More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0178 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0178  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 336 aa  685    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5128  zinc-binding dehydrogenase  75.3 
 
 		 337 aa  516  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2070  alcohol dehydrogenase  59.23 
 
 		 336 aa  396  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6469  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  56.8 
 
 		 345 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6704  alcohol dehydrogenase  56.8 
 
 		 345 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710863  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6310  alcohol dehydrogenase  56.85 
 
 		 345 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1223  alcohol dehydrogenase  53.73 
 
 		 335 aa  374  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135954  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1249  alcohol dehydrogenase  53.73 
 
 		 335 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5476  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.03 
 
 		 335 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6341  alcohol dehydrogenase  54.63 
 
 		 336 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00479428  normal  0.719872 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0797  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  50.3 
 
 		 338 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121673  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1736  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  49.4 
 
 		 349 aa  338  8e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1540  alcohol dehydrogenase  51.05 
 
 		 336 aa  337  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.931266 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50.15 
 
 		 338 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0329198 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0154  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.96 
 
 		 339 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3230  alcohol dehydrogenase  49.26 
 
 		 338 aa  325  5e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1608  putative Zn-dependent dehydrogenase  50.6 
 
 		 330 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.587808  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0262  alcohol dehydrogenase  50.6 
 
 		 327 aa  323  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5642  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.79 
 
 		 337 aa  321  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0286  alcohol dehydrogenase  50.89 
 
 		 330 aa  316  5e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  43.95 
 
 		 356 aa  310  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2739  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.81 
 
 		 337 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.112956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3317  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.4 
 
 		 338 aa  305  5.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  hitchhiker  0.0000240679 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1421  alcohol dehydrogenase  46.92 
 
 		 343 aa  303  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1260  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.73 
 
 		 339 aa  276  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.785941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  40.3 
 
 		 337 aa  263  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0059  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.24 
 
 		 340 aa  257  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0065  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.3 
 
 		 340 aa  257  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3303  zinc-binding dehydrogenase family protein  41.12 
 
 		 338 aa  256  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0731443 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0577  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.29 
 
 		 342 aa  254  2.0000000000000002e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.105265  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3697  alcohol dehydrogenase  43.13 
 
 		 340 aa  253  3e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587402 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  42.81 
 
 		 340 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0102074  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4903  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  42.81 
 
 		 340 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4590  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  42.81 
 
 		 340 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00423136  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04235  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  42.81 
 
 		 340 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.767219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3639  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.81 
 
 		 340 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04201  hypothetical protein  42.81 
 
 		 340 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.774265  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5871  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  42.81 
 
 		 340 aa  252  6e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4898  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  42.81 
 
 		 340 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3328  hypothetical protein  37.09 
 
 		 338 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.463233 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3320  hypothetical protein  37.69 
 
 		 338 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.915678 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3244  hypothetical protein  37.39 
 
 		 338 aa  232  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3425  hypothetical protein  37.09 
 
 		 338 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.955308  hitchhiker  0.00600667 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.12 
 
 		 337 aa  227  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4706  alcohol dehydrogenase  39.35 
 
 		 341 aa  223  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07150  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  35.6 
 
 		 340 aa  186  6e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439183  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4931  alcohol dehydrogenase  34.9 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  34.63 
 
 		 339 aa  176  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  34.33 
 
 		 339 aa  176  6e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2119  dehydrogenase starvation-sensing protein  33.33 
 
 		 340 aa  176  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  34.03 
 
 		 339 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.96 
 
 		 340 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4598  putative dehydrogenase  32.21 
 
 		 343 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  34.03 
 
 		 339 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.03 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1933  putative dehydrogenase  33.65 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5131  putative dehydrogenase  31.67 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.869856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  32.81 
 
 		 340 aa  173  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.69 
 
 		 344 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3903  alcohol dehydrogenase  35.48 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3564  alcohol dehydrogenase  32.05 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  33.73 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2002  putative dehydrogenase  32.62 
 
 		 343 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.51 
 
 		 342 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1649  putative dehydrogenase  32.62 
 
 		 343 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0765  putative dehydrogenase  32.62 
 
 		 343 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0512  putative dehydrogenase  32.62 
 
 		 343 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0695  putative dehydrogenase  32.62 
 
 		 343 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2097  putative dehydrogenase  32.62 
 
 		 343 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0584  putative dehydrogenase  32.62 
 
 		 343 aa  169  7e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.24761  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 		 346 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.79 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108984  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0953  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.73 
 
 		 336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00776384  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  32.81 
 
 		 340 aa  166  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  32.7 
 
 		 343 aa  166  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0021  Zn-binding dehydrogenase  28.16 
 
 		 352 aa  166  6.9999999999999995e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0554419  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1653  starvation sensing protein RspB  36 
 
 		 288 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00258422  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1144  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.99 
 
 		 323 aa  165  8e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.129111 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1617  putative dehydrogenase  32.61 
 
 		 339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1676  putative dehydrogenase  32.09 
 
 		 339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1666  putative dehydrogenase  31.78 
 
 		 339 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.747821  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1608  putative dehydrogenase  31.78 
 
 		 339 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  31.1 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.76 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  31.44 
 
 		 341 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  31.44 
 
 		 341 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  31.44 
 
 		 341 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.5 
 
 		 333 aa  155  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.44 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  31.1 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  32.72 
 
 		 339 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0614  alcohol dehydrogenase  32.91 
 
 		 318 aa  151  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0116847  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.31 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7070  alcohol dehydrogenase  32.22 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0633  alcohol dehydrogenase  32.27 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1794  alcohol dehydrogenase  32.97 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0373035  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.19 
 
 		 329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.06 
 
 		 341 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  28.4 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  30.62 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>