More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2235 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2235  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 340 aa  689    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000256926  hitchhiker  0.0000000000711864 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1874  GroES-related  43.82 
 
 		 335 aa  265  5.999999999999999e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335289  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0286  alcohol dehydrogenase  40.24 
 
 		 337 aa  250  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.425659  normal  0.323725 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0111  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.24 
 
 		 346 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.685432  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2276  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.85 
 
 		 388 aa  209  6e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1877  alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 		 364 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115652 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.28 
 
 		 387 aa  179  5.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5159  alcohol dehydrogenase  32.87 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.821329 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4773  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.87 
 
 		 338 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4859  alcohol dehydrogenase  32.87 
 
 		 338 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  34.47 
 
 		 350 aa  175  9e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1804  alcohol dehydrogenase  34.13 
 
 		 349 aa  172  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1421  alcohol dehydrogenase  35.22 
 
 		 343 aa  169  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0797  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.28 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121673  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3903  alcohol dehydrogenase  34.28 
 
 		 338 aa  162  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2325  alcohol dehydrogenase  29.47 
 
 		 385 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0569732  normal  0.0442784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.47 
 
 		 385 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.775062  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  32.11 
 
 		 363 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2333  alcohol dehydrogenase  29.47 
 
 		 385 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.255092 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.1 
 
 		 350 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  32.1 
 
 		 350 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  32.68 
 
 		 363 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.1 
 
 		 350 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.77 
 
 		 354 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  32.77 
 
 		 365 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  32.77 
 
 		 354 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  32.1 
 
 		 350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13758  dehydrogenase  29.89 
 
 		 397 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0782561 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  32.77 
 
 		 354 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0527  alcohol dehydrogenase  32.65 
 
 		 343 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361888  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  32.1 
 
 		 350 aa  156  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  32.1 
 
 		 350 aa  156  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.1 
 
 		 350 aa  156  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  32.77 
 
 		 354 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.39 
 
 		 350 aa  155  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.82 
 
 		 350 aa  155  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.82 
 
 		 350 aa  155  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.05 
 
 		 354 aa  155  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0638  alcohol dehydrogenase  32.65 
 
 		 343 aa  155  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0556  alcohol dehydrogenase  32.65 
 
 		 343 aa  155  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1668  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.65 
 
 		 343 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1641  alcohol dehydrogenase  32.65 
 
 		 343 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1692  alcohol dehydrogenase  32.65 
 
 		 343 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  33.33 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5456  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.36 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.077084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5853  alcohol dehydrogenase  32.36 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00833857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  32.58 
 
 		 360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3303  zinc-binding dehydrogenase family protein  33.77 
 
 		 338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0731443 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 		 364 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5642  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.42 
 
 		 337 aa  152  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1043  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 353 aa  152  8.999999999999999e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0537  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.23 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00294504  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4706  alcohol dehydrogenase  32.83 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1737  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.09 
 
 		 347 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2739  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.59 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.112956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5762  alcohol dehydrogenase  29.66 
 
 		 386 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117069  normal  0.104571 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0059  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.66 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  31.53 
 
 		 356 aa  150  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0310  alcohol dehydrogenase  32.69 
 
 		 358 aa  150  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.25 
 
 		 350 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 		 337 aa  149  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02158  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_2G15930)  29.75 
 
 		 353 aa  149  7e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.953823  normal  0.515496 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3714  alcohol dehydrogenase  32.69 
 
 		 358 aa  149  7e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2220  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.27 
 
 		 343 aa  149  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.135715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0305  alcohol dehydrogenase  33.15 
 
 		 358 aa  149  8e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0851572 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  32.96 
 
 		 355 aa  149  9e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  32.01 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.01 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  31.65 
 
 		 362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  32.01 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  32.01 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2119  dehydrogenase starvation-sensing protein  31.79 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000625  zinc-binding dehydrogenase  32.58 
 
 		 352 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  35.53 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.860675 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0619  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.29 
 
 		 339 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2268  alcohol dehydrogenase  32.43 
 
 		 358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.396502  hitchhiker  0.0088894 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4898  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.54 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  31.71 
 
 		 339 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  32.49 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.36 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  32.08 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  31.5 
 
 		 339 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.93 
 
 		 346 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.659297 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04235  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  33.54 
 
 		 340 aa  146  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.767219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3639  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.54 
 
 		 340 aa  146  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4590  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  33.54 
 
 		 340 aa  146  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00423136  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  31.37 
 
 		 362 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04201  hypothetical protein  33.54 
 
 		 340 aa  146  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.774265  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1540  alcohol dehydrogenase  32.38 
 
 		 336 aa  146  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.931266 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3317  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.26 
 
 		 338 aa  146  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  hitchhiker  0.0000240679 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  31.37 
 
 		 362 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4903  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  33.54 
 
 		 340 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  33.54 
 
 		 340 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0102074  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.91 
 
 		 340 aa  145  9e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  32.66 
 
 		 348 aa  145  9e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 		 346 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5131  putative dehydrogenase  31.69 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.869856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.02 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  32.36 
 
 		 337 aa  145  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>