More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0698 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0698  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 		 349 aa  701    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2565  L-threonine 3-dehydrogenase  51.71 
 
 		 354 aa  361  1e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3944  L-threonine 3-dehydrogenase  51.21 
 
 		 342 aa  357  9.999999999999999e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0175  L-threonine 3-dehydrogenase  51.52 
 
 		 341 aa  355  5e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348381  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0449  L-threonine 3-dehydrogenase  50 
 
 		 361 aa  346  4e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  48.01 
 
 		 343 aa  344  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4086  L-threonine 3-dehydrogenase  48.62 
 
 		 343 aa  343  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0780  L-threonine 3-dehydrogenase  45.66 
 
 		 348 aa  342  5e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3920  L-threonine 3-dehydrogenase  47.69 
 
 		 350 aa  338  5.9999999999999996e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344166  normal  0.087716 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0293  L-threonine 3-dehydrogenase  46.24 
 
 		 347 aa  338  9.999999999999999e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2661  L-threonine 3-dehydrogenase  48.18 
 
 		 346 aa  337  1.9999999999999998e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4160  L-threonine 3-dehydrogenase  46.99 
 
 		 342 aa  334  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0530  L-threonine 3-dehydrogenase  46.69 
 
 		 345 aa  333  3e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3178  L-threonine 3-dehydrogenase  47.59 
 
 		 342 aa  332  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0006  L-threonine 3-dehydrogenase  47.29 
 
 		 343 aa  332  4e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0006  L-threonine 3-dehydrogenase  46.99 
 
 		 343 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0006  L-threonine 3-dehydrogenase  46.99 
 
 		 343 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936478  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1512  L-threonine 3-dehydrogenase  46.99 
 
 		 343 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0006  L-threonine 3-dehydrogenase  46.99 
 
 		 343 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0007  L-threonine 3-dehydrogenase  46.99 
 
 		 343 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.237262  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1152  L-threonine 3-dehydrogenase  46.99 
 
 		 343 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1432  L-threonine 3-dehydrogenase  46.99 
 
 		 343 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0121  L-threonine 3-dehydrogenase  44.55 
 
 		 341 aa  331  1e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1347  alcohol dehydrogenase  45.95 
 
 		 343 aa  331  1e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.71457  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0072  L-threonine 3-dehydrogenase  47.11 
 
 		 341 aa  331  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3939  L-threonine 3-dehydrogenase  46.48 
 
 		 341 aa  331  1e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27746  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4144  L-threonine 3-dehydrogenase  47.11 
 
 		 341 aa  331  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.498759  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3116  L-threonine 3-dehydrogenase  47.59 
 
 		 342 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.717555 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  44.9 
 
 		 341 aa  330  2e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4823  L-threonine 3-dehydrogenase  47.72 
 
 		 341 aa  330  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204753 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5157  L-threonine 3-dehydrogenase  47.29 
 
 		 342 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4973  L-threonine 3-dehydrogenase  47.29 
 
 		 342 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.554494  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5702  L-threonine 3-dehydrogenase  47.29 
 
 		 342 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495023 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  45.87 
 
 		 341 aa  330  2e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7003  L-threonine 3-dehydrogenase  46.08 
 
 		 343 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4535  L-threonine 3-dehydrogenase  47.29 
 
 		 342 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  44.9 
 
 		 341 aa  330  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5320  L-threonine 3-dehydrogenase  47.29 
 
 		 342 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4341  L-threonine 3-dehydrogenase  44.9 
 
 		 341 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0062  L-threonine 3-dehydrogenase  45.19 
 
 		 340 aa  330  3e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3953  L-threonine 3-dehydrogenase  46.79 
 
 		 341 aa  329  4e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0503034  normal  0.824331 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3020  L-threonine 3-dehydrogenase  46.08 
 
 		 343 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  44.61 
 
 		 341 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03474  L-threonine 3-dehydrogenase  46.79 
 
 		 341 aa  329  6e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0601715  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0066  L-threonine 3-dehydrogenase  46.81 
 
 		 341 aa  328  6e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03425  hypothetical protein  46.79 
 
 		 341 aa  329  6e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3901  L-threonine 3-dehydrogenase  44.61 
 
 		 341 aa  328  6e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00409651  normal  0.55097 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0092  L-threonine 3-dehydrogenase  46.79 
 
 		 341 aa  329  6e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.212636  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4044  L-threonine 3-dehydrogenase  46.79 
 
 		 341 aa  329  6e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4105  L-threonine 3-dehydrogenase  44.61 
 
 		 341 aa  328  6e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287848  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3828  L-threonine 3-dehydrogenase  46.79 
 
 		 341 aa  329  6e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4989  L-threonine 3-dehydrogenase  46.79 
 
 		 341 aa  328  6e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1995  L-threonine 3-dehydrogenase  46.08 
 
 		 348 aa  328  7e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.271324  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0201  L-threonine 3-dehydrogenase  46.08 
 
 		 342 aa  328  7e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0119  L-threonine 3-dehydrogenase  46.18 
 
 		 341 aa  328  8e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001213  L-threonine 3-dehydrogenase  45.45 
 
 		 343 aa  328  8e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0089  L-threonine 3-dehydrogenase  46.48 
 
 		 341 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05001  L-threonine 3-dehydrogenase  45.45 
 
 		 360 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00067  L-threonine 3-dehydrogenase  45.48 
 
 		 341 aa  327  1.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4286  L-threonine 3-dehydrogenase  44.61 
 
 		 341 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000588728 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  44.61 
 
 		 341 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  44.61 
 
 		 341 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3926  L-threonine 3-dehydrogenase  46.48 
 
 		 341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4094  L-threonine 3-dehydrogenase  46.48 
 
 		 341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3907  L-threonine 3-dehydrogenase  46.48 
 
 		 341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3988  L-threonine 3-dehydrogenase  46.48 
 
 		 341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4033  L-threonine 3-dehydrogenase  46.48 
 
 		 341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  45.57 
 
 		 341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0353  L-threonine 3-dehydrogenase  44.55 
 
 		 343 aa  326  4.0000000000000003e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0837  L-threonine 3-dehydrogenase  44.55 
 
 		 343 aa  325  5e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178921  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3710  L-threonine 3-dehydrogenase  45.26 
 
 		 341 aa  325  5e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4120  L-threonine 3-dehydrogenase  46.48 
 
 		 341 aa  325  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.357417  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0739  L-threonine 3-dehydrogenase  46.67 
 
 		 340 aa  325  1e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0106  L-threonine 3-dehydrogenase  44.95 
 
 		 341 aa  324  1e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588963  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2686  L-threonine 3-dehydrogenase  47.58 
 
 		 345 aa  323  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00603723  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0757  L-threonine 3-dehydrogenase  46.67 
 
 		 340 aa  323  4e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1306  alcohol dehydrogenase  45.67 
 
 		 348 aa  322  7e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0100  L-threonine 3-dehydrogenase  44.65 
 
 		 341 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.173553 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1853  L-threonine 3-dehydrogenase  45.76 
 
 		 344 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.981388  normal  0.0441816 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2700  L-threonine 3-dehydrogenase  46.36 
 
 		 345 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1028  L-threonine 3-dehydrogenase  47.98 
 
 		 347 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0049  L-threonine 3-dehydrogenase  46.97 
 
 		 347 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000160501 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2224  L-threonine 3-dehydrogenase  47.88 
 
 		 344 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2931  L-threonine 3-dehydrogenase  47.43 
 
 		 343 aa  317  1e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.217588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2958  L-threonine 3-dehydrogenase  45.76 
 
 		 345 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108215  normal  0.634974 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3616  L-threonine 3-dehydrogenase  43.15 
 
 		 342 aa  316  4e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00121447  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2923  L-threonine 3-dehydrogenase  46.67 
 
 		 349 aa  316  4e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0050  L-threonine 3-dehydrogenase  46.36 
 
 		 347 aa  316  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1862  L-threonine 3-dehydrogenase  45.92 
 
 		 345 aa  312  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0444  L-threonine 3-dehydrogenase  47.4 
 
 		 344 aa  312  6.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1783  L-threonine 3-dehydrogenase  45.92 
 
 		 345 aa  311  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2797  L-threonine 3-dehydrogenase  48.01 
 
 		 343 aa  311  1e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.242425  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2095  L-threonine 3-dehydrogenase  46.22 
 
 		 345 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2076  L-threonine 3-dehydrogenase  45.48 
 
 		 342 aa  311  1e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0654334  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0233  L-threonine 3-dehydrogenase  43.73 
 
 		 345 aa  310  2e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.43371 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3793  L-threonine 3-dehydrogenase  42.77 
 
 		 341 aa  310  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0146  alcohol dehydrogenase  40.17 
 
 		 345 aa  304  2.0000000000000002e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02513  L-threonine 3-dehydrogenase  46.06 
 
 		 344 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0806  L-threonine 3-dehydrogenase  45.76 
 
 		 345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.384791  normal  0.0311544 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1310  L-threonine 3-dehydrogenase  47.73 
 
 		 348 aa  303  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>