More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2333 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2325  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
385 aa  767    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0569732  normal  0.0442784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  100 
 
 
385 aa  767    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.775062  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2333  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
385 aa  767    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.255092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5762  alcohol dehydrogenase  77.26 
 
 
386 aa  597  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117069  normal  0.104571 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13758  dehydrogenase  61.64 
 
 
397 aa  455  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0782561 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2276  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.35 
 
 
388 aa  434  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  55.09 
 
 
387 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1877  alcohol dehydrogenase  46.88 
 
 
364 aa  316  4e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.115652 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5159  alcohol dehydrogenase  41.35 
 
 
338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.821329 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4773  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.35 
 
 
338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4859  alcohol dehydrogenase  41.35 
 
 
338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000625  zinc-binding dehydrogenase  34.04 
 
 
352 aa  225  9e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0305  alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 
358 aa  219  7e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0851572 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0310  alcohol dehydrogenase  32.98 
 
 
358 aa  212  7e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3714  alcohol dehydrogenase  32.98 
 
 
358 aa  212  7e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7154  alcohol dehydrogenase  34.13 
 
 
351 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0462629  normal  0.0194652 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2235  alcohol dehydrogenase  29.47 
 
 
340 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000256926  hitchhiker  0.0000000000711864 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.55 
 
 
350 aa  143  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  34.55 
 
 
373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1874  GroES-related  29.33 
 
 
335 aa  136  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335289  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.33 
 
 
373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0111  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.8 
 
 
346 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.685432  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 
373 aa  132  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  33.6 
 
 
373 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.6 
 
 
373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  33.6 
 
 
373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  29.17 
 
 
350 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3324  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.28 
 
 
350 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0421123  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  28.54 
 
 
362 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  28.28 
 
 
362 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  28.28 
 
 
362 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0049  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.34 
 
 
350 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09288  conserved hypothetical protein  28.07 
 
 
382 aa  124  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.58 
 
 
350 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  27.58 
 
 
350 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.58 
 
 
350 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3142  alcohol dehydrogenase  34.29 
 
 
373 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.02 
 
 
350 aa  123  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  28.02 
 
 
350 aa  122  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  28.02 
 
 
350 aa  122  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.02 
 
 
350 aa  122  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2959  alcohol dehydrogenase  30.15 
 
 
373 aa  122  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.02 
 
 
350 aa  122  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.02 
 
 
350 aa  122  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00599  conserved hypothetical protein  29.72 
 
 
369 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.932146  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  28.02 
 
 
350 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  28.43 
 
 
354 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0286  alcohol dehydrogenase  29.37 
 
 
337 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.425659  normal  0.323725 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.93 
 
 
354 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  27.68 
 
 
365 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3661  alcohol dehydrogenase  27.65 
 
 
340 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.43 
 
 
354 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1010  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.37 
 
 
340 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  28.39 
 
 
364 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  28.18 
 
 
363 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0739  zinc-containing alcohol dehydrogenase; sorbitol dehydrogenase (L-iditol 2-dehydrogenase)  26.82 
 
 
340 aa  116  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.725171  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  28.17 
 
 
355 aa  116  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  28.18 
 
 
363 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  27.79 
 
 
354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  27.79 
 
 
354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.89 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.189858  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3300  alcohol dehydrogenase  30.67 
 
 
337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0880  alcohol dehydrogenase  32.39 
 
 
351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.173388  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4980  alcohol dehydrogenase  29.95 
 
 
357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.155342 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  25.32 
 
 
344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0357  zinc-dependent dehydrogenase  27.64 
 
 
349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0660  alcohol dehydrogenase  30.05 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2235  alcohol dehydrogenase  30.05 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  28.04 
 
 
360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0565  alcohol dehydrogenase  30.05 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678248  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1644  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.05 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1619  alcohol dehydrogenase  30.05 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1043  alcohol dehydrogenase  26.57 
 
 
353 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5628  L-threonine 3-dehydrogenase  30.05 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1670  alcohol dehydrogenase  30.05 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0490  alcohol dehydrogenase  30.05 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283915  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1092  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.56 
 
 
351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3248  sorbitol dehydrogenase  26.74 
 
 
340 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0582225  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0912  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  27.51 
 
 
349 aa  110  5e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00151014  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5030  zinc-binding dehydrogenase  29.64 
 
 
343 aa  109  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.959168  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.44 
 
 
341 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0784  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.75 
 
 
353 aa  108  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1003  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.46 
 
 
342 aa  106  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.124693 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2217  alcohol dehydrogenase  29.89 
 
 
357 aa  106  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1589  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.87 
 
 
341 aa  106  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1029  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.45 
 
 
356 aa  105  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432101  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5456  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.02 
 
 
343 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.077084  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  29.46 
 
 
352 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  28.14 
 
 
342 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5853  alcohol dehydrogenase  28.02 
 
 
343 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00833857  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02158  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_2G15930)  27.96 
 
 
353 aa  103  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.953823  normal  0.515496 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0948  putative L-idonate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  28.57 
 
 
344 aa  103  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0556  alcohol dehydrogenase  28.02 
 
 
343 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46957  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1668  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.02 
 
 
343 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1692  alcohol dehydrogenase  28.02 
 
 
343 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0527  alcohol dehydrogenase  28.02 
 
 
343 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361888  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0638  alcohol dehydrogenase  28.02 
 
 
343 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1641  alcohol dehydrogenase  28.02 
 
 
343 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1590  alcohol dehydrogenase  29.83 
 
 
342 aa  103  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00466455  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07590  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  29.9 
 
 
357 aa  103  6e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>