More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_29840 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_29840  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  100 
 
 
362 aa  741    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2554  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  64.07 
 
 
362 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2599  alcohol dehydrogenase  64.07 
 
 
362 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139182  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2593  alcohol dehydrogenase  64.07 
 
 
362 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0149814  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2089  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  65.07 
 
 
385 aa  464  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2055  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.1 
 
 
363 aa  426  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0359  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  53.74 
 
 
366 aa  383  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0887  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.06 
 
 
362 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5466  alcohol dehydrogenase  53.24 
 
 
362 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.0829425 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3786  alcohol dehydrogenase  53.52 
 
 
369 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0107971 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3550  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  53.24 
 
 
362 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4817  alcohol dehydrogenase  53.24 
 
 
362 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.562057  normal  0.226619 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4721  alcohol dehydrogenase  53.24 
 
 
362 aa  362  4e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.36355 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03240  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  50.42 
 
 
358 aa  362  6e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129511  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4198  alcohol dehydrogenase  52.68 
 
 
362 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4579  alcohol dehydrogenase  50.97 
 
 
373 aa  360  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22030  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  50.55 
 
 
375 aa  358  6e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255526  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3224  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50.29 
 
 
357 aa  354  1e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0952  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.31 
 
 
359 aa  354  2e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000662515  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1810  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  49.72 
 
 
378 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1099  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  49.72 
 
 
378 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.488512  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2072  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  49.72 
 
 
378 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0808  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  49.72 
 
 
378 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2567  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.84 
 
 
371 aa  350  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134706  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2432  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  50.99 
 
 
363 aa  351  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319398  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0364  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  49.44 
 
 
378 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0503  alcohol dehydrogenase  50.84 
 
 
362 aa  348  6e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472686 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0459  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  49.16 
 
 
378 aa  348  6e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.479531  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1795  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  49.16 
 
 
378 aa  348  7e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1506  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  48.34 
 
 
408 aa  348  8e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000397792  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3233  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50.28 
 
 
365 aa  348  9e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1610  alcohol dehydrogenase  48.34 
 
 
408 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1762  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  48.34 
 
 
355 aa  346  4e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0108342  hitchhiker  0.000113364 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0341  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.58 
 
 
379 aa  345  8.999999999999999e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.384488  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0860  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  50.99 
 
 
363 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183529  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0301  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  50.99 
 
 
430 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0487501  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1639  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  50.99 
 
 
363 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.514454  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1195  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  50.99 
 
 
353 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184304  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1924  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  50.7 
 
 
363 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2072  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  50.7 
 
 
422 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.055624  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1911  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  50.7 
 
 
363 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.197112  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3288  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  48.48 
 
 
371 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3421  alcohol dehydrogenase  48.48 
 
 
371 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219023  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  48.48 
 
 
371 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.286052  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5590  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
354 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1218  alcohol dehydrogenase  32.7 
 
 
361 aa  169  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852101  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  31.78 
 
 
365 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 
346 aa  169  8e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3165  alcohol dehydrogenase  32.61 
 
 
352 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1029  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.34 
 
 
356 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432101  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.94 
 
 
354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.67 
 
 
354 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  29.44 
 
 
345 aa  166  8e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  31.67 
 
 
354 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  31.84 
 
 
354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  31.56 
 
 
354 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  29.11 
 
 
336 aa  162  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5447  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.16 
 
 
350 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187392  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  32.07 
 
 
355 aa  161  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  31.99 
 
 
342 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.21 
 
 
342 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  31.42 
 
 
360 aa  156  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  30.66 
 
 
362 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1043  alcohol dehydrogenase  30.25 
 
 
353 aa  155  8e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  31.17 
 
 
363 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  30.39 
 
 
362 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  30.96 
 
 
363 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  30.39 
 
 
362 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2813  alcohol dehydrogenase  31.87 
 
 
341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0594163  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 
364 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5268  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.87 
 
 
346 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4980  alcohol dehydrogenase  31.84 
 
 
357 aa  153  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.155342 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02513  L-threonine 3-dehydrogenase  32.49 
 
 
344 aa  153  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2268  alcohol dehydrogenase  30.81 
 
 
358 aa  152  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.396502  hitchhiker  0.0088894 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.33 
 
 
350 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  32.33 
 
 
350 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  32.33 
 
 
350 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  32.33 
 
 
350 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.02 
 
 
350 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.02 
 
 
350 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.33 
 
 
350 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00067  L-threonine 3-dehydrogenase  31.87 
 
 
341 aa  150  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4931  alcohol dehydrogenase  33.89 
 
 
337 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2786  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.59 
 
 
341 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2830  alcohol dehydrogenase  31.59 
 
 
341 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.782331  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5303  alcohol dehydrogenase  31.28 
 
 
364 aa  149  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803168  normal  0.725419 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.02 
 
 
350 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.02 
 
 
350 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  32.02 
 
 
350 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0449  L-threonine 3-dehydrogenase  31.14 
 
 
361 aa  149  8e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.43 
 
 
352 aa  149  8e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0806  L-threonine 3-dehydrogenase  31.07 
 
 
345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.384791  normal  0.0311544 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.73 
 
 
346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3944  L-threonine 3-dehydrogenase  30.81 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4221  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.42 
 
 
346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.41128  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  30.11 
 
 
346 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1995  L-threonine 3-dehydrogenase  31.52 
 
 
348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.271324  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0062  L-threonine 3-dehydrogenase  30.99 
 
 
340 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0201  L-threonine 3-dehydrogenase  31.52 
 
 
342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0698  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.4 
 
 
349 aa  147  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>