More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1260 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1260  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 		 339 aa  697    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.785941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5642  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  73.67 
 
 		 337 aa  527  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2739  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  70.03 
 
 		 337 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.112956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3317  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  70.03 
 
 		 338 aa  504  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  hitchhiker  0.0000240679 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  57.27 
 
 		 356 aa  426  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0797  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  46.29 
 
 		 338 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121673  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6341  alcohol dehydrogenase  45.83 
 
 		 336 aa  330  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00479428  normal  0.719872 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1736  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  49.11 
 
 		 349 aa  329  4e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6310  alcohol dehydrogenase  45.24 
 
 		 345 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2070  alcohol dehydrogenase  46.59 
 
 		 336 aa  322  6e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5476  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.54 
 
 		 335 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6469  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  45.24 
 
 		 345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6704  alcohol dehydrogenase  45.24 
 
 		 345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710863  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1223  alcohol dehydrogenase  44.05 
 
 		 335 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135954  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1249  alcohol dehydrogenase  44.05 
 
 		 335 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1421  alcohol dehydrogenase  45.82 
 
 		 343 aa  311  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1540  alcohol dehydrogenase  41.92 
 
 		 336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.931266 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.87 
 
 		 338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0329198 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0178  alcohol dehydrogenase  42.73 
 
 		 336 aa  281  8.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0577  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.4 
 
 		 342 aa  280  3e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.105265  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0154  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.95 
 
 		 339 aa  278  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1608  putative Zn-dependent dehydrogenase  42.01 
 
 		 330 aa  277  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.587808  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3230  alcohol dehydrogenase  43.2 
 
 		 338 aa  275  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0262  alcohol dehydrogenase  42.14 
 
 		 327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5128  zinc-binding dehydrogenase  41.12 
 
 		 337 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0286  alcohol dehydrogenase  40.83 
 
 		 330 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  41.12 
 
 		 337 aa  270  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0065  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.76 
 
 		 340 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0059  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.46 
 
 		 340 aa  261  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04235  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  39.35 
 
 		 340 aa  260  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.767219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3639  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.35 
 
 		 340 aa  260  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04201  hypothetical protein  39.35 
 
 		 340 aa  260  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.774265  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4903  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.35 
 
 		 340 aa  260  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5871  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  39.35 
 
 		 340 aa  260  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4590  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.35 
 
 		 340 aa  260  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00423136  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.35 
 
 		 340 aa  260  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0102074  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3697  alcohol dehydrogenase  39.35 
 
 		 340 aa  260  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587402 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4898  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  39.05 
 
 		 340 aa  258  7e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4706  alcohol dehydrogenase  38.18 
 
 		 341 aa  239  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3328  hypothetical protein  37.35 
 
 		 338 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.463233 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3320  hypothetical protein  37.65 
 
 		 338 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.915678 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3303  zinc-binding dehydrogenase family protein  35.99 
 
 		 338 aa  228  9e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0731443 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3425  hypothetical protein  37.35 
 
 		 338 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.955308  hitchhiker  0.00600667 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3244  hypothetical protein  37.35 
 
 		 338 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0021  Zn-binding dehydrogenase  34.18 
 
 		 352 aa  210  3e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0554419  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07150  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  39.02 
 
 		 340 aa  193  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439183  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4931  alcohol dehydrogenase  32.82 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.16 
 
 		 342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3903  alcohol dehydrogenase  32 
 
 		 338 aa  179  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  33.03 
 
 		 341 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.46 
 
 		 337 aa  176  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.15 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5131  putative dehydrogenase  32.12 
 
 		 343 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.869856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4598  putative dehydrogenase  32.12 
 
 		 343 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.02 
 
 		 340 aa  160  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  32.23 
 
 		 340 aa  155  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  33.84 
 
 		 339 aa  155  8e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  30.64 
 
 		 340 aa  155  9e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  30.57 
 
 		 343 aa  152  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  33.54 
 
 		 339 aa  153  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  33.54 
 
 		 339 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  33.54 
 
 		 339 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.54 
 
 		 339 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.33 
 
 		 346 aa  149  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2235  alcohol dehydrogenase  31.79 
 
 		 340 aa  149  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000256926  hitchhiker  0.0000000000711864 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  33.23 
 
 		 339 aa  149  9e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2119  dehydrogenase starvation-sensing protein  30.79 
 
 		 340 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3564  alcohol dehydrogenase  31.78 
 
 		 347 aa  146  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2002  putative dehydrogenase  31.02 
 
 		 343 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.14 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  29.14 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  29.14 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.14 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.86 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1614  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.43 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000216473  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1666  putative dehydrogenase  30.75 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.747821  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  29.58 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.86 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.86 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.86 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  29.14 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0765  putative dehydrogenase  30.72 
 
 		 343 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0512  putative dehydrogenase  30.72 
 
 		 343 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1676  putative dehydrogenase  30.43 
 
 		 339 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1617  putative dehydrogenase  30.43 
 
 		 339 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1608  putative dehydrogenase  30.43 
 
 		 339 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1649  putative dehydrogenase  30.72 
 
 		 343 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0695  putative dehydrogenase  30.72 
 
 		 343 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2097  putative dehydrogenase  30.72 
 
 		 343 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0584  putative dehydrogenase  30.82 
 
 		 343 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.24761  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.86 
 
 		 350 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.86 
 
 		 350 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  28.86 
 
 		 350 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.57 
 
 		 346 aa  142  9e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1933  putative dehydrogenase  30.35 
 
 		 339 aa  142  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0788  alcohol dehydrogenase  31.93 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.690483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>