More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1727 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1727  zinc-binding dehydrogenase  100 
 
 
352 aa  717    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0010  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.94 
 
 
346 aa  345  5e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.133832  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.55 
 
 
346 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1380  alcohol dehydrogenase  46.69 
 
 
348 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378076  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3075  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  45.53 
 
 
347 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1928  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.4 
 
 
370 aa  312  5.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0194  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  47.59 
 
 
345 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4997  alcohol dehydrogenase  46.4 
 
 
348 aa  310  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5564  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.59 
 
 
346 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175264  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1221  alcohol dehydrogenase  45.82 
 
 
343 aa  310  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1860  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.88 
 
 
346 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.71 
 
 
346 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.539752  normal  0.655263 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0322  alcohol dehydrogenase  45.8 
 
 
347 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.65143  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4548  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.66 
 
 
355 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00643704 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3962  alcohol dehydrogenase  45.74 
 
 
351 aa  308  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1334  alcohol dehydrogenase  46.08 
 
 
344 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4415  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.66 
 
 
345 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5816  alcohol dehydrogenase  46.08 
 
 
346 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.136095 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2090  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.74 
 
 
351 aa  306  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000167964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4901  alcohol dehydrogenase  44.67 
 
 
360 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4290  alcohol dehydrogenase  46.43 
 
 
346 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1565  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  46.85 
 
 
349 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.965017  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0924  putative zinc-dependent alcohol dehydrogenase (oxidoreductase)  46.11 
 
 
345 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.175832  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3657  alcohol dehydrogenase  45.95 
 
 
347 aa  303  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal  0.2926 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3822  alcohol dehydrogenase  45.97 
 
 
346 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.24 
 
 
345 aa  301  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0642635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1073  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  45.53 
 
 
351 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1089  alcohol dehydrogenase  45.53 
 
 
351 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25524  normal  0.164937 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5892  alcohol dehydrogenase  45.95 
 
 
346 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.032769  normal  0.939128 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2034  hypothetical protein  44.51 
 
 
346 aa  296  3e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1713  alcohol dehydrogenase  46.69 
 
 
343 aa  296  4e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1234  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  45.35 
 
 
346 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0709  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.35 
 
 
346 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.470076  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1718  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.35 
 
 
346 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2432  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.35 
 
 
346 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1160  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  45.35 
 
 
346 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0753  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.35 
 
 
346 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574599  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1637  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  42.61 
 
 
351 aa  295  7e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000634163  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1091  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  44.38 
 
 
342 aa  291  8e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3239  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  43.93 
 
 
356 aa  287  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2137  alcohol dehydrogenase  43.22 
 
 
351 aa  278  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0423941 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0219  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.43 
 
 
350 aa  276  3e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2366  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.09 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.0010665  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1100  alcohol dehydrogenase  47 
 
 
299 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0318515  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.13 
 
 
389 aa  268  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1112  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.12 
 
 
351 aa  267  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.257407  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4500  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40 
 
 
392 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.64 
 
 
392 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.715601  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2112  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.24 
 
 
350 aa  259  3e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0323338  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.72 
 
 
384 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.15 
 
 
388 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0165  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.99 
 
 
389 aa  256  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.21 
 
 
384 aa  256  5e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14774  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4498  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.13 
 
 
389 aa  253  5.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1778  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.63 
 
 
382 aa  249  4e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.080092  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.28 
 
 
382 aa  247  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  hitchhiker  0.000850612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0575  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.6 
 
 
389 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1320  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.23 
 
 
384 aa  245  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106118  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2149  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.6 
 
 
386 aa  245  8e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.406335  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2064  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  41.9 
 
 
357 aa  245  9e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.39 
 
 
405 aa  245  9e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4893  alcohol dehydrogenase  39.43 
 
 
330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709624  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1356  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  39.62 
 
 
366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5561  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.76 
 
 
389 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210102  normal  0.0249106 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0065  alcohol dehydrogenase  37.37 
 
 
386 aa  242  5e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0322  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.82 
 
 
387 aa  241  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3346  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.55 
 
 
357 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5645  alcohol dehydrogenase  41.06 
 
 
357 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.419975 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2008  alcohol dehydrogenase protein  38.08 
 
 
364 aa  239  4e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3188  alcohol dehydrogenase  37.57 
 
 
366 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07420  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  40.22 
 
 
357 aa  239  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0835  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.81 
 
 
396 aa  239  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.202579 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2370  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.24 
 
 
389 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0967  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.35 
 
 
366 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.635093  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1049  alcohol dehydrogenase  39.35 
 
 
366 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.050805 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3187  alcohol dehydrogenase  37.24 
 
 
389 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4057  alcohol dehydrogenase  37.09 
 
 
433 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.788461  normal  0.848638 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5445  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.47 
 
 
390 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.430041  normal  0.349478 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5822  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.15 
 
 
391 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0669  alcohol dehydrogenase  40.22 
 
 
374 aa  236  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.704397  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3148  alcohol dehydrogenase  37.96 
 
 
382 aa  236  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.539421  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3465  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.75 
 
 
366 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.901244  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1281  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.85 
 
 
392 aa  235  8e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.368078  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0166  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  37.12 
 
 
395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912922  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4212  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.15 
 
 
376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000750849  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  36.75 
 
 
384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.682346 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3032  alcohol dehydrogenase  38.83 
 
 
357 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289929  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0139  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.32 
 
 
401 aa  233  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.46 
 
 
393 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.58 
 
 
382 aa  233  5e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6246  alcohol dehydrogenase  35.9 
 
 
389 aa  233  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.829786 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1223  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.48 
 
 
390 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000417243 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0203  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.28 
 
 
357 aa  232  6e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0325811 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3852  alcohol dehydrogenase  38.75 
 
 
365 aa  232  8.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5217  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.05 
 
 
384 aa  231  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2657  alcohol dehydrogenase  36.76 
 
 
388 aa  231  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3112  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  36.48 
 
 
388 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.152698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0122  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.06 
 
 
401 aa  229  6e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.566245 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4017  alcohol dehydrogenase  36.84 
 
 
382 aa  229  6e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.530875 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3368  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.79 
 
 
384 aa  229  8e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>