More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1144 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1144  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  100 
 
 
323 aa  647    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.129111 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0992  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.31 
 
 
326 aa  319  3e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1113  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.38 
 
 
320 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0770  alcohol dehydrogenase  47.83 
 
 
321 aa  276  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00613196  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0087  alcohol dehydrogenase  43.03 
 
 
325 aa  240  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  34.3 
 
 
346 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_002936  DET0125  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.9 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000121162  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3256  alcohol dehydrogenase  32.95 
 
 
345 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.52 
 
 
346 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.61 
 
 
343 aa  170  3e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00243149  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0178  alcohol dehydrogenase  33.99 
 
 
336 aa  165  8e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0246  alcohol dehydrogenase  35.61 
 
 
343 aa  165  9e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000123303  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0614  alcohol dehydrogenase  31.89 
 
 
318 aa  156  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0116847  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5128  zinc-binding dehydrogenase  32.56 
 
 
337 aa  152  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5268  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.87 
 
 
346 aa  152  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.53 
 
 
333 aa  152  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1804  alcohol dehydrogenase  32.95 
 
 
349 aa  152  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0633  alcohol dehydrogenase  31.03 
 
 
317 aa  151  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2070  alcohol dehydrogenase  33.97 
 
 
336 aa  151  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3405  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.34 
 
 
348 aa  149  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0198026  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2145  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  32.28 
 
 
346 aa  149  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552645  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1249  alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 
335 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257646  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7070  alcohol dehydrogenase  31.74 
 
 
346 aa  149  8e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  31.45 
 
 
327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4221  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.03 
 
 
346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.41128  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3875  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.29 
 
 
344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.177678  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1530  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.31 
 
 
367 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540116  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0953  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.98 
 
 
336 aa  146  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00776384  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5590  alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 
354 aa  145  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
345 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1223  alcohol dehydrogenase  32.65 
 
 
335 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135954  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1218  alcohol dehydrogenase  30.75 
 
 
361 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852101  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  30.06 
 
 
337 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5476  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.68 
 
 
335 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0059  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.22 
 
 
340 aa  144  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1736  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.15 
 
 
349 aa  144  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4706  alcohol dehydrogenase  31.6 
 
 
341 aa  142  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0065  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.22 
 
 
340 aa  143  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3230  alcohol dehydrogenase  31.87 
 
 
338 aa  142  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5871  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.31 
 
 
340 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1589  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.21 
 
 
341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6469  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.52 
 
 
345 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6704  alcohol dehydrogenase  29.52 
 
 
345 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710863  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.22 
 
 
342 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  29.33 
 
 
356 aa  139  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6310  alcohol dehydrogenase  29.52 
 
 
345 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  31.4 
 
 
336 aa  139  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04235  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  31.96 
 
 
340 aa  139  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.767219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3639  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.96 
 
 
340 aa  139  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04201  hypothetical protein  31.96 
 
 
340 aa  139  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.774265  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4590  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.96 
 
 
340 aa  139  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00423136  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.96 
 
 
340 aa  139  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0102074  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4903  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.96 
 
 
340 aa  139  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363717  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3697  alcohol dehydrogenase  31.65 
 
 
340 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587402 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.77 
 
 
337 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1540  alcohol dehydrogenase  31.01 
 
 
336 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.931266 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4898  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  39.79 
 
 
340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0797  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.33 
 
 
338 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121673  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.52 
 
 
344 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120973 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3165  alcohol dehydrogenase  29.43 
 
 
352 aa  135  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3303  zinc-binding dehydrogenase family protein  29.47 
 
 
338 aa  135  9e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0731443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3317  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.71 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  hitchhiker  0.0000240679 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0286  alcohol dehydrogenase  32.3 
 
 
330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  32.52 
 
 
344 aa  133  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3328  hypothetical protein  28.66 
 
 
338 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.463233 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.35 
 
 
323 aa  132  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.71 
 
 
346 aa  132  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0154  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.97 
 
 
339 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186872  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  33.99 
 
 
322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.860675 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0603  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  31.6 
 
 
338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000710686  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  32.33 
 
 
339 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.83 
 
 
329 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4598  putative dehydrogenase  31.31 
 
 
343 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4840  alcohol dehydrogenase  30.89 
 
 
330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5131  putative dehydrogenase  31.31 
 
 
343 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.869856  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1030  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.61 
 
 
346 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0743662  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2739  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.15 
 
 
337 aa  129  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.112956  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5642  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.46 
 
 
337 aa  129  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  28.83 
 
 
341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  30.17 
 
 
337 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  28.53 
 
 
341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3364  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.78 
 
 
367 aa  127  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0600954 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  33 
 
 
339 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.1 
 
 
338 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.3 
 
 
336 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1608  putative Zn-dependent dehydrogenase  32.1 
 
 
330 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.587808  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  28.53 
 
 
341 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0262  alcohol dehydrogenase  30.88 
 
 
327 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  28.53 
 
 
341 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  32.51 
 
 
339 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0537  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.78 
 
 
325 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00294504  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  28.53 
 
 
341 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1653  starvation sensing protein RspB  32.51 
 
 
288 aa  125  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00258422  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.84 
 
 
338 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0329198 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.51 
 
 
339 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0807  alcohol dehydrogenase  29.87 
 
 
346 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0463124 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3425  hypothetical protein  29.32 
 
 
338 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.955308  hitchhiker  0.00600667 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  32.51 
 
 
339 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3320  hypothetical protein  29.32 
 
 
338 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.915678 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.7 
 
 
347 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>