162  7e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0601715  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0175  L-threonine 3-dehydrogenase  29.83 
 
 		 341 aa  162  7e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348381  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4044  L-threonine 3-dehydrogenase  30.6 
 
 		 341 aa  162  7e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03425  hypothetical protein  30.6 
 
 		 341 aa  162  7e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3828  L-threonine 3-dehydrogenase  30.6 
 
 		 341 aa  162  7e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4989  L-threonine 3-dehydrogenase  30.6 
 
 		 341 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0449  L-threonine 3-dehydrogenase  30.58 
 
 		 361 aa  161  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4341  L-threonine 3-dehydrogenase  30.11 
 
 		 341 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0444  L-threonine 3-dehydrogenase  32.05 
 
 		 344 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3988  L-threonine 3-dehydrogenase  30.33 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3926  L-threonine 3-dehydrogenase  30.33 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4094  L-threonine 3-dehydrogenase  30.33 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3907  L-threonine 3-dehydrogenase  30.33 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4033  L-threonine 3-dehydrogenase  30.33 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.18 
 
 		 350 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4286  L-threonine 3-dehydrogenase  30.11 
 
 		 341 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000588728 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  32.18 
 
 		 350 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.18 
 
 		 350 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.47 
 
 		 350 aa  160  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.47 
 
 		 350 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  30.11 
 
 		 341 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  30.11 
 
 		 341 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0530  L-threonine 3-dehydrogenase  29.35 
 
 		 345 aa  159  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2958  L-threonine 3-dehydrogenase  31.32 
 
 		 345 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108215  normal  0.634974 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  32.47 
 
 		 350 aa  159  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  32.18 
 
 		 350 aa  159  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  32.18 
 
 		 350 aa  159  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.18 
 
 		 350 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0233  alcohol dehydrogenase  29.59 
 
 		 351 aa  159  8e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0239  alcohol dehydrogenase  29.59 
 
 		 351 aa  159  8e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4120  L-threonine 3-dehydrogenase  30.05 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.357417  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.18 
 
 		 350 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  30.11 
 
 		 341 aa  159  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2700  L-threonine 3-dehydrogenase  31.04 
 
 		 345 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  29.56 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3901  L-threonine 3-dehydrogenase  29.56 
 
 		 341 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00409651  normal  0.55097 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4105  L-threonine 3-dehydrogenase  29.56 
 
 		 341 aa  156  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287848  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  29.28 
 
 		 341 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  29.56 
 
 		 341 aa  155  9e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3944  L-threonine 3-dehydrogenase  28.73 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  29.28 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.07 
 
 		 354 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  32.07 
 
 		 354 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  32.07 
 
 		 365 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3710  L-threonine 3-dehydrogenase  29.28 
 
 		 341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.07 
 
 		 354 aa  153  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  31.58 
 
 		 364 aa  153  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0106  L-threonine 3-dehydrogenase  29.01 
 
 		 341 aa  152  8e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588963  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00067  L-threonine 3-dehydrogenase  29.16 
 
 		 341 aa  151  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3939  L-threonine 3-dehydrogenase  29.56 
 
 		 341 aa  151  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27746  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.28 
 
 		 347 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2268  alcohol dehydrogenase  29.67 
 
 		 358 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.396502  hitchhiker  0.0088894 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  32.48 
 
 		 350 aa  149  5e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0201  L-threonine 3-dehydrogenase  28.73 
 
 		 342 aa  149  5e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0100  L-threonine 3-dehydrogenase  29.01 
 
 		 341 aa  149  6e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.173553 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1347  alcohol dehydrogenase  29.75 
 
 		 343 aa  149  7e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.71457  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1995  L-threonine 3-dehydrogenase  28.73 
 
 		 348 aa  149  8e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.271324  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  31.49 
 
 		 354 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1152  L-threonine 3-dehydrogenase  28.88 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0006  L-threonine 3-dehydrogenase  28.88 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1432  L-threonine 3-dehydrogenase  28.88 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0006  L-threonine 3-dehydrogenase  28.88 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1512  L-threonine 3-dehydrogenase  28.88 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0006  L-threonine 3-dehydrogenase  28.88 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936478  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3616  L-threonine 3-dehydrogenase  29.01 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00121447  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0007  L-threonine 3-dehydrogenase  28.88 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.237262  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0006  L-threonine 3-dehydrogenase  28.88 
 
 		 343 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1589  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.3 
 
 		 341 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05001  L-threonine 3-dehydrogenase  27.99 
 
 		 360 aa  147  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  31.2 
 
 		 354 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5320  L-threonine 3-dehydrogenase  28.61 
 
 		 342 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2224  L-threonine 3-dehydrogenase  30.49 
 
 		 344 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>