More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2567 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1810  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  81.74 
 
 
378 aa  638    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2072  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  81.74 
 
 
378 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2567  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  100 
 
 
371 aa  766    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134706  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1795  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  81.74 
 
 
378 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1099  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  81.74 
 
 
378 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.488512  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0364  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  82.02 
 
 
378 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0459  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  82.02 
 
 
378 aa  638    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.479531  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0808  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  81.74 
 
 
378 aa  638    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22030  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  61.08 
 
 
375 aa  476  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255526  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0359  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  62.12 
 
 
366 aa  465  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3421  alcohol dehydrogenase  61.77 
 
 
371 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219023  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  61.77 
 
 
371 aa  464  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.286052  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3288  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  61.77 
 
 
371 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03240  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  60.96 
 
 
358 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129511  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2055  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.96 
 
 
363 aa  434  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2554  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  54.02 
 
 
362 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2593  alcohol dehydrogenase  54.02 
 
 
362 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0149814  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2599  alcohol dehydrogenase  54.02 
 
 
362 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139182  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1506  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  53.17 
 
 
408 aa  403  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000397792  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1610  alcohol dehydrogenase  53.17 
 
 
408 aa  403  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1762  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  53.22 
 
 
355 aa  398  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0108342  hitchhiker  0.000113364 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0341  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.8 
 
 
379 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.384488  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0952  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.22 
 
 
359 aa  385  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000662515  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4579  alcohol dehydrogenase  52.38 
 
 
373 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2089  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.14 
 
 
385 aa  385  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3224  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.25 
 
 
357 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0887  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.08 
 
 
362 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3550  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  52.35 
 
 
362 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5466  alcohol dehydrogenase  52.35 
 
 
362 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.0829425 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4817  alcohol dehydrogenase  52.35 
 
 
362 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.562057  normal  0.226619 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3786  alcohol dehydrogenase  51.08 
 
 
369 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0107971 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3233  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.12 
 
 
365 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4721  alcohol dehydrogenase  51.8 
 
 
362 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.36355 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4198  alcohol dehydrogenase  51.25 
 
 
362 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0503  alcohol dehydrogenase  51.4 
 
 
362 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472686 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29840  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  50.84 
 
 
362 aa  365  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2432  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  49.72 
 
 
363 aa  361  9e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319398  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2072  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  49.33 
 
 
422 aa  358  9e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.055624  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0301  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  49.06 
 
 
430 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0487501  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0860  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  50 
 
 
363 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183529  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1911  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  50.28 
 
 
363 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.197112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1924  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  50.28 
 
 
363 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1639  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  50 
 
 
363 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.514454  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1195  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  50.28 
 
 
353 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184304  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  33.7 
 
 
365 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.18 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  31.18 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  31.18 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.18 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.9 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  31.18 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.9 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
354 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.8 
 
 
354 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 
354 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.9 
 
 
350 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.9 
 
 
350 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  30.9 
 
 
350 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  32.03 
 
 
345 aa  182  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.24 
 
 
354 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.59 
 
 
342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  31.56 
 
 
362 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  31.56 
 
 
362 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  31.56 
 
 
362 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 
364 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1166  alcohol dehydrogenase  30.96 
 
 
351 aa  170  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  31.55 
 
 
352 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  31.23 
 
 
363 aa  169  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5590  alcohol dehydrogenase  31.78 
 
 
354 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1029  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.6 
 
 
356 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432101  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  31.34 
 
 
363 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3165  alcohol dehydrogenase  31.71 
 
 
352 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  30.49 
 
 
360 aa  166  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0351  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.51 
 
 
357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2268  alcohol dehydrogenase  30.83 
 
 
358 aa  163  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.396502  hitchhiker  0.0088894 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1218  alcohol dehydrogenase  31.54 
 
 
361 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852101  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1743  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.33 
 
 
374 aa  162  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.789152  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  30.51 
 
 
337 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0293  L-threonine 3-dehydrogenase  30.99 
 
 
347 aa  160  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5628  L-threonine 3-dehydrogenase  30.9 
 
 
341 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0490  alcohol dehydrogenase  30.9 
 
 
341 aa  159  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283915  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2235  alcohol dehydrogenase  30.9 
 
 
341 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0565  alcohol dehydrogenase  30.9 
 
 
341 aa  159  8e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678248  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1644  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.9 
 
 
341 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1619  alcohol dehydrogenase  30.9 
 
 
341 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0660  alcohol dehydrogenase  30.9 
 
 
341 aa  159  8e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1670  alcohol dehydrogenase  30.9 
 
 
341 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  29.86 
 
 
355 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.27 
 
 
346 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5268  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.14 
 
 
346 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01743  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  29.64 
 
 
347 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.64 
 
 
347 aa  155  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29 
 
 
373 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  29 
 
 
373 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2498  sorbitol dehydrogenase  29.64 
 
 
347 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503095  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2059  sorbitol dehydrogenase  30.54 
 
 
347 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  hitchhiker  0.0031409 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01731  hypothetical protein  29.64 
 
 
347 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2813  alcohol dehydrogenase  31.39 
 
 
341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0594163  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2013  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.73 
 
 
344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.238084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>