More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2220 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2220  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 		 343 aa  678    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.135715 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  35.24 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  35.09 
 
 		 339 aa  182  5.0000000000000004e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0351  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.08 
 
 		 357 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.64 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06260  zinc-binding dehydrogenase, putative  31.98 
 
 		 349 aa  178  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.040279  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  34.93 
 
 		 363 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  34.97 
 
 		 336 aa  176  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0685  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.54 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  38.06 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0953  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.79 
 
 		 336 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00776384  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  34.08 
 
 		 363 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  36.12 
 
 		 365 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.34 
 
 		 354 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.93 
 
 		 342 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  36.04 
 
 		 354 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.93 
 
 		 354 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  33.24 
 
 		 360 aa  170  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2137  alcohol dehydrogenase  34.18 
 
 		 351 aa  170  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423941 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  34.08 
 
 		 362 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.62 
 
 		 344 aa  169  6e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.120973 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  33.06 
 
 		 355 aa  169  7e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  36.42 
 
 		 364 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00443  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04620)  31.18 
 
 		 348 aa  166  5.9999999999999996e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 		 362 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0698  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.76 
 
 		 349 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.5 
 
 		 338 aa  166  8e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 		 354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 		 354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1029  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.35 
 
 		 356 aa  163  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432101  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 		 362 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1530  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.63 
 
 		 367 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.16 
 
 		 336 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2089  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.06 
 
 		 385 aa  162  8.000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00067  L-threonine 3-dehydrogenase  31.19 
 
 		 341 aa  162  9e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1744  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.75 
 
 		 345 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.681848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.46 
 
 		 336 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4721  alcohol dehydrogenase  34.49 
 
 		 362 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.36355 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2958  L-threonine 3-dehydrogenase  30.24 
 
 		 345 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108215  normal  0.634974 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3405  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.71 
 
 		 348 aa  159  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0198026  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.4 
 
 		 373 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1707  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  30.7 
 
 		 336 aa  159  7e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.508276  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  32.4 
 
 		 373 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  32.03 
 
 		 373 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1804  alcohol dehydrogenase  33.73 
 
 		 349 aa  159  9e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0106  L-threonine 3-dehydrogenase  30.13 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588963  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3710  L-threonine 3-dehydrogenase  30.13 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0887  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.49 
 
 		 362 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0359  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.07 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3920  L-threonine 3-dehydrogenase  30.45 
 
 		 350 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344166  normal  0.087716 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0062  L-threonine 3-dehydrogenase  31.09 
 
 		 340 aa  159  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4198  alcohol dehydrogenase  34.15 
 
 		 362 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1823  alcohol dehydrogenase  30.99 
 
 		 350 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00496203  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5447  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.63 
 
 		 350 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3786  alcohol dehydrogenase  34.49 
 
 		 369 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107971 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.84 
 
 		 373 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5466  alcohol dehydrogenase  34.49 
 
 		 362 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.0829425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.15 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3550  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.49 
 
 		 362 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4817  alcohol dehydrogenase  34.49 
 
 		 362 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.562057  normal  0.226619 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4341  L-threonine 3-dehydrogenase  28.94 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0444  L-threonine 3-dehydrogenase  34.83 
 
 		 344 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0780  L-threonine 3-dehydrogenase  30.35 
 
 		 348 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  30.13 
 
 		 341 aa  156  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0100  L-threonine 3-dehydrogenase  29.49 
 
 		 341 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.173553 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07420  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  31.48 
 
 		 357 aa  156  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4286  L-threonine 3-dehydrogenase  28.94 
 
 		 341 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000588728 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  28.94 
 
 		 341 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  28.94 
 
 		 341 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.23 
 
 		 344 aa  155  8e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  28.62 
 
 		 341 aa  155  9e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.12 
 
 		 337 aa  155  9e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  32.94 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  29.45 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3939  L-threonine 3-dehydrogenase  28.85 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27746  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05001  L-threonine 3-dehydrogenase  28.85 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  29.17 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5645  alcohol dehydrogenase  30.92 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.419975 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1170  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.84 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  28.3 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  28.3 
 
 		 341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0530  L-threonine 3-dehydrogenase  29.31 
 
 		 345 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0449  L-threonine 3-dehydrogenase  31.63 
 
 		 361 aa  153  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3901  L-threonine 3-dehydrogenase  28.3 
 
 		 341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00409651  normal  0.55097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2463  alcohol dehydrogenase  30.52 
 
 		 338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4105  L-threonine 3-dehydrogenase  28.3 
 
 		 341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287848  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0944  L-idonate 5-dehydrogenase  33.23 
 
 		 350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.272351  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0341  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.69 
 
 		 379 aa  153  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.384488  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0121  L-threonine 3-dehydrogenase  29.17 
 
 		 341 aa  153  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0806  L-threonine 3-dehydrogenase  31.53 
 
 		 345 aa  153  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.384791  normal  0.0311544 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02513  L-threonine 3-dehydrogenase  31.02 
 
 		 344 aa  153  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4840  alcohol dehydrogenase  31.89 
 
 		 330 aa  153  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2686  L-threonine 3-dehydrogenase  29.55 
 
 		 345 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00603723  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  30.12 
 
 		 337 aa  152  5.9999999999999996e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0233  L-threonine 3-dehydrogenase  29.69 
 
 		 345 aa  152  5.9999999999999996e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.43371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7070  alcohol dehydrogenase  32.47 
 
 		 346 aa  152  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  34.91 
 
 		 373 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1049  alcohol dehydrogenase  30.85 
 
 		 366 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.050805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>