More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A1653 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A1653  starvation sensing protein RspB  100 
 
 		 288 aa  584  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00258422  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  98.25 
 
 		 339 aa  570  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  98.25 
 
 		 339 aa  570  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  98.25 
 
 		 339 aa  570  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  97.19 
 
 		 339 aa  567  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  97.89 
 
 		 339 aa  566  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  96.49 
 
 		 339 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1933  putative dehydrogenase  76.14 
 
 		 339 aa  471  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1676  putative dehydrogenase  73.68 
 
 		 339 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1617  putative dehydrogenase  73.68 
 
 		 339 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1608  putative dehydrogenase  73.68 
 
 		 339 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1666  putative dehydrogenase  73.33 
 
 		 339 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.747821  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  72.63 
 
 		 340 aa  444  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  74.04 
 
 		 340 aa  440  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  73.68 
 
 		 343 aa  438  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  71.93 
 
 		 340 aa  437  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108984  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3564  alcohol dehydrogenase  64.91 
 
 		 347 aa  408  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2119  dehydrogenase starvation-sensing protein  62.11 
 
 		 340 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4598  putative dehydrogenase  54.33 
 
 		 343 aa  329  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5131  putative dehydrogenase  54.33 
 
 		 343 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.869856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1649  putative dehydrogenase  52.94 
 
 		 343 aa  315  7e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0765  putative dehydrogenase  52.94 
 
 		 343 aa  315  7e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0512  putative dehydrogenase  52.94 
 
 		 343 aa  315  7e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0584  putative dehydrogenase  52.94 
 
 		 343 aa  315  7e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.24761  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0695  putative dehydrogenase  52.94 
 
 		 343 aa  315  7e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2097  putative dehydrogenase  52.94 
 
 		 343 aa  315  7e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2002  putative dehydrogenase  52.94 
 
 		 343 aa  315  7e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  45.3 
 
 		 340 aa  267  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  47.04 
 
 		 340 aa  265  5.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.57 
 
 		 342 aa  259  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1614  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.2 
 
 		 338 aa  211  1e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000216473  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.46 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  35.56 
 
 		 341 aa  175  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  35.56 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  35.56 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  35.56 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  35.56 
 
 		 341 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.23 
 
 		 344 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0797  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  41.15 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121673  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0178  alcohol dehydrogenase  36 
 
 		 336 aa  166  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  34.15 
 
 		 337 aa  162  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0059  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.04 
 
 		 340 aa  159  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3303  zinc-binding dehydrogenase family protein  33.71 
 
 		 338 aa  159  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0731443 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.4 
 
 		 335 aa  159  8e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3328  hypothetical protein  34.47 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.463233 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0065  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.68 
 
 		 340 aa  157  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  36.23 
 
 		 356 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  33.92 
 
 		 327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  33.7 
 
 		 339 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0953  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.99 
 
 		 336 aa  153  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00776384  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3320  hypothetical protein  33.33 
 
 		 338 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.915678 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2445  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.81 
 
 		 347 aa  151  8.999999999999999e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.682207  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1421  alcohol dehydrogenase  35.45 
 
 		 343 aa  151  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04235  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  42.53 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.767219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3639  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.53 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  42.53 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0102074  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04201  hypothetical protein  42.53 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.774265  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4903  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  42.53 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3244  hypothetical protein  32.95 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4590  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  42.53 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00423136  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5871  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  42.53 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3425  hypothetical protein  32.95 
 
 		 338 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.955308  hitchhiker  0.00600667 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4898  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  42.53 
 
 		 340 aa  149  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07150  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  34.04 
 
 		 340 aa  149  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439183  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3697  alcohol dehydrogenase  41.95 
 
 		 340 aa  149  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587402 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1995  L-threonine 3-dehydrogenase  33.33 
 
 		 348 aa  147  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.271324  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0449  L-threonine 3-dehydrogenase  33.09 
 
 		 361 aa  148  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5128  zinc-binding dehydrogenase  33.9 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0201  L-threonine 3-dehydrogenase  33.33 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10170  L-threonine 3-dehydrogenase  33.45 
 
 		 348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0154  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43 
 
 		 339 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0021  Zn-binding dehydrogenase  33.1 
 
 		 352 aa  146  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0554419  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.46 
 
 		 338 aa  146  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4086  L-threonine 3-dehydrogenase  31.63 
 
 		 343 aa  146  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05001  L-threonine 3-dehydrogenase  31.42 
 
 		 360 aa  145  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3944  L-threonine 3-dehydrogenase  31.71 
 
 		 342 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 345 aa  145  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  34.62 
 
 		 336 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3875  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.28 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.177678  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.69 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  31.29 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0175  L-threonine 3-dehydrogenase  31.87 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348381  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2095  L-threonine 3-dehydrogenase  30.56 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1783  L-threonine 3-dehydrogenase  30.56 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0788  alcohol dehydrogenase  38.02 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1862  L-threonine 3-dehydrogenase  29.86 
 
 		 345 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2070  alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 		 336 aa  143  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.5 
 
 		 342 aa  143  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1736  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.77 
 
 		 349 aa  143  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0066  L-threonine 3-dehydrogenase  31.77 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  31.16 
 
 		 352 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.97 
 
 		 336 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2784  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.13 
 
 		 342 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.551512  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0072  L-threonine 3-dehydrogenase  31.41 
 
 		 341 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001213  L-threonine 3-dehydrogenase  30.74 
 
 		 343 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1714  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.42 
 
 		 352 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.22 
 
 		 338 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0329198 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4144  L-threonine 3-dehydrogenase  31.41 
 
 		 341 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.498759  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2828  alcohol dehydrogenase  32.13 
 
 		 343 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155527  normal  0.0877096 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3903  alcohol dehydrogenase  32.63 
 
 		 338 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>