More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3746 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3746  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 		 349 aa  690    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427157  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0338  alcohol dehydrogenase  70.52 
 
 		 352 aa  441  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4519  alcohol dehydrogenase  45.4 
 
 		 351 aa  258  9e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1589  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  42.94 
 
 		 341 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3875  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.54 
 
 		 344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.177678  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  38.87 
 
 		 352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4187  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.96 
 
 		 335 aa  170  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0788  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 349 aa  170  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5871  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.59 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4898  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.28 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04235  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  34.59 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.767219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3639  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.59 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3697  alcohol dehydrogenase  34.91 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587402 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.59 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0102074  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4903  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.59 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4590  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.59 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00423136  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04201  hypothetical protein  34.59 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.774265  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0698  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.8 
 
 		 349 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0239  alcohol dehydrogenase  32.28 
 
 		 351 aa  166  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0233  alcohol dehydrogenase  32.28 
 
 		 351 aa  166  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.47 
 
 		 336 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0065  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.48 
 
 		 340 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0293  L-threonine 3-dehydrogenase  31.32 
 
 		 347 aa  166  6.9999999999999995e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.61 
 
 		 373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  34.53 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0059  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.75 
 
 		 340 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2551  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.87 
 
 		 341 aa  162  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163607  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5082  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.57 
 
 		 333 aa  162  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.206655  normal  0.31977 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.64 
 
 		 336 aa  162  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.01 
 
 		 347 aa  162  9e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1737  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.77 
 
 		 347 aa  162  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.84 
 
 		 342 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.67 
 
 		 356 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.189858  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2739  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.46 
 
 		 337 aa  160  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.112956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  32.8 
 
 		 337 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0780  L-threonine 3-dehydrogenase  32.18 
 
 		 348 aa  160  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0125  alcohol dehydrogenase  32.58 
 
 		 350 aa  159  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0844378  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.03 
 
 		 373 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  37.03 
 
 		 373 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  35.61 
 
 		 363 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1000  putative alcohol dehydrogenase  38.59 
 
 		 352 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2661  L-threonine 3-dehydrogenase  31.09 
 
 		 346 aa  158  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1548  alcohol dehydrogenase  29.77 
 
 		 350 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0106468  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  36.07 
 
 		 364 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  36.84 
 
 		 373 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3317  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.95 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  hitchhiker  0.0000240679 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  35.31 
 
 		 363 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  36.73 
 
 		 373 aa  155  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5642  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.44 
 
 		 337 aa  155  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2028  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.83 
 
 		 349 aa  155  9e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37466  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3944  L-threonine 3-dehydrogenase  31.46 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.28 
 
 		 346 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.86 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.29 
 
 		 354 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 		 365 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.42 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  34.83 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.71 
 
 		 354 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4479  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.93 
 
 		 347 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.522798  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.65 
 
 		 329 aa  153  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3328  hypothetical protein  34.29 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.463233 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  34.71 
 
 		 354 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0745  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  29.69 
 
 		 360 aa  153  5e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4094  alcohol dehydrogenase  34.91 
 
 		 358 aa  152  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.958788  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0175  L-threonine 3-dehydrogenase  30.99 
 
 		 341 aa  152  8.999999999999999e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348381  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  34.12 
 
 		 362 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2565  L-threonine 3-dehydrogenase  34.28 
 
 		 354 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  35.82 
 
 		 338 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1450  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.36 
 
 		 349 aa  151  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0323675  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1347  alcohol dehydrogenase  27.99 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.71457  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  34.71 
 
 		 354 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0806  L-threonine 3-dehydrogenase  30.29 
 
 		 345 aa  150  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.384791  normal  0.0311544 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0154  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.61 
 
 		 339 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  34.71 
 
 		 354 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05001  L-threonine 3-dehydrogenase  28.32 
 
 		 360 aa  149  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  31.6 
 
 		 359 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1995  L-threonine 3-dehydrogenase  29.53 
 
 		 348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.271324  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1736  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.34 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0444  L-threonine 3-dehydrogenase  32.18 
 
 		 344 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0241  alcohol dehydrogenase  30.95 
 
 		 347 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0235  alcohol dehydrogenase  30.95 
 
 		 347 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0201  L-threonine 3-dehydrogenase  30.34 
 
 		 342 aa  148  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.62 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  33.83 
 
 		 362 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.39 
 
 		 351 aa  147  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0062  L-threonine 3-dehydrogenase  30.35 
 
 		 340 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3582  alcohol dehydrogenase  35.4 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1783  L-threonine 3-dehydrogenase  31.23 
 
 		 345 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 		 362 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.23 
 
 		 348 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3248  sorbitol dehydrogenase  32.29 
 
 		 340 aa  146  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0582225  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02513  L-threonine 3-dehydrogenase  30.29 
 
 		 344 aa  146  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6309  alcohol dehydrogenase  37.3 
 
 		 337 aa  146  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  35.09 
 
 		 373 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1862  L-threonine 3-dehydrogenase  31.23 
 
 		 345 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.86 
 
 		 333 aa  145  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.11 
 
 		 344 aa  145  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.120973 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  29.94 
 
 		 356 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2958  L-threonine 3-dehydrogenase  29.33 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108215  normal  0.634974 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  34.74 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>