More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5268 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5268  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
346 aa  693    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  70.81 
 
 
346 aa  496  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7070  alcohol dehydrogenase  69.94 
 
 
346 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4221  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  65.03 
 
 
346 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.41128  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2145  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  68.21 
 
 
346 aa  448  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552645  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1218  alcohol dehydrogenase  62.78 
 
 
361 aa  449  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852101  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3165  alcohol dehydrogenase  62.22 
 
 
352 aa  447  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5590  alcohol dehydrogenase  62.5 
 
 
354 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.57 
 
 
346 aa  275  6e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3256  alcohol dehydrogenase  39.19 
 
 
345 aa  258  9e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1030  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.76 
 
 
346 aa  258  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0743662  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1530  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.12 
 
 
367 aa  256  6e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540116  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  39.37 
 
 
345 aa  250  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3405  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.97 
 
 
348 aa  250  3e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0198026  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1804  alcohol dehydrogenase  39.6 
 
 
349 aa  246  3e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0125  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40 
 
 
341 aa  240  2e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000121162  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0246  alcohol dehydrogenase  42.32 
 
 
343 aa  238  9e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000123303  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.54 
 
 
344 aa  236  6e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120973 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.84 
 
 
343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00243149  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.93 
 
 
346 aa  228  8e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1170  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.64 
 
 
349 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2347  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.57 
 
 
341 aa  201  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.174722  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0041  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.78 
 
 
341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000412094  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1007  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  36.52 
 
 
351 aa  197  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2463  alcohol dehydrogenase  35.73 
 
 
338 aa  188  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1744  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34 
 
 
345 aa  187  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.681848  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  35.22 
 
 
336 aa  182  7e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.92 
 
 
342 aa  179  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.43 
 
 
350 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  33.43 
 
 
350 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  33.43 
 
 
350 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.43 
 
 
350 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.14 
 
 
350 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.14 
 
 
350 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3723  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  33.43 
 
 
349 aa  178  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
350 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.14 
 
 
350 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
350 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.14 
 
 
350 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1079  alcohol dehydrogenase  31.21 
 
 
342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1743  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.43 
 
 
374 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.789152  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0233  alcohol dehydrogenase  32.29 
 
 
351 aa  169  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0239  alcohol dehydrogenase  32.29 
 
 
351 aa  169  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0970  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.56 
 
 
345 aa  168  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0154  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.14 
 
 
356 aa  166  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0626  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.99 
 
 
348 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.122576  normal  0.0367599 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3786  alcohol dehydrogenase  32.22 
 
 
369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0107971 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2089  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.15 
 
 
385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4721  alcohol dehydrogenase  31.94 
 
 
362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.36355 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4198  alcohol dehydrogenase  32.22 
 
 
362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0351  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.01 
 
 
357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0953  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.09 
 
 
336 aa  162  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00776384  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2268  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
358 aa  162  8.000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.396502  hitchhiker  0.0088894 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0887  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.94 
 
 
362 aa  162  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3233  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.94 
 
 
365 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
341 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5466  alcohol dehydrogenase  31.67 
 
 
362 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.0829425 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0359  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.81 
 
 
366 aa  161  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3550  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.67 
 
 
362 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
341 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.1 
 
 
329 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4817  alcohol dehydrogenase  31.67 
 
 
362 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.562057  normal  0.226619 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
341 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
341 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0196  alcohol dehydrogenase  32.27 
 
 
338 aa  160  4e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.583804  normal  0.0665338 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0685  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.37 
 
 
338 aa  159  6e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 
341 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22030  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  29.53 
 
 
375 aa  159  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255526  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1007  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.14 
 
 
348 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.706693  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.28 
 
 
348 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1810  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.19 
 
 
378 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1099  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.19 
 
 
378 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.488512  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0459  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.47 
 
 
378 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.479531  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  31.86 
 
 
373 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2072  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.19 
 
 
378 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0808  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.19 
 
 
378 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0364  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.19 
 
 
378 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1795  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.19 
 
 
378 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0503  alcohol dehydrogenase  30.85 
 
 
362 aa  156  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472686 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03240  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  30.3 
 
 
358 aa  155  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129511  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.91 
 
 
338 aa  155  8e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4509  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.88 
 
 
343 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2055  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.61 
 
 
363 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.97 
 
 
354 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.02 
 
 
373 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  32.97 
 
 
365 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  31.02 
 
 
373 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  30.95 
 
 
344 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  33.71 
 
 
339 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  32.69 
 
 
354 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  31.02 
 
 
373 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.02 
 
 
373 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29840  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  32.87 
 
 
362 aa  153  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.64 
 
 
335 aa  153  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1144  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.87 
 
 
323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.129111 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1727  zinc-binding dehydrogenase  32.29 
 
 
352 aa  152  8e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0556  alcohol dehydrogenase  34.65 
 
 
343 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46957  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1668  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.65 
 
 
343 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1692  alcohol dehydrogenase  34.65 
 
 
343 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>