More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3998 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 		 333 aa  660    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.34 
 
 		 329 aa  304  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.15 
 
 		 335 aa  298  7e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0885  alcohol dehydrogenase  41.79 
 
 		 333 aa  232  7.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  40.52 
 
 		 339 aa  231  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.4 
 
 		 338 aa  225  7e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00443  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04620)  37.24 
 
 		 348 aa  224  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0953  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.72 
 
 		 336 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00776384  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06260  zinc-binding dehydrogenase, putative  34.2 
 
 		 349 aa  212  5.999999999999999e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.040279  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  35.69 
 
 		 336 aa  210  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0537  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.93 
 
 		 325 aa  209  7e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00294504  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  35.67 
 
 		 344 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  35.55 
 
 		 345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0685  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.24 
 
 		 338 aa  196  5.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 		 327 aa  192  6e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1707  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  32.3 
 
 		 336 aa  189  5e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.508276  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  35 
 
 		 337 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  37.76 
 
 		 352 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0603  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  33.97 
 
 		 338 aa  188  1e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000710686  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5447  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.05 
 
 		 350 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1780  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  32.82 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4840  alcohol dehydrogenase  37.77 
 
 		 330 aa  187  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3849  alcohol dehydrogenase  35.67 
 
 		 336 aa  186  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1823  alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 		 350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00496203  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1860  alcohol dehydrogenase  33.87 
 
 		 336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.710452  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1696  threonine dehydrogenase  33.23 
 
 		 334 aa  182  7e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000265476  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  36.63 
 
 		 337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.95 
 
 		 373 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0614  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0116847  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0633  alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 		 317 aa  178  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2220  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.135715 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0239  alcohol dehydrogenase  32.27 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0233  alcohol dehydrogenase  32.27 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  38.86 
 
 		 373 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2013  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.69 
 
 		 344 aa  177  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.238084  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1804  alcohol dehydrogenase  35.26 
 
 		 349 aa  177  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0175  L-threonine 3-dehydrogenase  33.04 
 
 		 341 aa  176  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.62 
 
 		 344 aa  176  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3564  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 347 aa  176  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  36.9 
 
 		 373 aa  176  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.35 
 
 		 373 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  37.35 
 
 		 373 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  37.35 
 
 		 373 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  32.04 
 
 		 343 aa  175  8e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.39 
 
 		 323 aa  175  9e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.63 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1000  putative alcohol dehydrogenase  37.69 
 
 		 352 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.2 
 
 		 352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4598  putative dehydrogenase  33.33 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3944  L-threonine 3-dehydrogenase  33.53 
 
 		 342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  31.89 
 
 		 341 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  38.42 
 
 		 342 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4086  L-threonine 3-dehydrogenase  31.91 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1166  alcohol dehydrogenase  34.57 
 
 		 351 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.39 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  31.8 
 
 		 340 aa  170  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4144  L-threonine 3-dehydrogenase  30.72 
 
 		 341 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.498759  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0072  L-threonine 3-dehydrogenase  30.72 
 
 		 341 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5131  putative dehydrogenase  33.04 
 
 		 343 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.869856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  30.89 
 
 		 339 aa  169  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0066  L-threonine 3-dehydrogenase  30.72 
 
 		 341 aa  169  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3901  L-threonine 3-dehydrogenase  30.79 
 
 		 341 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00409651  normal  0.55097 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  30.79 
 
 		 341 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4105  L-threonine 3-dehydrogenase  30.79 
 
 		 341 aa  169  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287848  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  30.79 
 
 		 341 aa  169  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0196  alcohol dehydrogenase  34.71 
 
 		 338 aa  169  5e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.583804  normal  0.0665338 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4187  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.58 
 
 		 335 aa  168  9e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  34.65 
 
 		 354 aa  168  9e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4341  L-threonine 3-dehydrogenase  30.49 
 
 		 341 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.95 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  34.65 
 
 		 354 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  30.49 
 
 		 341 aa  168  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0106  L-threonine 3-dehydrogenase  30.79 
 
 		 341 aa  168  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588963  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  30.79 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3710  L-threonine 3-dehydrogenase  30.79 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  31.1 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3939  L-threonine 3-dehydrogenase  31.4 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27746  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4286  L-threonine 3-dehydrogenase  31.1 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000588728 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  31.1 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1617  putative dehydrogenase  30.89 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0619  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.92 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.36 
 
 		 336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0100  L-threonine 3-dehydrogenase  30.79 
 
 		 341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.173553 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  32.42 
 
 		 343 aa  166  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1608  putative dehydrogenase  30.58 
 
 		 339 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  35.74 
 
 		 350 aa  166  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1676  putative dehydrogenase  30.58 
 
 		 339 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  34.35 
 
 		 354 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1933  putative dehydrogenase  29.97 
 
 		 339 aa  166  6.9999999999999995e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121666  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  30.58 
 
 		 339 aa  165  8e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  30.58 
 
 		 339 aa  166  8e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0062  L-threonine 3-dehydrogenase  30.95 
 
 		 340 aa  165  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  30.58 
 
 		 339 aa  165  8e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4094  L-threonine 3-dehydrogenase  30.12 
 
 		 341 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3926  L-threonine 3-dehydrogenase  30.12 
 
 		 341 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  34.35 
 
 		 365 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3907  L-threonine 3-dehydrogenase  30.12 
 
 		 341 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3988  L-threonine 3-dehydrogenase  30.12 
 
 		 341 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4033  L-threonine 3-dehydrogenase  30.12 
 
 		 341 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  34.63 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>