More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1249 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5476  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  91.94 
 
 		 335 aa  642    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1223  alcohol dehydrogenase  98.21 
 
 		 335 aa  677    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135954  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1249  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 335 aa  688    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6469  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  77.08 
 
 		 345 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6704  alcohol dehydrogenase  77.08 
 
 		 345 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710863  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6310  alcohol dehydrogenase  76.79 
 
 		 345 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6341  alcohol dehydrogenase  77.22 
 
 		 336 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00479428  normal  0.719872 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2070  alcohol dehydrogenase  71.34 
 
 		 336 aa  500  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5128  zinc-binding dehydrogenase  55.52 
 
 		 337 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0178  alcohol dehydrogenase  53.73 
 
 		 336 aa  373  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1540  alcohol dehydrogenase  52.55 
 
 		 336 aa  356  3.9999999999999996e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.931266 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0797  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  48.66 
 
 		 338 aa  347  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121673  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0154  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.34 
 
 		 339 aa  345  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1608  putative Zn-dependent dehydrogenase  51.05 
 
 		 330 aa  341  9e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.587808  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  47.62 
 
 		 356 aa  341  1e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0262  alcohol dehydrogenase  51.05 
 
 		 327 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50.45 
 
 		 338 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0329198 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1736  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  50.3 
 
 		 349 aa  337  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0286  alcohol dehydrogenase  50.45 
 
 		 330 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5642  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.51 
 
 		 337 aa  332  4e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3230  alcohol dehydrogenase  49.85 
 
 		 338 aa  330  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2739  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.67 
 
 		 337 aa  322  8e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.112956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3317  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.37 
 
 		 338 aa  318  7e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  hitchhiker  0.0000240679 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1260  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.05 
 
 		 339 aa  301  8.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.785941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1421  alcohol dehydrogenase  44.54 
 
 		 343 aa  299  4e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0059  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.58 
 
 		 340 aa  279  6e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0065  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.09 
 
 		 340 aa  267  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  41.79 
 
 		 340 aa  263  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0102074  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3328  hypothetical protein  40.95 
 
 		 338 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.463233 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4903  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  41.79 
 
 		 340 aa  263  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3697  alcohol dehydrogenase  41.49 
 
 		 340 aa  263  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587402 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04235  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  41.79 
 
 		 340 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.767219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3639  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.79 
 
 		 340 aa  263  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04201  hypothetical protein  41.79 
 
 		 340 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.774265  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4590  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  41.79 
 
 		 340 aa  263  3e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00423136  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5871  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  41.79 
 
 		 340 aa  263  3e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  41.72 
 
 		 337 aa  262  4.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3303  zinc-binding dehydrogenase family protein  39.58 
 
 		 338 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0731443 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4898  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  41.49 
 
 		 340 aa  261  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3320  hypothetical protein  41.54 
 
 		 338 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.915678 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3425  hypothetical protein  41.25 
 
 		 338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.955308  hitchhiker  0.00600667 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3244  hypothetical protein  41.25 
 
 		 338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0577  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.17 
 
 		 342 aa  244  1.9999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.105265  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4706  alcohol dehydrogenase  39.94 
 
 		 341 aa  239  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.88 
 
 		 337 aa  205  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07150  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  39.3 
 
 		 340 aa  201  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439183  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4931  alcohol dehydrogenase  35.37 
 
 		 337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0021  Zn-binding dehydrogenase  31.27 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0554419  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3903  alcohol dehydrogenase  32.4 
 
 		 338 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  31.13 
 
 		 341 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  31.13 
 
 		 341 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  31.13 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  31.13 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.23 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  34.37 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  33.66 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  32.06 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.57 
 
 		 341 aa  161  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.87 
 
 		 342 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.13 
 
 		 333 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1614  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.58 
 
 		 338 aa  160  4e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000216473  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.59 
 
 		 344 aa  159  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2119  dehydrogenase starvation-sensing protein  31.97 
 
 		 340 aa  159  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0953  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.73 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00776384  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.29 
 
 		 340 aa  158  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2551  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.44 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163607  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3592  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.74 
 
 		 347 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.39 
 
 		 338 aa  155  7e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  32.54 
 
 		 346 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.17 
 
 		 351 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1608  putative dehydrogenase  30.94 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0584  putative dehydrogenase  31.63 
 
 		 343 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.24761  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1144  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.99 
 
 		 323 aa  149  8e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.129111 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2002  putative dehydrogenase  31.19 
 
 		 343 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0765  putative dehydrogenase  31.19 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0512  putative dehydrogenase  31.19 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4598  putative dehydrogenase  30.28 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1649  putative dehydrogenase  31.19 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0695  putative dehydrogenase  31.19 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2097  putative dehydrogenase  31.19 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  31.99 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1617  putative dehydrogenase  30.63 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  31.23 
 
 		 322 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.860675 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  31.99 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1666  putative dehydrogenase  30.99 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.747821  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1676  putative dehydrogenase  30.63 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.99 
 
 		 339 aa  147  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5131  putative dehydrogenase  30.58 
 
 		 343 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.869856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3875  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.51 
 
 		 344 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.177678  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3564  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 		 347 aa  145  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  30.1 
 
 		 337 aa  145  8.000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  31.68 
 
 		 339 aa  145  9e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2517  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.69 
 
 		 335 aa  145  9e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.06 
 
 		 340 aa  145  9e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.38 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  31.68 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  33.23 
 
 		 352 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  29.61 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  29.25 
 
 		 340 aa  143  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  31.68 
 
 		 339 aa  143  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>