More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4033 on replicon NC_007488
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007488  RSP_4033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
337 aa  677    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  39.63 
 
 
336 aa  243  3e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  39.77 
 
 
345 aa  237  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  36.07 
 
 
344 aa  222  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0685  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.74 
 
 
338 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0537  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.88 
 
 
325 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00294504  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.32 
 
 
346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.85 
 
 
336 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.15 
 
 
336 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.42 
 
 
329 aa  196  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3405  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.68 
 
 
348 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0198026  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7070  alcohol dehydrogenase  34.97 
 
 
346 aa  188  9e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1780  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  31.78 
 
 
337 aa  188  9e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1530  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.63 
 
 
367 aa  186  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540116  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5268  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.24 
 
 
346 aa  185  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1860  alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 
336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.710452  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1804  alcohol dehydrogenase  32.85 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.04 
 
 
342 aa  181  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35 
 
 
333 aa  179  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0780  L-threonine 3-dehydrogenase  34.37 
 
 
348 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06260  zinc-binding dehydrogenase, putative  32.26 
 
 
349 aa  178  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.040279  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1823  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
350 aa  178  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00496203  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.86 
 
 
335 aa  176  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2095  L-threonine 3-dehydrogenase  33.54 
 
 
345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0233  alcohol dehydrogenase  30.99 
 
 
351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0239  alcohol dehydrogenase  30.99 
 
 
351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  32.26 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.929745 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00443  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04620)  29.88 
 
 
348 aa  173  3.9999999999999995e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  32.66 
 
 
346 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1862  L-threonine 3-dehydrogenase  33.23 
 
 
345 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1707  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  30.45 
 
 
336 aa  171  1e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.508276  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1783  L-threonine 3-dehydrogenase  32.93 
 
 
345 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.83 
 
 
342 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0293  L-threonine 3-dehydrogenase  32.26 
 
 
347 aa  169  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0603  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  30.77 
 
 
338 aa  169  8e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000710686  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0351  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.28 
 
 
357 aa  169  9e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2661  L-threonine 3-dehydrogenase  31.75 
 
 
346 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3920  L-threonine 3-dehydrogenase  31.69 
 
 
350 aa  166  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344166  normal  0.087716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2145  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  32.08 
 
 
346 aa  165  9e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552645  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0698  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.24 
 
 
349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2931  L-threonine 3-dehydrogenase  32.82 
 
 
343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.217588  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1810  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.49 
 
 
378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0459  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.49 
 
 
378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.479531  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2072  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.49 
 
 
378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0808  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.49 
 
 
378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1099  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.49 
 
 
378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.488512  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0201  L-threonine 3-dehydrogenase  32.13 
 
 
342 aa  163  3e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3165  alcohol dehydrogenase  32.01 
 
 
352 aa  163  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0364  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.49 
 
 
378 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2958  L-threonine 3-dehydrogenase  30.99 
 
 
345 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108215  normal  0.634974 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1995  L-threonine 3-dehydrogenase  32.13 
 
 
348 aa  163  4.0000000000000004e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.271324  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4221  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.5 
 
 
346 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.41128  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1218  alcohol dehydrogenase  30.88 
 
 
361 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852101  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1548  alcohol dehydrogenase  30.7 
 
 
350 aa  161  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0106468  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2700  L-threonine 3-dehydrogenase  30.7 
 
 
345 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.14 
 
 
338 aa  161  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1795  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.21 
 
 
378 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2235  alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 
341 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0565  alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 
341 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678248  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1644  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 
341 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0660  alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 
341 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3793  L-threonine 3-dehydrogenase  30.12 
 
 
341 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1619  alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 
341 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1670  alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 
341 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2565  L-threonine 3-dehydrogenase  32.15 
 
 
354 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22030  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  31.16 
 
 
375 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255526  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5628  L-threonine 3-dehydrogenase  33.91 
 
 
341 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0490  alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 
341 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283915  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0806  L-threonine 3-dehydrogenase  29.94 
 
 
345 aa  160  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.384791  normal  0.0311544 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5447  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.12 
 
 
350 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187392  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0089  L-threonine 3-dehydrogenase  30 
 
 
341 aa  159  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02513  L-threonine 3-dehydrogenase  30.72 
 
 
344 aa  159  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.48 
 
 
340 aa  159  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.19 
 
 
346 aa  159  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3224  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.29 
 
 
357 aa  159  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03474  L-threonine 3-dehydrogenase  29.7 
 
 
341 aa  159  9e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0601715  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4044  L-threonine 3-dehydrogenase  29.7 
 
 
341 aa  159  9e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1911  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.85 
 
 
363 aa  159  9e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.197112  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0092  L-threonine 3-dehydrogenase  29.7 
 
 
341 aa  159  9e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.212636  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03425  hypothetical protein  29.7 
 
 
341 aa  159  9e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1924  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.85 
 
 
363 aa  159  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3828  L-threonine 3-dehydrogenase  29.7 
 
 
341 aa  159  9e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1195  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.55 
 
 
353 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184304  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2072  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.85 
 
 
422 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.055624  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3953  L-threonine 3-dehydrogenase  29.7 
 
 
341 aa  158  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0503034  normal  0.824331 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0953  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.78 
 
 
336 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00776384  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2076  L-threonine 3-dehydrogenase  31.61 
 
 
342 aa  158  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0654334  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0072  L-threonine 3-dehydrogenase  30 
 
 
341 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0066  L-threonine 3-dehydrogenase  30 
 
 
341 aa  158  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0530  L-threonine 3-dehydrogenase  30.24 
 
 
345 aa  158  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4144  L-threonine 3-dehydrogenase  30 
 
 
341 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.498759  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0860  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.55 
 
 
363 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183529  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5590  alcohol dehydrogenase  30.31 
 
 
354 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1639  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.55 
 
 
363 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.514454  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0449  L-threonine 3-dehydrogenase  31.44 
 
 
361 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0301  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.55 
 
 
430 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0487501  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.57 
 
 
352 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4989  L-threonine 3-dehydrogenase  29.7 
 
 
341 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.014  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0233  L-threonine 3-dehydrogenase  30.5 
 
 
345 aa  157  3e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.43371 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03240  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  30.88 
 
 
358 aa  157  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>