More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0154 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  90.83 
 
 		 338 aa  636    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0329198 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0154  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 		 339 aa  689    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3230  alcohol dehydrogenase  68.84 
 
 		 338 aa  478  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1608  putative Zn-dependent dehydrogenase  53.12 
 
 		 330 aa  347  1e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.587808  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0262  alcohol dehydrogenase  53.12 
 
 		 327 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1249  alcohol dehydrogenase  51.34 
 
 		 335 aa  345  5e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1223  alcohol dehydrogenase  51.34 
 
 		 335 aa  345  5e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135954  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2070  alcohol dehydrogenase  51.34 
 
 		 336 aa  343  2e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0286  alcohol dehydrogenase  53.41 
 
 		 330 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5128  zinc-binding dehydrogenase  50.59 
 
 		 337 aa  335  5e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5476  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.19 
 
 		 335 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6310  alcohol dehydrogenase  49.7 
 
 		 345 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6469  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  50 
 
 		 345 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0178  alcohol dehydrogenase  48.96 
 
 		 336 aa  333  3e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6704  alcohol dehydrogenase  50 
 
 		 345 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710863  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6341  alcohol dehydrogenase  50.45 
 
 		 336 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00479428  normal  0.719872 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1540  alcohol dehydrogenase  47.6 
 
 		 336 aa  328  6e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.931266 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0797  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  44.84 
 
 		 338 aa  306  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121673  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5642  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.43 
 
 		 337 aa  295  6e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3317  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.67 
 
 		 338 aa  286  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  hitchhiker  0.0000240679 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2739  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.12 
 
 		 337 aa  285  8e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.112956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1421  alcohol dehydrogenase  43.11 
 
 		 343 aa  279  6e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1736  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  43.07 
 
 		 349 aa  277  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  41.42 
 
 		 356 aa  276  4e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1260  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.95 
 
 		 339 aa  268  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.785941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  40.48 
 
 		 337 aa  249  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3697  alcohol dehydrogenase  39.94 
 
 		 340 aa  242  6e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587402 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4903  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.64 
 
 		 340 aa  242  7e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.64 
 
 		 340 aa  242  7e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0102074  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04235  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  39.64 
 
 		 340 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.767219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3639  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.64 
 
 		 340 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4590  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.64 
 
 		 340 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00423136  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04201  hypothetical protein  39.64 
 
 		 340 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.774265  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0059  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.35 
 
 		 340 aa  241  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4898  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  39.05 
 
 		 340 aa  239  5e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0065  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.35 
 
 		 340 aa  239  5.999999999999999e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5871  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  39.35 
 
 		 340 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0577  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.53 
 
 		 342 aa  233  5e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.105265  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4706  alcohol dehydrogenase  39.12 
 
 		 341 aa  226  5.0000000000000005e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3303  zinc-binding dehydrogenase family protein  37.46 
 
 		 338 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0731443 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3328  hypothetical protein  35.99 
 
 		 338 aa  215  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.463233 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3320  hypothetical protein  36.28 
 
 		 338 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.915678 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3425  hypothetical protein  35.99 
 
 		 338 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.955308  hitchhiker  0.00600667 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3244  hypothetical protein  35.99 
 
 		 338 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3903  alcohol dehydrogenase  36.94 
 
 		 338 aa  202  8e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07150  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  37.65 
 
 		 340 aa  195  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439183  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4931  alcohol dehydrogenase  35.91 
 
 		 337 aa  186  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.42 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  37.5 
 
 		 338 aa  179  7e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4598  putative dehydrogenase  32.85 
 
 		 343 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5131  putative dehydrogenase  34.06 
 
 		 343 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.869856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.26 
 
 		 342 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1614  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.19 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000216473  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.04 
 
 		 340 aa  168  9e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0021  Zn-binding dehydrogenase  30.86 
 
 		 352 aa  166  4e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0554419  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  35.62 
 
 		 340 aa  166  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.77 
 
 		 341 aa  165  9e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  36.08 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.08 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  36.08 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  35.76 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  35.44 
 
 		 339 aa  164  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2551  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.68 
 
 		 341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163607  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.67 
 
 		 340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.35 
 
 		 340 aa  162  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108984  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1933  putative dehydrogenase  34.71 
 
 		 339 aa  162  7e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2002  putative dehydrogenase  34.45 
 
 		 343 aa  162  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3592  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.27 
 
 		 347 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  32.28 
 
 		 340 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  33.24 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0765  putative dehydrogenase  34.15 
 
 		 343 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0512  putative dehydrogenase  34.15 
 
 		 343 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0584  putative dehydrogenase  34.15 
 
 		 343 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.24761  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0695  putative dehydrogenase  34.15 
 
 		 343 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2097  putative dehydrogenase  34.15 
 
 		 343 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1649  putative dehydrogenase  34.15 
 
 		 343 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3564  alcohol dehydrogenase  33.75 
 
 		 347 aa  159  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.28 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  34.71 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1617  putative dehydrogenase  33.76 
 
 		 339 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1794  alcohol dehydrogenase  37.91 
 
 		 343 aa  156  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0373035  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1608  putative dehydrogenase  33.76 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1676  putative dehydrogenase  33.76 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1666  putative dehydrogenase  33.76 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.747821  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0619  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.94 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  33.65 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0125  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.66 
 
 		 341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000121162  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.5 
 
 		 341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  34.21 
 
 		 337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  30.68 
 
 		 327 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2119  dehydrogenase starvation-sensing protein  32.6 
 
 		 340 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  35.35 
 
 		 354 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  33.63 
 
 		 364 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  35.35 
 
 		 354 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.29 
 
 		 341 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3875  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.85 
 
 		 344 aa  149  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.177678  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.41 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.41 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0246  alcohol dehydrogenase  34.05 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000123303  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.02 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00243149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>