More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2028 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1450  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  96.84 
 
 		 349 aa  646    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0323675  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2028  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 		 349 aa  691    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37466  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1737  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  68.7 
 
 		 347 aa  487  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0780  L-threonine 3-dehydrogenase  39.66 
 
 		 348 aa  224  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0698  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.49 
 
 		 349 aa  210  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00067  L-threonine 3-dehydrogenase  34.49 
 
 		 341 aa  209  8e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3920  L-threonine 3-dehydrogenase  36.65 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344166  normal  0.087716 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1783  L-threonine 3-dehydrogenase  35.9 
 
 		 345 aa  205  9e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1862  L-threonine 3-dehydrogenase  36.18 
 
 		 345 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2931  L-threonine 3-dehydrogenase  36.81 
 
 		 343 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.217588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1347  alcohol dehydrogenase  35.73 
 
 		 343 aa  203  3e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.71457  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0121  L-threonine 3-dehydrogenase  34.01 
 
 		 341 aa  202  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2095  L-threonine 3-dehydrogenase  35.9 
 
 		 345 aa  202  7e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4341  L-threonine 3-dehydrogenase  32.85 
 
 		 341 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2565  L-threonine 3-dehydrogenase  38.57 
 
 		 354 aa  199  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1306  alcohol dehydrogenase  34.29 
 
 		 348 aa  199  5e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3616  L-threonine 3-dehydrogenase  34.01 
 
 		 342 aa  199  6e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00121447  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  32.56 
 
 		 341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4144  L-threonine 3-dehydrogenase  33.72 
 
 		 341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.498759  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0072  L-threonine 3-dehydrogenase  33.72 
 
 		 341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  32.56 
 
 		 341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4286  L-threonine 3-dehydrogenase  32.56 
 
 		 341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000588728 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0066  L-threonine 3-dehydrogenase  33.72 
 
 		 341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3793  L-threonine 3-dehydrogenase  33.62 
 
 		 341 aa  196  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0062  L-threonine 3-dehydrogenase  32.46 
 
 		 340 aa  197  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1594  L-threonine 3-dehydrogenase  36.71 
 
 		 342 aa  196  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.073313  normal  0.583452 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0806  L-threonine 3-dehydrogenase  34.49 
 
 		 345 aa  196  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.384791  normal  0.0311544 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4823  L-threonine 3-dehydrogenase  33.43 
 
 		 341 aa  196  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204753 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  33.53 
 
 		 341 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  32.27 
 
 		 341 aa  195  9e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  32.46 
 
 		 341 aa  194  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0757  L-threonine 3-dehydrogenase  34.2 
 
 		 340 aa  194  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0739  L-threonine 3-dehydrogenase  33.72 
 
 		 340 aa  194  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3901  L-threonine 3-dehydrogenase  31.98 
 
 		 341 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00409651  normal  0.55097 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0106  L-threonine 3-dehydrogenase  33.04 
 
 		 341 aa  195  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588963  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4105  L-threonine 3-dehydrogenase  31.98 
 
 		 341 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287848  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  32.46 
 
 		 341 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  33.04 
 
 		 341 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0100  L-threonine 3-dehydrogenase  33.04 
 
 		 341 aa  193  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.173553 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3907  L-threonine 3-dehydrogenase  32.56 
 
 		 341 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4094  L-threonine 3-dehydrogenase  32.56 
 
 		 341 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3926  L-threonine 3-dehydrogenase  32.56 
 
 		 341 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4033  L-threonine 3-dehydrogenase  32.56 
 
 		 341 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3988  L-threonine 3-dehydrogenase  32.56 
 
 		 341 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3710  L-threonine 3-dehydrogenase  33.24 
 
 		 341 aa  193  5e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02513  L-threonine 3-dehydrogenase  34.49 
 
 		 344 aa  192  5e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0449  L-threonine 3-dehydrogenase  34.49 
 
 		 361 aa  192  5e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4086  L-threonine 3-dehydrogenase  32.56 
 
 		 343 aa  192  6e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2661  L-threonine 3-dehydrogenase  34.58 
 
 		 346 aa  192  7e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0119  L-threonine 3-dehydrogenase  32.85 
 
 		 341 aa  192  9e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0293  L-threonine 3-dehydrogenase  34.96 
 
 		 347 aa  192  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  32.56 
 
 		 343 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4160  L-threonine 3-dehydrogenase  34.15 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2958  L-threonine 3-dehydrogenase  33.14 
 
 		 345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108215  normal  0.634974 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3939  L-threonine 3-dehydrogenase  32.75 
 
 		 341 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27746  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1028  L-threonine 3-dehydrogenase  35.35 
 
 		 347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0175  L-threonine 3-dehydrogenase  33.62 
 
 		 341 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348381  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0089  L-threonine 3-dehydrogenase  32.56 
 
 		 341 aa  190  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0530  L-threonine 3-dehydrogenase  33.14 
 
 		 345 aa  189  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3953  L-threonine 3-dehydrogenase  32.27 
 
 		 341 aa  189  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0503034  normal  0.824331 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4989  L-threonine 3-dehydrogenase  32.27 
 
 		 341 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.014  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03474  L-threonine 3-dehydrogenase  32.27 
 
 		 341 aa  189  7e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0601715  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3828  L-threonine 3-dehydrogenase  32.27 
 
 		 341 aa  189  7e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4044  L-threonine 3-dehydrogenase  32.27 
 
 		 341 aa  189  7e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0092  L-threonine 3-dehydrogenase  32.27 
 
 		 341 aa  189  7e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.212636  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03425  hypothetical protein  32.27 
 
 		 341 aa  189  7e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2700  L-threonine 3-dehydrogenase  33.43 
 
 		 345 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0006  L-threonine 3-dehydrogenase  34.46 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0006  L-threonine 3-dehydrogenase  34.46 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0006  L-threonine 3-dehydrogenase  34.46 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936478  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1512  L-threonine 3-dehydrogenase  34.46 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0007  L-threonine 3-dehydrogenase  34.46 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.237262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8852  L-threonine 3-dehydrogenase  35.47 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1152  L-threonine 3-dehydrogenase  34.46 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1432  L-threonine 3-dehydrogenase  34.46 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2076  L-threonine 3-dehydrogenase  32.85 
 
 		 342 aa  187  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0654334  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0006  L-threonine 3-dehydrogenase  34.46 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4973  L-threonine 3-dehydrogenase  34.57 
 
 		 342 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.554494  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05001  L-threonine 3-dehydrogenase  31.69 
 
 		 360 aa  187  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7003  L-threonine 3-dehydrogenase  33.33 
 
 		 343 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4120  L-threonine 3-dehydrogenase  31.98 
 
 		 341 aa  186  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.357417  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3116  L-threonine 3-dehydrogenase  34.57 
 
 		 342 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.717555 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0201  L-threonine 3-dehydrogenase  34.88 
 
 		 342 aa  186  6e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1548  alcohol dehydrogenase  32.66 
 
 		 350 aa  186  7e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0106468  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1995  L-threonine 3-dehydrogenase  34.88 
 
 		 348 aa  186  7e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.271324  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3020  L-threonine 3-dehydrogenase  33.33 
 
 		 343 aa  185  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3944  L-threonine 3-dehydrogenase  33.62 
 
 		 342 aa  185  8e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001213  L-threonine 3-dehydrogenase  31.4 
 
 		 343 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2686  L-threonine 3-dehydrogenase  34.49 
 
 		 345 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00603723  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4535  L-threonine 3-dehydrogenase  34.26 
 
 		 342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3178  L-threonine 3-dehydrogenase  33.95 
 
 		 342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5320  L-threonine 3-dehydrogenase  34.26 
 
 		 342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0353  L-threonine 3-dehydrogenase  31.1 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5157  L-threonine 3-dehydrogenase  34.26 
 
 		 342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0444  L-threonine 3-dehydrogenase  34.38 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5702  L-threonine 3-dehydrogenase  34.26 
 
 		 342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495023 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0837  L-threonine 3-dehydrogenase  31.4 
 
 		 343 aa  183  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178921  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2797  L-threonine 3-dehydrogenase  36.05 
 
 		 343 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.242425  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2224  L-threonine 3-dehydrogenase  33.05 
 
 		 344 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0146  alcohol dehydrogenase  31.81 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>