More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0246 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0246  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
343 aa  683    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000123303  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  87.17 
 
 
343 aa  607  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00243149  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0125  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  84.16 
 
 
341 aa  577  1e-164  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000121162  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2145  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  43.44 
 
 
346 aa  239  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552645  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  42.03 
 
 
346 aa  239  5.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7070  alcohol dehydrogenase  40.58 
 
 
346 aa  239  6.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5268  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.32 
 
 
346 aa  238  9e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.42 
 
 
346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1218  alcohol dehydrogenase  38.92 
 
 
361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852101  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3256  alcohol dehydrogenase  39.24 
 
 
345 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5590  alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 
354 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4221  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.87 
 
 
346 aa  229  6e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.41128  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3165  alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 
352 aa  225  7e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3405  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.63 
 
 
348 aa  223  4e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0198026  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1804  alcohol dehydrogenase  37.71 
 
 
349 aa  212  7.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1530  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.65 
 
 
367 aa  210  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540116  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1030  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.76 
 
 
346 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0743662  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  35.94 
 
 
345 aa  192  8e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.35 
 
 
346 aa  189  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.68 
 
 
344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120973 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1113  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.39 
 
 
320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0087  alcohol dehydrogenase  35.17 
 
 
325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0770  alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
321 aa  172  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00613196  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1144  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.61 
 
 
323 aa  165  9e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.129111 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0992  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.11 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
341 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
341 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
341 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
341 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.68 
 
 
342 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.85 
 
 
341 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0154  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.05 
 
 
339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186872  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1170  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.11 
 
 
349 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  32.32 
 
 
356 aa  146  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0239  alcohol dehydrogenase  32.95 
 
 
351 aa  145  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0233  alcohol dehydrogenase  32.95 
 
 
351 aa  145  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.28 
 
 
338 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0329198 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1079  alcohol dehydrogenase  28.92 
 
 
342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.83 
 
 
344 aa  139  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  30.28 
 
 
336 aa  139  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  31.76 
 
 
337 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0537  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.13 
 
 
325 aa  138  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00294504  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5128  zinc-binding dehydrogenase  30.79 
 
 
337 aa  138  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00067  L-threonine 3-dehydrogenase  31.25 
 
 
341 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3230  alcohol dehydrogenase  32.01 
 
 
338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.6 
 
 
346 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1223  alcohol dehydrogenase  30.09 
 
 
335 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135954  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0021  Zn-binding dehydrogenase  31.6 
 
 
352 aa  135  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0554419  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1249  alcohol dehydrogenase  29.74 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257646  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6341  alcohol dehydrogenase  30.4 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00479428  normal  0.719872 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001213  L-threonine 3-dehydrogenase  30.56 
 
 
343 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2119  dehydrogenase starvation-sensing protein  28.27 
 
 
340 aa  132  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05001  L-threonine 3-dehydrogenase  30.56 
 
 
360 aa  132  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5476  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.7 
 
 
335 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3723  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  32.24 
 
 
349 aa  132  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3697  alcohol dehydrogenase  31.45 
 
 
340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587402 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0196  alcohol dehydrogenase  30.35 
 
 
338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.583804  normal  0.0665338 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0121  L-threonine 3-dehydrogenase  29.38 
 
 
341 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.13 
 
 
340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0102074  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4903  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.13 
 
 
340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363717  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04235  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  31.13 
 
 
340 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.767219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3639  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.13 
 
 
340 aa  130  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0065  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.31 
 
 
340 aa  130  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4590  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.13 
 
 
340 aa  130  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00423136  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04201  hypothetical protein  31.13 
 
 
340 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.774265  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5871  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.5 
 
 
340 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0100  L-threonine 3-dehydrogenase  29.62 
 
 
341 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.173553 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1417  sorbitol dehydrogenase  29.57 
 
 
347 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2463  alcohol dehydrogenase  31.1 
 
 
338 aa  129  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01743  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  29.57 
 
 
347 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.57 
 
 
347 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01731  hypothetical protein  29.57 
 
 
347 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0178  alcohol dehydrogenase  28.27 
 
 
336 aa  129  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0797  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.57 
 
 
338 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121673  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3710  L-threonine 3-dehydrogenase  29.55 
 
 
341 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187743  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1858  alcohol dehydrogenase  29.57 
 
 
347 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.368595  hitchhiker  0.0000214432 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0059  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.92 
 
 
340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4898  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.82 
 
 
340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0837  L-threonine 3-dehydrogenase  29.04 
 
 
343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178921  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0119  L-threonine 3-dehydrogenase  30.24 
 
 
341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  30.72 
 
 
339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.72 
 
 
339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1998  sorbitol dehydrogenase  29.57 
 
 
347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.329256  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  30.72 
 
 
339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  29.55 
 
 
341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1653  starvation sensing protein RspB  32.36 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00258422  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0953  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.74 
 
 
336 aa  127  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00776384  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  30.72 
 
 
339 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  31.9 
 
 
327 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  30.72 
 
 
339 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0449  L-threonine 3-dehydrogenase  29.46 
 
 
361 aa  127  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2347  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.82 
 
 
341 aa  126  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.174722  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  31.46 
 
 
344 aa  126  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1744  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.11 
 
 
345 aa  126  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.681848  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4973  L-threonine 3-dehydrogenase  32.89 
 
 
342 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.554494  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2498  sorbitol dehydrogenase  29.28 
 
 
347 aa  126  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503095  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0062  L-threonine 3-dehydrogenase  28.88 
 
 
340 aa  126  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  31.35 
 
 
341 aa  125  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1995  L-threonine 3-dehydrogenase  29.43 
 
 
348 aa  125  8.000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.271324  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3303  zinc-binding dehydrogenase family protein  32.03 
 
 
338 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0731443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>