More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5476 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5476  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 		 335 aa  685    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1223  alcohol dehydrogenase  91.94 
 
 		 335 aa  642    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135954  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1249  alcohol dehydrogenase  91.94 
 
 		 335 aa  642    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6310  alcohol dehydrogenase  77.98 
 
 		 345 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6469  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  78.27 
 
 		 345 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6704  alcohol dehydrogenase  78.27 
 
 		 345 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710863  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6341  alcohol dehydrogenase  77.08 
 
 		 336 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00479428  normal  0.719872 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2070  alcohol dehydrogenase  71.94 
 
 		 336 aa  505  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5128  zinc-binding dehydrogenase  54.93 
 
 		 337 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0178  alcohol dehydrogenase  54.03 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1540  alcohol dehydrogenase  53.75 
 
 		 336 aa  359  4e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.931266 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0797  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  49.55 
 
 		 338 aa  353  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121673  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5642  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.04 
 
 		 337 aa  348  7e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  48.51 
 
 		 356 aa  345  7e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1736  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  50.6 
 
 		 349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0154  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.19 
 
 		 339 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0262  alcohol dehydrogenase  49.55 
 
 		 327 aa  333  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1608  putative Zn-dependent dehydrogenase  49.55 
 
 		 330 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.587808  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2739  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.57 
 
 		 337 aa  332  7.000000000000001e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.112956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50.75 
 
 		 338 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0329198 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3230  alcohol dehydrogenase  50.74 
 
 		 338 aa  328  6e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0286  alcohol dehydrogenase  49.55 
 
 		 330 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3317  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.97 
 
 		 338 aa  320  3e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  hitchhiker  0.0000240679 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1260  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.54 
 
 		 339 aa  311  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.785941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1421  alcohol dehydrogenase  44.84 
 
 		 343 aa  298  9e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0059  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.58 
 
 		 340 aa  276  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3328  hypothetical protein  42.14 
 
 		 338 aa  275  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.463233 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0065  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.09 
 
 		 340 aa  267  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3320  hypothetical protein  42.73 
 
 		 338 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.915678 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3425  hypothetical protein  43.07 
 
 		 338 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.955308  hitchhiker  0.00600667 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3244  hypothetical protein  43.07 
 
 		 338 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  43.07 
 
 		 340 aa  266  4e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0102074  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4903  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  43.07 
 
 		 340 aa  266  4e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5871  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  43.07 
 
 		 340 aa  266  5e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04235  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  43.07 
 
 		 340 aa  266  5e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.767219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3639  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.07 
 
 		 340 aa  266  5e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4590  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  43.07 
 
 		 340 aa  266  5e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00423136  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04201  hypothetical protein  43.07 
 
 		 340 aa  266  5e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.774265  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3697  alcohol dehydrogenase  42.77 
 
 		 340 aa  266  5e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587402 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  42.01 
 
 		 337 aa  263  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4898  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  42.77 
 
 		 340 aa  263  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3303  zinc-binding dehydrogenase family protein  40.53 
 
 		 338 aa  261  8e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0731443 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0577  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.12 
 
 		 342 aa  248  9e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.105265  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4706  alcohol dehydrogenase  40.53 
 
 		 341 aa  240  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.8 
 
 		 337 aa  208  9e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07150  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  39.3 
 
 		 340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439183  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4931  alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 		 337 aa  182  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0021  Zn-binding dehydrogenase  32.36 
 
 		 352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0554419  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.1 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.1 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.1 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.1 
 
 		 341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.1 
 
 		 341 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3903  alcohol dehydrogenase  33.8 
 
 		 338 aa  173  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  34.98 
 
 		 338 aa  170  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  33.96 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.25 
 
 		 341 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.18 
 
 		 344 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.13 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.38 
 
 		 351 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  30.4 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.49 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2551  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.75 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163607  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1614  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.7 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000216473  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3592  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.94 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2119  dehydrogenase starvation-sensing protein  31.87 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4598  putative dehydrogenase  32 
 
 		 343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5131  putative dehydrogenase  32 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.869856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0584  putative dehydrogenase  32.54 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.24761  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0765  putative dehydrogenase  32.12 
 
 		 343 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0512  putative dehydrogenase  32.12 
 
 		 343 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 346 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0695  putative dehydrogenase  32.12 
 
 		 343 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2097  putative dehydrogenase  32.12 
 
 		 343 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2002  putative dehydrogenase  32.12 
 
 		 343 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3875  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.93 
 
 		 344 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.177678  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1649  putative dehydrogenase  32.12 
 
 		 343 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.78 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0953  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.12 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00776384  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  36.52 
 
 		 352 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1608  putative dehydrogenase  31.23 
 
 		 339 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.13 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1676  putative dehydrogenase  30.93 
 
 		 339 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1617  putative dehydrogenase  30.93 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3564  alcohol dehydrogenase  29.36 
 
 		 347 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1666  putative dehydrogenase  30.93 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.747821  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.94 
 
 		 347 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1144  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.68 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.129111 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3582  alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  31.06 
 
 		 322 aa  144  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.860675 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.83 
 
 		 346 aa  144  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1933  putative dehydrogenase  30.72 
 
 		 339 aa  143  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  33.02 
 
 		 339 aa  143  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0537  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.56 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00294504  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7070  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 346 aa  142  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  30.09 
 
 		 343 aa  142  8e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.5 
 
 		 323 aa  142  9e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  33.03 
 
 		 339 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.03 
 
 		 339 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  33.03 
 
 		 339 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>