More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4598 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5131  putative dehydrogenase  97.67 
 
 		 343 aa  679    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.869856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4598  putative dehydrogenase  100 
 
 		 343 aa  692    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2002  putative dehydrogenase  83.58 
 
 		 343 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0765  putative dehydrogenase  83.28 
 
 		 343 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0512  putative dehydrogenase  83.28 
 
 		 343 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1649  putative dehydrogenase  83.28 
 
 		 343 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0584  putative dehydrogenase  82.99 
 
 		 343 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.24761  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0695  putative dehydrogenase  83.28 
 
 		 343 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2097  putative dehydrogenase  83.28 
 
 		 343 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2119  dehydrogenase starvation-sensing protein  57.82 
 
 		 340 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  54.39 
 
 		 339 aa  393  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  53.8 
 
 		 339 aa  392  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  53.8 
 
 		 339 aa  391  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.8 
 
 		 339 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3564  alcohol dehydrogenase  55.43 
 
 		 347 aa  391  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1933  putative dehydrogenase  55.43 
 
 		 339 aa  390  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  53.8 
 
 		 339 aa  391  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.25 
 
 		 340 aa  388  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108984  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.96 
 
 		 340 aa  387  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  53.51 
 
 		 339 aa  387  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  53.96 
 
 		 343 aa  381  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  53.37 
 
 		 340 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1666  putative dehydrogenase  52.63 
 
 		 339 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.747821  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1617  putative dehydrogenase  52.63 
 
 		 339 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1676  putative dehydrogenase  52.63 
 
 		 339 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1608  putative dehydrogenase  52.63 
 
 		 339 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1653  starvation sensing protein RspB  54.33 
 
 		 288 aa  329  3e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00258422  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  45.16 
 
 		 340 aa  311  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.33 
 
 		 342 aa  310  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  44.12 
 
 		 340 aa  290  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1614  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.06 
 
 		 338 aa  229  4e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000216473  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.82 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 		 341 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 		 341 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 		 341 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.14 
 
 		 344 aa  192  9e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  34.14 
 
 		 339 aa  192  9e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.24 
 
 		 341 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.24 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.02 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0797  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.65 
 
 		 338 aa  185  9e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121673  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.48 
 
 		 338 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0329198 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  34.81 
 
 		 345 aa  182  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  32.94 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07150  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  33.53 
 
 		 340 aa  179  7e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439183  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1736  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.53 
 
 		 349 aa  178  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.22 
 
 		 335 aa  176  7e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0178  alcohol dehydrogenase  32.21 
 
 		 336 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0021  Zn-binding dehydrogenase  31.96 
 
 		 352 aa  175  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0554419  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0154  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.85 
 
 		 339 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1421  alcohol dehydrogenase  33.64 
 
 		 343 aa  175  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0175  L-threonine 3-dehydrogenase  32.06 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348381  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2095  L-threonine 3-dehydrogenase  32.33 
 
 		 345 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.14 
 
 		 341 aa  172  7.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1783  L-threonine 3-dehydrogenase  31.72 
 
 		 345 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0059  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.12 
 
 		 340 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3944  L-threonine 3-dehydrogenase  32.06 
 
 		 342 aa  171  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1862  L-threonine 3-dehydrogenase  31.72 
 
 		 345 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04235  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  30.99 
 
 		 340 aa  170  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.767219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3639  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.99 
 
 		 340 aa  170  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4590  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.99 
 
 		 340 aa  170  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00423136  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4903  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.2 
 
 		 340 aa  170  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04201  hypothetical protein  30.99 
 
 		 340 aa  170  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.774265  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4898  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.99 
 
 		 340 aa  170  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.2 
 
 		 340 aa  170  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0102074  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5642  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.85 
 
 		 337 aa  169  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5871  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.2 
 
 		 340 aa  169  9e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 		 356 aa  168  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3697  alcohol dehydrogenase  30.61 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587402 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0065  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.52 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  33.55 
 
 		 338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0201  L-threonine 3-dehydrogenase  31.94 
 
 		 342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1995  L-threonine 3-dehydrogenase  31.94 
 
 		 348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.271324  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.13 
 
 		 323 aa  166  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  31.23 
 
 		 327 aa  166  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4341  L-threonine 3-dehydrogenase  31.42 
 
 		 341 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  31.42 
 
 		 341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4286  L-threonine 3-dehydrogenase  31.42 
 
 		 341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000588728 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  31.42 
 
 		 341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3328  hypothetical protein  32.26 
 
 		 338 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.463233 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4086  L-threonine 3-dehydrogenase  32.22 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 		 333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  30.88 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3317  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.08 
 
 		 338 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  hitchhiker  0.0000240679 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3901  L-threonine 3-dehydrogenase  31.12 
 
 		 341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00409651  normal  0.55097 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4105  L-threonine 3-dehydrogenase  31.12 
 
 		 341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287848  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  30.82 
 
 		 341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001213  L-threonine 3-dehydrogenase  31.12 
 
 		 343 aa  163  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0062  L-threonine 3-dehydrogenase  30.63 
 
 		 340 aa  162  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0953  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.21 
 
 		 336 aa  162  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00776384  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2931  L-threonine 3-dehydrogenase  30.24 
 
 		 343 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.217588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  30.82 
 
 		 341 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4706  alcohol dehydrogenase  32.36 
 
 		 341 aa  162  9e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3793  L-threonine 3-dehydrogenase  32.64 
 
 		 341 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1512  L-threonine 3-dehydrogenase  31.87 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6341  alcohol dehydrogenase  34.65 
 
 		 336 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00479428  normal  0.719872 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0007  L-threonine 3-dehydrogenase  31.87 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.237262  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  30.82 
 
 		 341 aa  161  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1152  L-threonine 3-dehydrogenase  31.87 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1432  L-threonine 3-dehydrogenase  31.87 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>