More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3256 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3256  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
345 aa  695    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.65 
 
 
346 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5268  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.19 
 
 
346 aa  258  9e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  37.97 
 
 
346 aa  255  8e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4221  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.53 
 
 
346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.41128  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1218  alcohol dehydrogenase  38.53 
 
 
361 aa  251  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852101  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5590  alcohol dehydrogenase  37.39 
 
 
354 aa  249  7e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7070  alcohol dehydrogenase  36.96 
 
 
346 aa  245  6.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3165  alcohol dehydrogenase  37.61 
 
 
352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2145  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  37.97 
 
 
346 aa  240  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552645  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0125  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.95 
 
 
341 aa  238  9e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000121162  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1030  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.47 
 
 
346 aa  236  6e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0743662  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0246  alcohol dehydrogenase  39.24 
 
 
343 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000123303  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  36.81 
 
 
345 aa  232  6e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.92 
 
 
343 aa  227  2e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00243149  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1804  alcohol dehydrogenase  36.75 
 
 
349 aa  218  7.999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1530  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.91 
 
 
367 aa  212  7e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540116  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3405  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.41 
 
 
348 aa  209  5e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0198026  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.76 
 
 
346 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1113  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.26 
 
 
320 aa  194  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.94 
 
 
336 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.22 
 
 
344 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120973 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.65 
 
 
336 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0770  alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 
321 aa  182  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00613196  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0087  alcohol dehydrogenase  32.75 
 
 
325 aa  178  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2463  alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
338 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1144  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.95 
 
 
323 aa  171  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.129111 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  35.29 
 
 
338 aa  171  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1644  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
341 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1619  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
341 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0660  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
341 aa  168  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0565  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
341 aa  168  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678248  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1670  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
341 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2235  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
341 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.82 
 
 
342 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  33.06 
 
 
373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5628  L-threonine 3-dehydrogenase  33.13 
 
 
341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0490  alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 
341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283915  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  32.75 
 
 
340 aa  165  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0359  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.27 
 
 
366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  29.5 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.58 
 
 
373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  31.58 
 
 
373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  29.2 
 
 
341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0444  L-threonine 3-dehydrogenase  29.8 
 
 
344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  29.2 
 
 
341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  32.47 
 
 
344 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0503  alcohol dehydrogenase  30.25 
 
 
362 aa  162  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472686 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1743  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.05 
 
 
374 aa  162  9e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.789152  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  32.32 
 
 
336 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.59 
 
 
373 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  31.3 
 
 
373 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  28.91 
 
 
341 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2432  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.81 
 
 
363 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319398  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0239  alcohol dehydrogenase  30.66 
 
 
351 aa  161  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3723  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  31.25 
 
 
349 aa  160  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0233  alcohol dehydrogenase  30.66 
 
 
351 aa  161  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1079  alcohol dehydrogenase  29.67 
 
 
342 aa  161  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  28.91 
 
 
341 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3248  sorbitol dehydrogenase  30.29 
 
 
340 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0582225  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3233  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.41 
 
 
365 aa  159  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0992  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.61 
 
 
326 aa  159  6e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3786  alcohol dehydrogenase  31.09 
 
 
369 aa  159  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0107971 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2347  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.23 
 
 
341 aa  159  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.174722  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1744  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.09 
 
 
345 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.681848  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  32.15 
 
 
352 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03240  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  30.84 
 
 
358 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129511  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4579  alcohol dehydrogenase  29.44 
 
 
373 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02158  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_2G15930)  29.97 
 
 
353 aa  157  3e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.953823  normal  0.515496 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  31.1 
 
 
327 aa  157  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0887  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.53 
 
 
362 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0293  L-threonine 3-dehydrogenase  29.8 
 
 
347 aa  155  7e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3661  alcohol dehydrogenase  29.83 
 
 
340 aa  155  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.17 
 
 
340 aa  155  7e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4721  alcohol dehydrogenase  30.53 
 
 
362 aa  155  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.36355 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4198  alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 
362 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1010  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.23 
 
 
340 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0739  zinc-containing alcohol dehydrogenase; sorbitol dehydrogenase (L-iditol 2-dehydrogenase)  29.51 
 
 
340 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.725171  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  31.02 
 
 
373 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3550  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.53 
 
 
362 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5466  alcohol dehydrogenase  30.53 
 
 
362 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.0829425 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4817  alcohol dehydrogenase  30.53 
 
 
362 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.562057  normal  0.226619 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4595  hypothetical protein  30.42 
 
 
348 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0970  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.9 
 
 
345 aa  153  4e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0626  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.74 
 
 
348 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.122576  normal  0.0367599 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0021  Zn-binding dehydrogenase  30.97 
 
 
352 aa  152  8.999999999999999e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0554419  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0301  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.41 
 
 
430 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0487501  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22030  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  30.03 
 
 
375 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255526  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1195  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.41 
 
 
353 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184304  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0952  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.21 
 
 
359 aa  151  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000662515  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1924  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.41 
 
 
363 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1911  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.41 
 
 
363 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.197112  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0860  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.41 
 
 
363 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183529  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1639  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.41 
 
 
363 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.514454  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  30.31 
 
 
359 aa  151  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2072  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.41 
 
 
422 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.055624  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.25 
 
 
350 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1007  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  30.09 
 
 
351 aa  150  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0780  L-threonine 3-dehydrogenase  31.69 
 
 
348 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3142  alcohol dehydrogenase  33.06 
 
 
373 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>