More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3233 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_0860  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  84.25 
 
 
363 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183529  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3786  alcohol dehydrogenase  85.52 
 
 
369 aa  658    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0107971 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2072  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  83.2 
 
 
422 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.055624  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0887  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  85.52 
 
 
362 aa  651    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2432  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  86.94 
 
 
363 aa  657    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319398  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1924  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  83.98 
 
 
363 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0503  alcohol dehydrogenase  90.63 
 
 
362 aa  689    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472686 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3550  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  85.24 
 
 
362 aa  652    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5466  alcohol dehydrogenase  85.24 
 
 
362 aa  652    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.0829425 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0301  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  83.47 
 
 
430 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0487501  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1639  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  84.25 
 
 
363 aa  637    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.514454  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4198  alcohol dehydrogenase  85.24 
 
 
362 aa  650    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1911  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  83.98 
 
 
363 aa  637    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.197112  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4817  alcohol dehydrogenase  85.24 
 
 
362 aa  652    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.562057  normal  0.226619 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3233  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
365 aa  751    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4721  alcohol dehydrogenase  84.96 
 
 
362 aa  649    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.36355 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1195  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  85.51 
 
 
353 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184304  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0341  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  80 
 
 
379 aa  598  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.384488  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4579  alcohol dehydrogenase  66.94 
 
 
373 aa  535  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1506  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  67.71 
 
 
408 aa  518  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000397792  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1610  alcohol dehydrogenase  67.71 
 
 
408 aa  518  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1762  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  67.71 
 
 
355 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0108342  hitchhiker  0.000113364 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03240  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  53.93 
 
 
358 aa  403  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129511  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2055  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.89 
 
 
363 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0359  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  53.35 
 
 
366 aa  395  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22030  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  51.64 
 
 
375 aa  396  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255526  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3224  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.46 
 
 
357 aa  389  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0952  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50.43 
 
 
359 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000662515  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  49.58 
 
 
371 aa  369  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.286052  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3288  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  49.58 
 
 
371 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3421  alcohol dehydrogenase  49.58 
 
 
371 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219023  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0364  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  50.84 
 
 
378 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1810  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  51.12 
 
 
378 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0808  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  51.12 
 
 
378 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2554  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  48.48 
 
 
362 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2072  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  51.12 
 
 
378 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2593  alcohol dehydrogenase  48.48 
 
 
362 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0149814  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0459  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  50.84 
 
 
378 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.479531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2599  alcohol dehydrogenase  48.48 
 
 
362 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139182  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1099  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  51.12 
 
 
378 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.488512  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1795  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  50.56 
 
 
378 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2567  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.12 
 
 
371 aa  358  7e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134706  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29840  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  50.28 
 
 
362 aa  348  9e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2089  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.7 
 
 
385 aa  339  5.9999999999999996e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  35.65 
 
 
345 aa  209  5e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.26 
 
 
350 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  34.26 
 
 
350 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  34.26 
 
 
350 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.26 
 
 
350 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.26 
 
 
350 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.26 
 
 
350 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  34.26 
 
 
350 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.98 
 
 
350 aa  189  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  33.98 
 
 
350 aa  189  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.98 
 
 
350 aa  189  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.43 
 
 
346 aa  185  9e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.82 
 
 
346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  33.15 
 
 
373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.52 
 
 
350 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.88 
 
 
373 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.15 
 
 
373 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  33.15 
 
 
373 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.07 
 
 
335 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  32.6 
 
 
373 aa  182  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.4 
 
 
342 aa  182  7e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.42 
 
 
344 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120973 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  32.54 
 
 
350 aa  177  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0233  alcohol dehydrogenase  36.17 
 
 
351 aa  176  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0239  alcohol dehydrogenase  36.17 
 
 
351 aa  176  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  33.15 
 
 
373 aa  176  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1073  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.25 
 
 
351 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1089  alcohol dehydrogenase  34.25 
 
 
351 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25524  normal  0.164937 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  32.59 
 
 
352 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.92 
 
 
336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.04 
 
 
337 aa  167  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3324  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.4 
 
 
350 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0421123  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
354 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1029  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.16 
 
 
356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432101  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  32.7 
 
 
355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.42 
 
 
354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  32.61 
 
 
365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.79 
 
 
354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  32.79 
 
 
354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.2 
 
 
336 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  33.06 
 
 
354 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1714  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.82 
 
 
352 aa  163  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.79 
 
 
346 aa  161  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5268  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.94 
 
 
346 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.44 
 
 
329 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0041  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.32 
 
 
341 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000412094  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1000  putative alcohol dehydrogenase  30.64 
 
 
352 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 
364 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3256  alcohol dehydrogenase  29.41 
 
 
345 aa  159  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3142  alcohol dehydrogenase  33.15 
 
 
373 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.29 
 
 
344 aa  159  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4997  alcohol dehydrogenase  32.78 
 
 
348 aa  159  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  31.44 
 
 
362 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4221  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.79 
 
 
346 aa  159  8e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.41128  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
341 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.59 
 
 
340 aa  158  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>