More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0262 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1608  putative Zn-dependent dehydrogenase  99.69 
 
 
330 aa  659    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.587808  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0262  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
327 aa  662    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0286  alcohol dehydrogenase  91.13 
 
 
330 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3230  alcohol dehydrogenase  54.33 
 
 
338 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.9 
 
 
338 aa  362  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0329198 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1540  alcohol dehydrogenase  54.05 
 
 
336 aa  348  1e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.931266 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0154  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.12 
 
 
339 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186872  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1223  alcohol dehydrogenase  51.05 
 
 
335 aa  342  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135954  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1249  alcohol dehydrogenase  51.05 
 
 
335 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257646  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5476  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.55 
 
 
335 aa  333  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5128  zinc-binding dehydrogenase  50.45 
 
 
337 aa  330  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2070  alcohol dehydrogenase  50.89 
 
 
336 aa  329  3e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6469  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  49.4 
 
 
345 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6704  alcohol dehydrogenase  49.4 
 
 
345 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710863  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0178  alcohol dehydrogenase  50.6 
 
 
336 aa  323  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6310  alcohol dehydrogenase  49.25 
 
 
345 aa  322  8e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6341  alcohol dehydrogenase  48.8 
 
 
336 aa  318  9e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00479428  normal  0.719872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5642  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.7 
 
 
337 aa  296  5e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2739  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.7 
 
 
337 aa  294  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.112956  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  42.73 
 
 
356 aa  292  6e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0797  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  42.86 
 
 
338 aa  290  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121673  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3317  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.7 
 
 
338 aa  289  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  hitchhiker  0.0000240679 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1736  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  44.08 
 
 
349 aa  287  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1260  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.14 
 
 
339 aa  269  5e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.785941  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  39.94 
 
 
337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0059  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.81 
 
 
340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1421  alcohol dehydrogenase  40.18 
 
 
343 aa  253  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0065  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.13 
 
 
340 aa  251  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4590  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  38.81 
 
 
340 aa  238  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00423136  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04235  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  38.81 
 
 
340 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.767219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3639  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.81 
 
 
340 aa  238  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04201  hypothetical protein  38.81 
 
 
340 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.774265  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.41 
 
 
340 aa  237  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0102074  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4903  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.41 
 
 
340 aa  237  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363717  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4898  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  38.51 
 
 
340 aa  236  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3697  alcohol dehydrogenase  39.41 
 
 
340 aa  236  4e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587402 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5871  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  39.41 
 
 
340 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3328  hypothetical protein  37.69 
 
 
338 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.463233 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3320  hypothetical protein  38.28 
 
 
338 aa  215  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.915678 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3303  zinc-binding dehydrogenase family protein  35.99 
 
 
338 aa  215  8e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0731443 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3244  hypothetical protein  37.98 
 
 
338 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3425  hypothetical protein  37.69 
 
 
338 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.955308  hitchhiker  0.00600667 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0577  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.87 
 
 
342 aa  210  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.105265  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4706  alcohol dehydrogenase  36.16 
 
 
341 aa  205  8e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4931  alcohol dehydrogenase  34.73 
 
 
337 aa  189  5e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3903  alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
338 aa  166  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07150  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  34.42 
 
 
340 aa  166  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439183  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.27 
 
 
344 aa  165  9e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 
337 aa  163  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.7 
 
 
341 aa  160  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0765  putative dehydrogenase  33.02 
 
 
343 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0512  putative dehydrogenase  33.02 
 
 
343 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0584  putative dehydrogenase  32.62 
 
 
343 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.24761  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0695  putative dehydrogenase  33.02 
 
 
343 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2097  putative dehydrogenase  33.02 
 
 
343 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2002  putative dehydrogenase  33.02 
 
 
343 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1649  putative dehydrogenase  33.02 
 
 
343 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  30.18 
 
 
343 aa  153  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1933  putative dehydrogenase  30.18 
 
 
339 aa  153  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121666  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  30 
 
 
340 aa  152  8.999999999999999e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5131  putative dehydrogenase  31.56 
 
 
343 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.869856  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.98 
 
 
333 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4598  putative dehydrogenase  31.25 
 
 
343 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.94 
 
 
338 aa  150  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1614  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.65 
 
 
338 aa  149  8e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000216473  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  30.18 
 
 
339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.18 
 
 
339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  30.18 
 
 
339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0953  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.62 
 
 
336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00776384  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  30.18 
 
 
339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  30.18 
 
 
339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1676  putative dehydrogenase  29.29 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1617  putative dehydrogenase  29.29 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.7 
 
 
340 aa  147  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1608  putative dehydrogenase  29.41 
 
 
339 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0021  Zn-binding dehydrogenase  28.4 
 
 
352 aa  146  5e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0554419  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1666  putative dehydrogenase  29.29 
 
 
339 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.747821  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  29.88 
 
 
339 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.74 
 
 
340 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108984  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.85 
 
 
323 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  36.64 
 
 
341 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  36.64 
 
 
341 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  36.21 
 
 
341 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  36.21 
 
 
341 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  32.81 
 
 
339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3564  alcohol dehydrogenase  27.65 
 
 
347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  35.78 
 
 
341 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  31.27 
 
 
336 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2119  dehydrogenase starvation-sensing protein  32.09 
 
 
340 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1653  starvation sensing protein RspB  40 
 
 
288 aa  136  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00258422  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.59 
 
 
336 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2517  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.85 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.75 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0125  alcohol dehydrogenase  32.92 
 
 
350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0844378  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  31.33 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  29.54 
 
 
327 aa  134  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1794  alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
343 aa  132  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0373035  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0992  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28 
 
 
326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4137  alcohol dehydrogenase  33.11 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.31521  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>