More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1030 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1030  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 		 346 aa  705    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0743662  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4221  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40 
 
 		 346 aa  281  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.41128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  36.58 
 
 		 346 aa  265  5.999999999999999e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7070  alcohol dehydrogenase  37.17 
 
 		 346 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3165  alcohol dehydrogenase  36.86 
 
 		 352 aa  261  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5268  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.76 
 
 		 346 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2145  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  38.64 
 
 		 346 aa  256  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1218  alcohol dehydrogenase  36.08 
 
 		 361 aa  256  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5590  alcohol dehydrogenase  36.08 
 
 		 354 aa  257  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  37.39 
 
 		 345 aa  236  5.0000000000000005e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3256  alcohol dehydrogenase  35.47 
 
 		 345 aa  236  6e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1530  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.77 
 
 		 367 aa  227  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3405  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.71 
 
 		 348 aa  227  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0198026  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.23 
 
 		 346 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1804  alcohol dehydrogenase  35.59 
 
 		 349 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.31 
 
 		 346 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_002936  DET0125  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.76 
 
 		 341 aa  212  5.999999999999999e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000121162  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0246  alcohol dehydrogenase  35.76 
 
 		 343 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000123303  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.76 
 
 		 343 aa  202  9e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00243149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.95 
 
 		 344 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.120973 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0685  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.18 
 
 		 338 aa  165  9e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  31.4 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0041  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.7 
 
 		 341 aa  159  5e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000412094  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2347  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.11 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.174722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1306  alcohol dehydrogenase  33.03 
 
 		 348 aa  154  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0970  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.93 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1007  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  26.97 
 
 		 351 aa  152  8e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  29.36 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.61 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0196  alcohol dehydrogenase  31.14 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.583804  normal  0.0665338 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2463  alcohol dehydrogenase  30.14 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0146  alcohol dehydrogenase  30.72 
 
 		 345 aa  150  4e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0359  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.97 
 
 		 366 aa  149  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1113  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.57 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5447  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.77 
 
 		 350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  27.22 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.1 
 
 		 341 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.1 
 
 		 341 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.1 
 
 		 341 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1170  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.12 
 
 		 349 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.79 
 
 		 341 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  27.43 
 
 		 341 aa  146  6e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  27.43 
 
 		 341 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  31.79 
 
 		 341 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3901  L-threonine 3-dehydrogenase  27.43 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00409651  normal  0.55097 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4105  L-threonine 3-dehydrogenase  27.43 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287848  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2220  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.45 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.135715 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3828  L-threonine 3-dehydrogenase  27.51 
 
 		 341 aa  144  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4341  L-threonine 3-dehydrogenase  26.55 
 
 		 341 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03474  L-threonine 3-dehydrogenase  27.51 
 
 		 341 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0601715  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3907  L-threonine 3-dehydrogenase  27.06 
 
 		 341 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05001  L-threonine 3-dehydrogenase  28.4 
 
 		 360 aa  144  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3953  L-threonine 3-dehydrogenase  27.51 
 
 		 341 aa  144  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0503034  normal  0.824331 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03425  hypothetical protein  27.51 
 
 		 341 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3988  L-threonine 3-dehydrogenase  27.06 
 
 		 341 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2739  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.68 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.112956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1743  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.27 
 
 		 374 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.789152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4094  L-threonine 3-dehydrogenase  27.06 
 
 		 341 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4033  L-threonine 3-dehydrogenase  27.06 
 
 		 341 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0092  L-threonine 3-dehydrogenase  27.51 
 
 		 341 aa  144  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.212636  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  26.84 
 
 		 341 aa  144  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4044  L-threonine 3-dehydrogenase  27.51 
 
 		 341 aa  144  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3926  L-threonine 3-dehydrogenase  27.06 
 
 		 341 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0089  L-threonine 3-dehydrogenase  27.51 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0100  L-threonine 3-dehydrogenase  26.63 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.173553 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4144  L-threonine 3-dehydrogenase  26.63 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.498759  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0449  L-threonine 3-dehydrogenase  28.53 
 
 		 361 aa  143  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5320  L-threonine 3-dehydrogenase  29.29 
 
 		 342 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0072  L-threonine 3-dehydrogenase  26.63 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0066  L-threonine 3-dehydrogenase  26.55 
 
 		 341 aa  143  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4973  L-threonine 3-dehydrogenase  29.59 
 
 		 342 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.554494  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3710  L-threonine 3-dehydrogenase  26.92 
 
 		 341 aa  143  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4160  L-threonine 3-dehydrogenase  29.67 
 
 		 342 aa  142  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3178  L-threonine 3-dehydrogenase  29.17 
 
 		 342 aa  142  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3116  L-threonine 3-dehydrogenase  29.29 
 
 		 342 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.717555 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4120  L-threonine 3-dehydrogenase  27.51 
 
 		 341 aa  142  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.357417  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4989  L-threonine 3-dehydrogenase  27.51 
 
 		 341 aa  142  8e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2095  L-threonine 3-dehydrogenase  27.41 
 
 		 345 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0119  L-threonine 3-dehydrogenase  27.35 
 
 		 341 aa  142  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0106  L-threonine 3-dehydrogenase  26.63 
 
 		 341 aa  142  8e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588963  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0075  sorbitol dehydrogenase, putative  28.48 
 
 		 348 aa  141  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  26.25 
 
 		 341 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2661  L-threonine 3-dehydrogenase  29.76 
 
 		 346 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0006  L-threonine 3-dehydrogenase  29.29 
 
 		 343 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1512  L-threonine 3-dehydrogenase  29.29 
 
 		 343 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0353  L-threonine 3-dehydrogenase  28.11 
 
 		 343 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0233  alcohol dehydrogenase  29.08 
 
 		 351 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0992  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.82 
 
 		 326 aa  142  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0062  L-threonine 3-dehydrogenase  26.84 
 
 		 340 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.39 
 
 		 329 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1432  L-threonine 3-dehydrogenase  29.29 
 
 		 343 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4286  L-threonine 3-dehydrogenase  26.25 
 
 		 341 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000588728 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  26.25 
 
 		 341 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0239  alcohol dehydrogenase  29.08 
 
 		 351 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0006  L-threonine 3-dehydrogenase  29.29 
 
 		 343 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936478  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00067  L-threonine 3-dehydrogenase  26.33 
 
 		 341 aa  141  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0006  L-threonine 3-dehydrogenase  29.29 
 
 		 343 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0007  L-threonine 3-dehydrogenase  29.29 
 
 		 343 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.237262  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1152  L-threonine 3-dehydrogenase  29.29 
 
 		 343 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1783  L-threonine 3-dehydrogenase  26.81 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>