More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2119 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2119  dehydrogenase starvation-sensing protein  100 
 
 		 340 aa  689    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3564  alcohol dehydrogenase  61.18 
 
 		 347 aa  440  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  60.24 
 
 		 339 aa  434  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  60.83 
 
 		 339 aa  435  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  60.24 
 
 		 339 aa  432  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  60.24 
 
 		 339 aa  432  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  60.24 
 
 		 339 aa  432  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  59.94 
 
 		 339 aa  429  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1608  putative dehydrogenase  59.35 
 
 		 339 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1933  putative dehydrogenase  59.35 
 
 		 339 aa  426  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1617  putative dehydrogenase  59.05 
 
 		 339 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1666  putative dehydrogenase  58.75 
 
 		 339 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.747821  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  59.35 
 
 		 340 aa  423  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1676  putative dehydrogenase  59.05 
 
 		 339 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  59.35 
 
 		 343 aa  420  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  59.64 
 
 		 340 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108984  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  58.46 
 
 		 340 aa  408  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4598  putative dehydrogenase  57.82 
 
 		 343 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5131  putative dehydrogenase  56.64 
 
 		 343 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.869856  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0765  putative dehydrogenase  56.34 
 
 		 343 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0512  putative dehydrogenase  56.34 
 
 		 343 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1649  putative dehydrogenase  56.34 
 
 		 343 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0695  putative dehydrogenase  56.34 
 
 		 343 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2097  putative dehydrogenase  56.34 
 
 		 343 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0584  putative dehydrogenase  56.34 
 
 		 343 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.24761  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2002  putative dehydrogenase  56.05 
 
 		 343 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1653  starvation sensing protein RspB  62.11 
 
 		 288 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00258422  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.41 
 
 		 342 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  46.57 
 
 		 340 aa  296  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  48.42 
 
 		 340 aa  297  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  33.82 
 
 		 341 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  33.82 
 
 		 341 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  33.82 
 
 		 341 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  33.82 
 
 		 341 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1614  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.46 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000216473  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.72 
 
 		 344 aa  182  7e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0021  Zn-binding dehydrogenase  31.4 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0554419  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.27 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 		 356 aa  180  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0178  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 336 aa  176  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1783  L-threonine 3-dehydrogenase  32.69 
 
 		 345 aa  172  9e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1862  L-threonine 3-dehydrogenase  32.69 
 
 		 345 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2095  L-threonine 3-dehydrogenase  32.59 
 
 		 345 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0797  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.9 
 
 		 338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121673  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0059  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.35 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0065  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.43 
 
 		 340 aa  166  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10170  L-threonine 3-dehydrogenase  32.65 
 
 		 348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1736  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.7 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4160  L-threonine 3-dehydrogenase  31.69 
 
 		 342 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5320  L-threonine 3-dehydrogenase  32.3 
 
 		 342 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0006  L-threonine 3-dehydrogenase  31.99 
 
 		 343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0007  L-threonine 3-dehydrogenase  31.99 
 
 		 343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.237262  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1512  L-threonine 3-dehydrogenase  31.99 
 
 		 343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5157  L-threonine 3-dehydrogenase  32.3 
 
 		 342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  32.45 
 
 		 337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5702  L-threonine 3-dehydrogenase  32.3 
 
 		 342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495023 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4535  L-threonine 3-dehydrogenase  32.3 
 
 		 342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1152  L-threonine 3-dehydrogenase  31.99 
 
 		 343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0006  L-threonine 3-dehydrogenase  31.99 
 
 		 343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1432  L-threonine 3-dehydrogenase  31.99 
 
 		 343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0006  L-threonine 3-dehydrogenase  31.99 
 
 		 343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936478  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3178  L-threonine 3-dehydrogenase  31.99 
 
 		 342 aa  162  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7003  L-threonine 3-dehydrogenase  31.69 
 
 		 343 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0006  L-threonine 3-dehydrogenase  31.68 
 
 		 343 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4973  L-threonine 3-dehydrogenase  32.3 
 
 		 342 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.554494  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  31.72 
 
 		 345 aa  161  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2931  L-threonine 3-dehydrogenase  31.02 
 
 		 343 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.217588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0175  L-threonine 3-dehydrogenase  31.09 
 
 		 341 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348381  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3901  L-threonine 3-dehydrogenase  31.19 
 
 		 341 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00409651  normal  0.55097 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3116  L-threonine 3-dehydrogenase  31.99 
 
 		 342 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.717555 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4105  L-threonine 3-dehydrogenase  31.19 
 
 		 341 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287848  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4033  L-threonine 3-dehydrogenase  32.69 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3926  L-threonine 3-dehydrogenase  32.69 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4094  L-threonine 3-dehydrogenase  32.69 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3907  L-threonine 3-dehydrogenase  32.69 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3988  L-threonine 3-dehydrogenase  32.69 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  31.19 
 
 		 341 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02513  L-threonine 3-dehydrogenase  29.55 
 
 		 344 aa  160  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  31.19 
 
 		 341 aa  159  7e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3020  L-threonine 3-dehydrogenase  31.38 
 
 		 343 aa  159  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1249  alcohol dehydrogenase  31.97 
 
 		 335 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4286  L-threonine 3-dehydrogenase  30.67 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000588728 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  30.67 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001213  L-threonine 3-dehydrogenase  31.51 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1223  alcohol dehydrogenase  31.97 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135954  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  30.67 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4989  L-threonine 3-dehydrogenase  32.26 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.014  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03474  L-threonine 3-dehydrogenase  32.26 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0601715  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0089  L-threonine 3-dehydrogenase  32.26 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4044  L-threonine 3-dehydrogenase  32.26 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03425  hypothetical protein  32.26 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3828  L-threonine 3-dehydrogenase  32.26 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1421  alcohol dehydrogenase  32.75 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4086  L-threonine 3-dehydrogenase  32.15 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  30.87 
 
 		 341 aa  158  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4341  L-threonine 3-dehydrogenase  30.67 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5642  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.89 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0092  L-threonine 3-dehydrogenase  32.26 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.212636  normal  0.425053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>