More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2061 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  100 
 
 
339 aa  674    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  79.59 
 
 
338 aa  530  1e-149  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.72 
 
 
335 aa  291  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0953  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.98 
 
 
336 aa  252  7e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00776384  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.7 
 
 
329 aa  247  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00443  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04620)  39.51 
 
 
348 aa  242  7e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4840  alcohol dehydrogenase  41.89 
 
 
330 aa  232  8.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06260  zinc-binding dehydrogenase, putative  37.39 
 
 
349 aa  232  9e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.040279  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  38.32 
 
 
336 aa  228  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1823  alcohol dehydrogenase  39.32 
 
 
350 aa  228  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00496203  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.52 
 
 
333 aa  222  6e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3849  alcohol dehydrogenase  37.9 
 
 
336 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0614  alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 
318 aa  197  3e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0116847  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.77 
 
 
340 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0633  alcohol dehydrogenase  34.98 
 
 
317 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0603  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  35.09 
 
 
338 aa  196  7e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000710686  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1608  putative dehydrogenase  32.72 
 
 
339 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0537  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.76 
 
 
325 aa  192  5e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00294504  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4598  putative dehydrogenase  34.14 
 
 
343 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  34.23 
 
 
327 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  33.92 
 
 
340 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1860  alcohol dehydrogenase  34.51 
 
 
336 aa  191  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.710452  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1780  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  34.14 
 
 
337 aa  191  2e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1676  putative dehydrogenase  32.42 
 
 
339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1617  putative dehydrogenase  32.42 
 
 
339 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0685  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.23 
 
 
338 aa  189  4e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
344 aa  189  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3564  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
347 aa  189  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1696  threonine dehydrogenase  36.31 
 
 
334 aa  189  7e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000265476  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1666  putative dehydrogenase  32.11 
 
 
339 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.747821  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5131  putative dehydrogenase  33.84 
 
 
343 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.869856  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  32.84 
 
 
340 aa  186  5e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1933  putative dehydrogenase  31.5 
 
 
339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121666  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.68 
 
 
336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2220  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.09 
 
 
343 aa  182  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.135715 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1707  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  32.72 
 
 
336 aa  182  5.0000000000000004e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.508276  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0765  putative dehydrogenase  33.84 
 
 
343 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0512  putative dehydrogenase  33.84 
 
 
343 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.13 
 
 
337 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0584  putative dehydrogenase  33.84 
 
 
343 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.24761  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0695  putative dehydrogenase  33.84 
 
 
343 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2097  putative dehydrogenase  33.84 
 
 
343 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2002  putative dehydrogenase  33.84 
 
 
343 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1649  putative dehydrogenase  33.84 
 
 
343 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  31.95 
 
 
343 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.18 
 
 
336 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 
340 aa  179  7e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108984  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  33.63 
 
 
337 aa  177  3e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.64 
 
 
340 aa  176  7e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  31.52 
 
 
339 aa  176  8e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.48 
 
 
346 aa  175  8e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.52 
 
 
339 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  30.91 
 
 
339 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  31.21 
 
 
339 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  31.21 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  31.21 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5671  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.65 
 
 
343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  32.26 
 
 
337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 
350 aa  171  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.66 
 
 
352 aa  170  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  32.18 
 
 
345 aa  169  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.13 
 
 
348 aa  169  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1249  alcohol dehydrogenase  32.06 
 
 
335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257646  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  34.02 
 
 
342 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.49 
 
 
333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.82 
 
 
342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1223  alcohol dehydrogenase  31.75 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135954  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.34 
 
 
342 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.91 
 
 
338 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0329198 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3405  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.95 
 
 
348 aa  160  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0198026  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0698  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.15 
 
 
349 aa  160  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.13 
 
 
346 aa  159  6e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.91 
 
 
344 aa  159  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1736  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.5 
 
 
349 aa  159  8e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4509  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.14 
 
 
343 aa  159  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.43 
 
 
344 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120973 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2864  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.18 
 
 
359 aa  159  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0235  alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
347 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0241  alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
347 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2145  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  35.98 
 
 
346 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552645  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5476  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.4 
 
 
335 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.48 
 
 
341 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0154  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.71 
 
 
339 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186872  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5447  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.24 
 
 
350 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187392  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3230  alcohol dehydrogenase  34.67 
 
 
338 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2436  alcohol dehydrogenase  31.98 
 
 
345 aa  156  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07150  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  32.7 
 
 
340 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439183  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2119  dehydrogenase starvation-sensing protein  29.97 
 
 
340 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0233  L-threonine 3-dehydrogenase  30.29 
 
 
345 aa  154  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.43371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5268  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.71 
 
 
346 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1714  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.64 
 
 
352 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4509  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.4 
 
 
343 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0619  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.99 
 
 
339 aa  153  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1653  starvation sensing protein RspB  33.7 
 
 
288 aa  153  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00258422  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.05 
 
 
350 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.54 
 
 
323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2070  alcohol dehydrogenase  33.75 
 
 
336 aa  152  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.97 
 
 
356 aa  152  8.999999999999999e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0178  alcohol dehydrogenase  32.72 
 
 
336 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6469  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.82 
 
 
345 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>